Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIG3Q6UXM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRIG3Q6UXM1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRIG3Q6UXM1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRIG3Q6UXM1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRIG3Q6UXM1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms