RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SPE3YPR069C INO80P53115 1489 aa14.95□□□□□ -0.02
SPE3YPR069C SWR1Q05471 1514 aa14.33□□□□□ -0.12
SPE3YPR069C DNA2P38859 1522 aa14.3□□□□□ -0.12
SPE3YPR069C TY1B-DR4Q07793 1604 aa14.3□□□□□ -0.12
SPE3YPR069C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
SPE3YPR069C KOG1P38873 1557 aa14.15□□□□□ -0.14
SPE3YPR069C SGS1P35187 1447 aa13.96□□□□□ -0.18
SPE3YPR069C HSL1P34244 1518 aa13.73□□□□□ -0.21
SPE3YPR069C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
SPE3YPR069C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
SPE3YPR069C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SPE3YPR069C HIR3P47171 1648 aa13.42□□□□□ -0.26
SPE3YPR069C THO2P53552 1597 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SPE3YPR069C ECM5Q03214 1411 aa13.34□□□□□ -0.27
SPE3YPR069C BUD4P47136 1447 aa13.28□□□□□ -0.28
SPE3YPR069C MDS3P53094 1487 aa13.16□□□□□ -0.3
SPE3YPR069C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SPE3YPR069C PEP1P32319 1579 aa13.09□□□□□ -0.31
SPE3YPR069C ATG2P53855 1592 aa13.01□□□□□ -0.33
SPE3YPR069C REV3P14284 1504 aa12.93□□□□□ -0.34
SPE3YPR069C MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
SPE3YPR069C SSN2P38931 1420 aa12.86□□□□□ -0.35
SPE3YPR069C BPT1P14772 1559 aa12.83□□□□□ -0.36
SPE3YPR069C SIN3P22579 1536 aa12.83□□□□□ -0.36
SPE3YPR069C SSK2P53599 1579 aa12.78□□□□□ -0.36
SPE3YPR069C ESP1Q03018 1630 aa12.66□□□□□ -0.38
SPE3YPR069C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SPE3YPR069C TAF2P23255 1407 aa12.62□□□□□ -0.39
SPE3YPR069C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
SPE3YPR069C UFD4P33202 1483 aa12.47□□□□□ -0.41
SPE3YPR069C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
SPE3YPR069C YPK9Q12697 1472 aa12.45□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C SCC2Q04002 1493 aa12.44□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-FP0CX63 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-CP25384 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-DR2Q03494 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY1B-DR1Q03855 1755 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-OR1Q12113 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-DR1Q12472 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY2B-OR2Q12501 1770 aa12.41□□□□□ -0.42
SPE3YPR069C TY1B-BRQ12193 1756 aa12.37□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C TY1B-GR3Q12316 1755 aa12.37□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C TY1B-ORQ92393 1755 aa12.37□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C RPO31P04051 1460 aa12.36□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C CDC25P04821 1589 aa12.35□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
SPE3YPR069C CHD1P32657 1468 aa12.29□□□□□ -0.44
SPE3YPR069C DNF1P32660 1571 aa12.27□□□□□ -0.44
SPE3YPR069C MET5P47169 1442 aa12.27□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY2B-BQ12491 1770 aa12.26□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-HO13535 1793 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-JR1P47098 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-ER1Q03612 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-GR2Q12269 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-OLQ12273 1755 aa12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C TY1B-DR3Q99231 1755 aa12.23□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C RPA190P10964 1664 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
SPE3YPR069C RKR1Q04781 1562 aa12.19□□□□□ -0.46
SPE3YPR069C PAN1P32521 1480 aa12.19□□□□□ -0.46
SPE3YPR069C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
SPE3YPR069C LTE1P07866 1435 aa12.11□□□□□ -0.47
SPE3YPR069C BNI1P41832 1953 aa12.1□□□□□ -0.47
SPE3YPR069C POL1P13382 1468 aa12.03□□□□□ -0.48
SPE3YPR069C MMS22Q06164 1454 aa12.02□□□□□ -0.48
SPE3YPR069C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C YRF1-1P0CX20 1796 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C YRF1-5P0CX21 1796 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C YRF1-8P0CX22 1796 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-ER2Q03619 1755 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-MR1Q04214 1755 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-NL1Q12112 1755 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-GR1Q12141 1755 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C TY1B-BLQ12490 1755 aa12□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C GEA2P39993 1459 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
SPE3YPR069C MIF2P35201 549 aa11.95□□□□□ -0.5
SPE3YPR069C TRM732Q03496 1420 aa11.94□□□□□ -0.5
SPE3YPR069C SMC4Q12267 1418 aa11.94□□□□□ -0.5
SPE3YPR069C YOR1P53049 1477 aa11.93□□□□□ -0.5
SPE3YPR069C NTE1Q04958 1679 aa11.93□□□□□ -0.5
SPE3YPR069C RPO21P04050 1733 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPE3YPR069C STU1P38198 1513 aa11.88□□□□□ -0.51
SPE3YPR069C SPP41P38904 1435 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms