Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
THBS4P35443 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
THBS4P35443 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
THBS4P35443 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
THBS4P35443 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
THBS4P35443 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
THBS4P35443 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
THBS4P35443 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
THBS4P35443 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
THBS4P35443 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
THBS4P35443 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
THBS4P35443 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
THBS4P35443 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
THBS4P35443 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
THBS4P35443 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THBS4P35443 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THBS4P35443 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THBS4P35443 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THBS4P35443 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
THBS4P35443 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
THBS4P35443 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THBS4P35443 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THBS4P35443 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THBS4P35443 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THBS4P35443 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
THBS4P35443 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THBS4P35443 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THBS4P35443 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THBS4P35443 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
THBS4P35443 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
THBS4P35443 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
THBS4P35443 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
THBS4P35443 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THBS4P35443 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
THBS4P35443 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
THBS4P35443 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
THBS4P35443 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
THBS4P35443 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
THBS4P35443 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
THBS4P35443 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THBS4P35443 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
THBS4P35443 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
THBS4P35443 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
THBS4P35443 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
THBS4P35443 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
THBS4P35443 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THBS4P35443 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
THBS4P35443 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
THBS4P35443 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
THBS4P35443 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
THBS4P35443 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
THBS4P35443 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
THBS4P35443 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
THBS4P35443 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
THBS4P35443 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
THBS4P35443 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
THBS4P35443 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THBS4P35443 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THBS4P35443 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THBS4P35443 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THBS4P35443 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THBS4P35443 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
THBS4P35443 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THBS4P35443 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THBS4P35443 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
THBS4P35443 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
THBS4P35443 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THBS4P35443 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
THBS4P35443 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
THBS4P35443 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
THBS4P35443 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THBS4P35443 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THBS4P35443 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
THBS4P35443 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
THBS4P35443 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THBS4P35443 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
THBS4P35443 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THBS4P35443 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THBS4P35443 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THBS4P35443 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
THBS4P35443 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THBS4P35443 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THBS4P35443 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THBS4P35443 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THBS4P35443 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THBS4P35443 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THBS4P35443 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THBS4P35443 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THBS4P35443 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THBS4P35443 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THBS4P35443 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THBS4P35443 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THBS4P35443 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THBS4P35443 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THBS4P35443 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THBS4P35443 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THBS4P35443 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THBS4P35443 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
THBS4P35443 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THBS4P35443 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms