Protein–RNA interactions for Protein: Q96J84

KIRREL1, Kin of IRRE-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL1Q96J84 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KIRREL1Q96J84 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KIRREL1Q96J84 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
KIRREL1Q96J84 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KIRREL1Q96J84 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms