Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC16A1P53985 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC16A1P53985 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC16A1P53985 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms