Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6AP1Q15904 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP6AP1Q15904 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATP6AP1Q15904 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ATP6AP1Q15904 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ATP6AP1Q15904 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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