Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CENPNQ96H22 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CENPNQ96H22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CENPNQ96H22 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CENPNQ96H22 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms