Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PGBD1Q96JS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
PGBD1Q96JS3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PGBD1Q96JS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PGBD1Q96JS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PGBD1Q96JS3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PGBD1Q96JS3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms