Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACVR1BP36896 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACVR1BP36896 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ACVR1BP36896 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACVR1BP36896 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms