Protein–RNA interactions for Protein: P12956

XRCC6, X-ray repair cross-complementing protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 609 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC6P12956 DNAJC3-201ENST00000376795 2273 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 UBE2I-214ENST00000566775 396 ntTSL 39.22□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 29.9
XRCC6P12956 PRSS21-206ENST00000574265 860 ntTSL 314.13□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 29.8
XRCC6P12956 PRSS21-209ENST00000575739 378 ntTSL 39.8□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 29.8
XRCC6P12956 WDR34-205ENST00000480613 739 ntTSL 326.11■■□□□ 1.774e-7■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 WDR34-202ENST00000419989 745 ntTSL 526.11■■□□□ 1.774e-7■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 WDR34-203ENST00000451652 1039 ntTSL 223.81■■□□□ 1.44e-7■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.38□□□□□ -0.756e-9■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 56.47□□□□□ -1.376e-9■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 HFM1-208ENST00000488023 1699 ntTSL 53.87□□□□□ -1.796e-9■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 HFM1-207ENST00000481900 2020 ntTSL 53.71□□□□□ -1.816e-9■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.146e-9■■■■■ 29.7
XRCC6P12956 ADAM15-226ENST00000527418 4508 ntTSL 224.8■■□□□ 1.566e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.146e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.916e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.886e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.786e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.766e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.746e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.616e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.66e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-227ENST00000529473 3016 ntTSL 1 (best)18.67■□□□□ 0.586e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-211ENST00000461564 2751 ntTSL 218.65■□□□□ 0.586e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.576e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.566e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-225ENST00000526491 3091 ntTSL 1 (best)18.39■□□□□ 0.546e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ADAM15-216ENST00000472434 2894 ntTSL 518.21■□□□□ 0.516e-6■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ICAM5-202ENST00000586004 567 ntTSL 422.53■■□□□ 1.26e-7■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 ICAM5-204ENST00000587398 624 ntTSL 220.81■□□□□ 0.926e-7■■■■■ 29.5
XRCC6P12956 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.467e-11■■■■■ 29.3
XRCC6P12956 HMGCR-202ENST00000343975 3681 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.967e-11■■■■■ 29.3
XRCC6P12956 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.977e-11■■■■■ 29.3
XRCC6P12956 HMGCR-204ENST00000504466 1107 ntTSL 25.95□□□□□ -1.467e-11■■■■■ 29.3
XRCC6P12956 CHFR-218ENST00000540963 875 ntTSL 229.71■■■□□ 2.356e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-215ENST00000537551 596 ntTSL 225.91■■□□□ 1.746e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.526e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 ACAD9-202ENST00000505192 1693 ntTSL 224.46■■□□□ 1.516e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 PIP5K1A-206ENST00000424999 567 ntTSL 424.01■■□□□ 1.436e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-212ENST00000536196 597 ntTSL 423.41■■□□□ 1.346e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-217ENST00000540537 913 ntTSL 323.35■■□□□ 1.336e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-209ENST00000535181 753 ntTSL 222.99■■□□□ 1.276e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.256e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.246e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 322.44■■□□□ 1.186e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.116e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.876e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 ACAD9-206ENST00000511227 2431 ntTSL 220.13■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.716e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.576e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 ACAD9-208ENST00000511526 1896 ntTSL 1 (best)18.32■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-202ENST00000315585 2446 ntTSL 218.17■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.476e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 ACAD9-204ENST00000505867 2401 ntTSL 217.88■□□□□ 0.456e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-206ENST00000578201 1972 ntTSL 517.22■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-211ENST00000580078 816 ntTSL 216.98■□□□□ 0.316e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 416.95■□□□□ 0.36e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 NXN-209ENST00000575455 914 ntTSL 1 (best)15.62■□□□□ 0.096e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.076e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 ACAD9-205ENST00000508971 1872 ntTSL 515.1■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.026e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-221ENST00000542714 542 ntTSL 414.85□□□□□ -0.036e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 NXN-212ENST00000577098 659 ntTSL 314.45□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 513.79□□□□□ -0.26e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-201ENST00000266880 11133 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 SLC7A6-202ENST00000379152 5074 ntTSL 1 (best)10.84□□□□□ -0.676e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 NXN-208ENST00000575171 544 ntTSL 210.77□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 CHFR-220ENST00000541817 758 ntTSL 510.57□□□□□ -0.726e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 RECQL5-203ENST00000420326 3710 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.736e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 SLC7A6-201ENST00000219343 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.856e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 NXN-205ENST00000571338 586 ntTSL 49.2□□□□□ -0.946e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.16e-7■■■■■ 28.8
XRCC6P12956 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.018e-10■■■■■ 28.5
XRCC6P12956 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.068e-10■■■■■ 28.5
XRCC6P12956 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.027e-31■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.77e-31■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.127e-31■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 529.09■■■□□ 2.253e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 524.86■■□□□ 1.573e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 524.86■■□□□ 1.573e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 522.5■■□□□ 1.193e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 522.27■■□□□ 1.163e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.833e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.423e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.323e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.253e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.093e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.083e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.053e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.083e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-221ENST00000630607 1873 ntTSL 39.42□□□□□ -0.93e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.33e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.443e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 34.61□□□□□ -1.673e-10■■■■■ 28.4
XRCC6P12956 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.733e-10■■■■■ 28.4
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