Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.45■■□□□ 1.34
DSE3Q08729 NSR1YGR159C 1245 nt23.16■■□□□ 1.3
DSE3Q08729 NOP1YDL014W 984 nt22.79■■□□□ 1.24
DSE3Q08729 YKL036CYKL036C 393 nt21.16■□□□□ 0.98
DSE3Q08729 MDJ1YFL016C 1536 nt20.51■□□□□ 0.87
DSE3Q08729 Q0297Q0297 156 nt19.99■□□□□ 0.79
DSE3Q08729 SRX1YKL086W 384 nt19.93■□□□□ 0.78
DSE3Q08729 YJL027CYJL027C 417 nt19.8■□□□□ 0.76
DSE3Q08729 SCS3YGL126W 1143 nt19.33■□□□□ 0.68
DSE3Q08729 YCR051WYCR051W 669 nt18.96■□□□□ 0.63
DSE3Q08729 YOL085CYOL085C 342 nt18.35■□□□□ 0.53
DSE3Q08729 DBP2YNL112W 1641 nt18.17■□□□□ 0.5
DSE3Q08729 PKP1YIL042C 1185 nt18.11■□□□□ 0.49
DSE3Q08729 RPP1BYDL130W 321 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.95■□□□□ 0.46
DSE3Q08729 CCC1YLR220W 969 nt17.85■□□□□ 0.45
DSE3Q08729 YBR190WYBR190W 312 nt17.4■□□□□ 0.38
DSE3Q08729 ATS1YAL020C 1002 nt17.32■□□□□ 0.36
DSE3Q08729 SCJ1YMR214W 1134 nt17.2■□□□□ 0.34
DSE3Q08729 PET122YER153C 765 nt17.17■□□□□ 0.34
DSE3Q08729 RVS167YDR388W 1449 nt17.08■□□□□ 0.32
DSE3Q08729 RTC3YHR087W 336 nt17.08■□□□□ 0.32
DSE3Q08729 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.04■□□□□ 0.32
DSE3Q08729 SCR1SCR1 522 nt16.98■□□□□ 0.31
DSE3Q08729 RRN5YLR141W 1092 nt16.71■□□□□ 0.27
DSE3Q08729 SHR5YOL110W 714 nt16.52■□□□□ 0.24
DSE3Q08729 YDJ1YNL064C 1230 nt16.44■□□□□ 0.22
DSE3Q08729 RSB1YOR049C 1065 nt16.38■□□□□ 0.21
DSE3Q08729 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.35■□□□□ 0.21
DSE3Q08729 GAR1YHR089C 618 nt16.13■□□□□ 0.17
DSE3Q08729 DEP1YAL013W 1218 nt16.09■□□□□ 0.17
DSE3Q08729 URN1YPR152C 1398 nt16.02■□□□□ 0.16
DSE3Q08729 PST2YDR032C 597 nt16.02■□□□□ 0.16
DSE3Q08729 YNL208WYNL208W 600 nt15.78■□□□□ 0.12
DSE3Q08729 RPN10YHR200W 807 nt15.75■□□□□ 0.11
DSE3Q08729 OPI9YLR338W 858 nt15.73■□□□□ 0.11
DSE3Q08729 PUT4YOR348C 1884 nt15.73■□□□□ 0.11
DSE3Q08729 SAH1YER043C 1350 nt15.65■□□□□ 0.1
DSE3Q08729 TIR1YER011W 765 nt15.55■□□□□ 0.08
DSE3Q08729 ARE1YCR048W 1833 nt15.49■□□□□ 0.07
DSE3Q08729 YKL097CYKL097C 411 nt15.44■□□□□ 0.06
DSE3Q08729 SSA1YAL005C 1929 nt15.37■□□□□ 0.05
DSE3Q08729 SHU1YHL006C 453 nt15.36■□□□□ 0.05
DSE3Q08729 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.3■□□□□ 0.04
DSE3Q08729 POA1YBR022W 534 nt15.3■□□□□ 0.04
DSE3Q08729 YJR018WYJR018W 363 nt15.28■□□□□ 0.04
DSE3Q08729 PUN1YLR414C 792 nt15.26■□□□□ 0.03
DSE3Q08729 SRB2YHR041C 633 nt15.17■□□□□ 0.02
DSE3Q08729 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.14■□□□□ 0.01
DSE3Q08729 PTC2YER089C 1395 nt15.11■□□□□ 0.01
DSE3Q08729 YJR120WYJR120W 351 nt15.08■□□□□ 0
DSE3Q08729 BUD23YCR047C 828 nt14.99□□□□□ -0.01
DSE3Q08729 RPP2BYDR382W 333 nt14.98□□□□□ -0.01
DSE3Q08729 WWM1YFL010C 636 nt14.92□□□□□ -0.02
DSE3Q08729 BSC6YOL137W 1494 nt14.91□□□□□ -0.02
DSE3Q08729 NAB2YGL122C 1578 nt14.85□□□□□ -0.03
DSE3Q08729 YOR139CYOR139C 393 nt14.83□□□□□ -0.04
DSE3Q08729 YGR021WYGR021W 873 nt14.79□□□□□ -0.04
DSE3Q08729 HOM6YJR139C 1080 nt14.79□□□□□ -0.04
DSE3Q08729 MNP1YGL068W 585 nt14.77□□□□□ -0.05
DSE3Q08729 FPR4YLR449W 1179 nt14.72□□□□□ -0.05
DSE3Q08729 INM2YDR287W 879 nt14.7□□□□□ -0.06
DSE3Q08729 BDH2YAL061W 1254 nt14.7□□□□□ -0.06
DSE3Q08729 DAL1YIR027C 1383 nt14.68□□□□□ -0.06
DSE3Q08729 NPL3YDR432W 1245 nt14.66□□□□□ -0.06
DSE3Q08729 FIS1YIL065C 468 nt14.65□□□□□ -0.06
DSE3Q08729 SSA3YBL075C 1950 nt14.65□□□□□ -0.06
DSE3Q08729 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.61□□□□□ -0.07
DSE3Q08729 YBL100CYBL100C 315 nt14.6□□□□□ -0.07
DSE3Q08729 RKM5YLR137W 1104 nt14.57□□□□□ -0.08
DSE3Q08729 PHO4YFR034C 939 nt14.55□□□□□ -0.08
DSE3Q08729 LSM3YLR438C-A 270 nt14.52□□□□□ -0.09
DSE3Q08729 YOL037CYOL037C 354 nt14.49□□□□□ -0.09
DSE3Q08729 FUN26YAL022C 1554 nt14.43□□□□□ -0.1
DSE3Q08729 TRM9YML014W 840 nt14.43□□□□□ -0.1
DSE3Q08729 CCT6YDR188W 1641 nt14.24□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.24□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.24□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.24□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.24□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.24□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 YPS1YLR120C 1710 nt14.21□□□□□ -0.13
DSE3Q08729 ALF1YNL148C 765 nt14.2□□□□□ -0.14
DSE3Q08729 YLR281CYLR281C 468 nt14.19□□□□□ -0.14
DSE3Q08729 WHI5YOR083W 888 nt14.15□□□□□ -0.14
DSE3Q08729 YDR095CYDR095C 411 nt14.14□□□□□ -0.15
DSE3Q08729 PUS2YGL063W 1113 nt14.13□□□□□ -0.15
DSE3Q08729 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.1□□□□□ -0.15
DSE3Q08729 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.1□□□□□ -0.15
DSE3Q08729 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.08□□□□□ -0.16
DSE3Q08729 SPT5YML010W 3192 nt14.06□□□□□ -0.16
DSE3Q08729 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.03□□□□□ -0.16
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