RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C GPT2P36148 743 aa8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C RFC1P38630 861 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C VPS45P38932 577 aa8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C YGL039WP53183 348 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C DAK1P54838 584 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C YMR321CQ04898 105 aa8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C TRM11Q12463 433 aa8.18□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data8.17□□□□□ -1.1not detected
SPE3YPR069C RPT6Q01939 405 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C UTP4Q06679 776 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C RTP1Q12751 981 aa8.17□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C RPL8BP29453 256 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C REG2P38232 338 aa8.15□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data8.15□□□□□ -1.1not detected
SPE3YPR069C FOL2P51601 243 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C MYO5Q04439 1219 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
SPE3YPR069C PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data8.14□□□□□ -1.11not detected
SPE3YPR069C SNA3P14359 133 aa8.14□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C LSB1P53281 241 aa8.14□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C SUE1Q06524 206 aa8.14□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C RIM20Q12033 661 aa8.14□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C SRP54P20424 541 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C MAK31P23059 88 aa8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data8.13□□□□□ -1.11not detected
SPE3YPR069C SEC20P28791 383 aa8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C LIF1P53150 421 aa8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C HDA1P53973 706 aa8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C NKP2Q06162 153 aa8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C YDR461C-AQ2V2P7 80 aa8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C IRE1P32361 1115 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C RER2P35196 286 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C FLR1P38124 548 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C POA1P38218 177 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C JHD1P40034 492 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C RSC8P43609 557 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C FMS1P50264 508 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C PTA1Q01329 785 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C YML020WQ03722 664 aa8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C UGA4P32837 571 aa8.11□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C AAP1P37898 856 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C BRL1P38770 471 aa8.11□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C MDM1Q01846 1127 aa8.11□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C ESF1Q06344 628 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C RAD50P12753 1312 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C DUR3P33413 735 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C NDT80P38830 627 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C YHR131CP38835 850 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C ALG2P43636 503 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C VPS72Q03388 795 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C MSC2Q03455 724 aa8.1□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C MAS2P11914 482 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C CDC27P38042 758 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C CSM2P40465 213 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C CTR1P49573 406 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C AZR1P50080 613 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C MCM6P53091 1017 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C TFC6Q06339 672 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C DSE3Q08729 430 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C RKM4Q12504 494 aa8.09□□□□□ -1.11
SPE3YPR069C GUA1P38625 525 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C SGM1P47166 707 aa8.08□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C ATG11Q12527 1178 aa8.08□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C VAS1P07806 1104 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C AFT1P22149 690 aa8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C ALD5P40047 520 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C TPM2P40414 161 aa8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C YLR422WQ06409 1932 aa8.07□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C TPM1P17536 199 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C PAN5P38787 379 aa8.06□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C YNL115CP53925 644 aa8.06□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C FAB1P34756 2278 aa8.06□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C SWI6P09959 803 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C KIN82P25341 720 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C PEP3P27801 918 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C TVP23P38962 199 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C HMF1P40037 129 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C YGR035CP53222 116 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C YNR014WP53719 212 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C EST2Q06163 884 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C YLL058WQ12198 575 aa8.05□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C RNR3P21672 869 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C CAD1P24813 409 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C PWP2P25635 923 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C RME1P32338 300 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C IMP2'P32351 346 aa8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C UBP15P50101 1230 aa8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C YOR111WQ99210 232 aa8.04□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C TVP38P36164 337 aa8.03□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C SPO74P45819 413 aa8.03□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C WHI4Q07655 649 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
SPE3YPR069C FUB1P25659 250 aa8.02□□□□□ -1.13
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