Protein–RNA interactions for Protein: P38962

TVP23, Golgi apparatus membrane protein TVP23, yeastyeast

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TVP23P38962 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.39■■□□□ 1.17
TVP23P38962 NOP1YDL014W 984 nt21.88■■□□□ 1.09
TVP23P38962 NSR1YGR159C 1245 nt21.83■■□□□ 1.09
TVP23P38962 YKL036CYKL036C 393 nt20.66■□□□□ 0.9
TVP23P38962 YJL027CYJL027C 417 nt19.37■□□□□ 0.69
TVP23P38962 Q0297Q0297 156 nt19.35■□□□□ 0.69
TVP23P38962 SRX1YKL086W 384 nt19.17■□□□□ 0.66
TVP23P38962 SCS3YGL126W 1143 nt19.06■□□□□ 0.64
TVP23P38962 MDJ1YFL016C 1536 nt19.03■□□□□ 0.64
TVP23P38962 YCR051WYCR051W 669 nt18.23■□□□□ 0.51
TVP23P38962 YOL085CYOL085C 342 nt17.91■□□□□ 0.46
TVP23P38962 PKP1YIL042C 1185 nt17.62■□□□□ 0.41
TVP23P38962 SCJ1YMR214W 1134 nt17.38■□□□□ 0.37
TVP23P38962 RPP1BYDL130W 321 nt17.36■□□□□ 0.37
TVP23P38962 ATS1YAL020C 1002 nt17.17■□□□□ 0.34
TVP23P38962 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.08■□□□□ 0.32
TVP23P38962 DBP2YNL112W 1641 nt17.03■□□□□ 0.32
TVP23P38962 CCC1YLR220W 969 nt16.94■□□□□ 0.3
TVP23P38962 PET122YER153C 765 nt16.58■□□□□ 0.24
TVP23P38962 SCR1SCR1 522 nt16.44■□□□□ 0.22
TVP23P38962 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.32■□□□□ 0.2
TVP23P38962 RRN5YLR141W 1092 nt16.15■□□□□ 0.18
TVP23P38962 YBR190WYBR190W 312 nt16.05■□□□□ 0.16
TVP23P38962 RVS167YDR388W 1449 nt16.01■□□□□ 0.15
TVP23P38962 RSB1YOR049C 1065 nt15.92■□□□□ 0.14
TVP23P38962 RTC3YHR087W 336 nt15.87■□□□□ 0.13
TVP23P38962 PST2YDR032C 597 nt15.84■□□□□ 0.13
TVP23P38962 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.83■□□□□ 0.12
TVP23P38962 YDJ1YNL064C 1230 nt15.76■□□□□ 0.11
TVP23P38962 SHR5YOL110W 714 nt15.59■□□□□ 0.09
TVP23P38962 YKL097CYKL097C 411 nt15.41■□□□□ 0.06
TVP23P38962 GAR1YHR089C 618 nt15.37■□□□□ 0.05
TVP23P38962 SHU1YHL006C 453 nt15.11■□□□□ 0.01
TVP23P38962 DEP1YAL013W 1218 nt15.07■□□□□ 0
TVP23P38962 URN1YPR152C 1398 nt14.91□□□□□ -0.02
TVP23P38962 TIR1YER011W 765 nt14.82□□□□□ -0.04
TVP23P38962 YNL208WYNL208W 600 nt14.81□□□□□ -0.04
TVP23P38962 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.77□□□□□ -0.05
TVP23P38962 YOR139CYOR139C 393 nt14.77□□□□□ -0.05
TVP23P38962 RPN10YHR200W 807 nt14.72□□□□□ -0.05
TVP23P38962 OPI9YLR338W 858 nt14.59□□□□□ -0.07
TVP23P38962 SSA1YAL005C 1929 nt14.58□□□□□ -0.08
TVP23P38962 SRB2YHR041C 633 nt14.5□□□□□ -0.09
TVP23P38962 NPL3YDR432W 1245 nt14.48□□□□□ -0.09
TVP23P38962 SAH1YER043C 1350 nt14.41□□□□□ -0.1
TVP23P38962 MNP1YGL068W 585 nt14.31□□□□□ -0.12
TVP23P38962 WWM1YFL010C 636 nt14.28□□□□□ -0.12
TVP23P38962 HOM6YJR139C 1080 nt14.28□□□□□ -0.12
TVP23P38962 PUT4YOR348C 1884 nt14.27□□□□□ -0.13
TVP23P38962 YGR021WYGR021W 873 nt14.25□□□□□ -0.13
TVP23P38962 YJR018WYJR018W 363 nt14.25□□□□□ -0.13
TVP23P38962 YJR120WYJR120W 351 nt14.19□□□□□ -0.14
TVP23P38962 YOL037CYOL037C 354 nt14.17□□□□□ -0.14
TVP23P38962 ARE1YCR048W 1833 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP23P38962 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP23P38962 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP23P38962 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP23P38962 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP23P38962 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.16□□□□□ -0.14
TVP23P38962 PUN1YLR414C 792 nt14.14□□□□□ -0.15
TVP23P38962 RKM5YLR137W 1104 nt14.06□□□□□ -0.16
TVP23P38962 RPP2BYDR382W 333 nt14.03□□□□□ -0.16
TVP23P38962 SSA3YBL075C 1950 nt13.98□□□□□ -0.17
TVP23P38962 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.98□□□□□ -0.17
TVP23P38962 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.96□□□□□ -0.17
TVP23P38962 PTC2YER089C 1395 nt13.93□□□□□ -0.18
TVP23P38962 PUS2YGL063W 1113 nt13.88□□□□□ -0.19
TVP23P38962 BDH2YAL061W 1254 nt13.87□□□□□ -0.19
TVP23P38962 POA1YBR022W 534 nt13.87□□□□□ -0.19
TVP23P38962 YLR281CYLR281C 468 nt13.85□□□□□ -0.19
TVP23P38962 MOT3YMR070W 1473 nt13.77□□□□□ -0.21
TVP23P38962 LSM3YLR438C-A 270 nt13.75□□□□□ -0.21
TVP23P38962 WHI5YOR083W 888 nt13.75□□□□□ -0.21
TVP23P38962 BUD23YCR047C 828 nt13.67□□□□□ -0.22
TVP23P38962 INM2YDR287W 879 nt13.65□□□□□ -0.22
TVP23P38962 NAB2YGL122C 1578 nt13.65□□□□□ -0.22
TVP23P38962 YBL100CYBL100C 315 nt13.61□□□□□ -0.23
TVP23P38962 YPR011CYPR011C 981 nt13.59□□□□□ -0.23
TVP23P38962 DAL1YIR027C 1383 nt13.58□□□□□ -0.24
TVP23P38962 FPR4YLR449W 1179 nt13.57□□□□□ -0.24
TVP23P38962 FIS1YIL065C 468 nt13.55□□□□□ -0.24
TVP23P38962 FMP45YDL222C 930 nt13.52□□□□□ -0.25
TVP23P38962 TRM9YML014W 840 nt13.52□□□□□ -0.25
TVP23P38962 YLR236CYLR236C 324 nt13.49□□□□□ -0.25
TVP23P38962 BSC6YOL137W 1494 nt13.48□□□□□ -0.25
TVP23P38962 DSK2YMR276W 1122 nt13.48□□□□□ -0.25
TVP23P38962 FUN26YAL022C 1554 nt13.48□□□□□ -0.25
TVP23P38962 PHO4YFR034C 939 nt13.46□□□□□ -0.25
TVP23P38962 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.41□□□□□ -0.26
TVP23P38962 YCH1YGR203W 447 nt13.4□□□□□ -0.26
TVP23P38962 CCT6YDR188W 1641 nt13.36□□□□□ -0.27
TVP23P38962 IMP2'YIL154C 1041 nt13.36□□□□□ -0.27
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