Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS4P35443 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS4P35443 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
THBS4P35443 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS4P35443 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS4P35443 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
THBS4P35443 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
THBS4P35443 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THBS4P35443 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THBS4P35443 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS4P35443 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS4P35443 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THBS4P35443 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS4P35443 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS4P35443 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS4P35443 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS4P35443 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS4P35443 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THBS4P35443 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THBS4P35443 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS4P35443 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS4P35443 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
THBS4P35443 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS4P35443 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS4P35443 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS4P35443 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS4P35443 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS4P35443 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THBS4P35443 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THBS4P35443 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
THBS4P35443 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THBS4P35443 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THBS4P35443 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THBS4P35443 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
THBS4P35443 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THBS4P35443 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22■■□□□ 1.11
THBS4P35443 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THBS4P35443 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS4P35443 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS4P35443 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THBS4P35443 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS4P35443 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS4P35443 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS4P35443 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS4P35443 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THBS4P35443 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS4P35443 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS4P35443 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS4P35443 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THBS4P35443 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS4P35443 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS4P35443 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS4P35443 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS4P35443 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
THBS4P35443 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS4P35443 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS4P35443 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
THBS4P35443 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS4P35443 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS4P35443 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS4P35443 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
THBS4P35443 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS4P35443 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS4P35443 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS4P35443 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
THBS4P35443 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THBS4P35443 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THBS4P35443 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THBS4P35443 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
THBS4P35443 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
THBS4P35443 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS4P35443 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS4P35443 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS4P35443 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS4P35443 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
THBS4P35443 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS4P35443 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS4P35443 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS4P35443 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS4P35443 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
THBS4P35443 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
THBS4P35443 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THBS4P35443 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
THBS4P35443 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
THBS4P35443 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms