Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.68■■□□□ 1.22
RTP1Q12751 NOP1YDL014W 984 nt22.29■■□□□ 1.16
RTP1Q12751 NSR1YGR159C 1245 nt22.15■■□□□ 1.14
RTP1Q12751 YKL036CYKL036C 393 nt20.99■□□□□ 0.95
RTP1Q12751 YJL027CYJL027C 417 nt19.68■□□□□ 0.74
RTP1Q12751 Q0297Q0297 156 nt19.64■□□□□ 0.73
RTP1Q12751 SRX1YKL086W 384 nt19.46■□□□□ 0.71
RTP1Q12751 SCS3YGL126W 1143 nt19.31■□□□□ 0.68
RTP1Q12751 MDJ1YFL016C 1536 nt19.17■□□□□ 0.66
RTP1Q12751 YCR051WYCR051W 669 nt18.49■□□□□ 0.55
RTP1Q12751 YOL085CYOL085C 342 nt18.15■□□□□ 0.5
RTP1Q12751 PKP1YIL042C 1185 nt17.8■□□□□ 0.44
RTP1Q12751 SCJ1YMR214W 1134 nt17.76■□□□□ 0.43
RTP1Q12751 RPP1BYDL130W 321 nt17.63■□□□□ 0.41
RTP1Q12751 ATS1YAL020C 1002 nt17.42■□□□□ 0.38
RTP1Q12751 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.29■□□□□ 0.36
RTP1Q12751 DBP2YNL112W 1641 nt17.14■□□□□ 0.33
RTP1Q12751 CCC1YLR220W 969 nt17.12■□□□□ 0.33
RTP1Q12751 PET122YER153C 765 nt16.76■□□□□ 0.27
RTP1Q12751 SCR1SCR1 522 nt16.76■□□□□ 0.27
RTP1Q12751 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.52■□□□□ 0.24
RTP1Q12751 RRN5YLR141W 1092 nt16.33■□□□□ 0.2
RTP1Q12751 RVS167YDR388W 1449 nt16.3■□□□□ 0.2
RTP1Q12751 YBR190WYBR190W 312 nt16.26■□□□□ 0.19
RTP1Q12751 RSB1YOR049C 1065 nt16.16■□□□□ 0.18
RTP1Q12751 RTC3YHR087W 336 nt16.12■□□□□ 0.17
RTP1Q12751 PST2YDR032C 597 nt16.05■□□□□ 0.16
RTP1Q12751 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.01■□□□□ 0.15
RTP1Q12751 YDJ1YNL064C 1230 nt16■□□□□ 0.15
RTP1Q12751 SHR5YOL110W 714 nt15.83■□□□□ 0.12
RTP1Q12751 YKL097CYKL097C 411 nt15.69■□□□□ 0.1
RTP1Q12751 GAR1YHR089C 618 nt15.55■□□□□ 0.08
RTP1Q12751 SSA3YBL075C 1950 nt15.34■□□□□ 0.05
RTP1Q12751 SHU1YHL006C 453 nt15.27■□□□□ 0.04
RTP1Q12751 DEP1YAL013W 1218 nt15.19■□□□□ 0.02
RTP1Q12751 URN1YPR152C 1398 nt15.08■□□□□ 0
RTP1Q12751 YNL208WYNL208W 600 nt15.04■□□□□ -0
RTP1Q12751 TIR1YER011W 765 nt15.01□□□□□ -0.01
RTP1Q12751 RPN10YHR200W 807 nt15.01□□□□□ -0.01
RTP1Q12751 YOR139CYOR139C 393 nt14.93□□□□□ -0.02
RTP1Q12751 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.88□□□□□ -0.03
RTP1Q12751 OPI9YLR338W 858 nt14.77□□□□□ -0.05
RTP1Q12751 NPL3YDR432W 1245 nt14.75□□□□□ -0.05
RTP1Q12751 SSA1YAL005C 1929 nt14.7□□□□□ -0.06
RTP1Q12751 SAH1YER043C 1350 nt14.53□□□□□ -0.08
RTP1Q12751 YGR021WYGR021W 873 nt14.52□□□□□ -0.09
RTP1Q12751 SRB2YHR041C 633 nt14.51□□□□□ -0.09
RTP1Q12751 PUT4YOR348C 1884 nt14.48□□□□□ -0.09
RTP1Q12751 HOM6YJR139C 1080 nt14.46□□□□□ -0.09
RTP1Q12751 MNP1YGL068W 585 nt14.44□□□□□ -0.1
RTP1Q12751 YOL037CYOL037C 354 nt14.44□□□□□ -0.1
RTP1Q12751 YJR018WYJR018W 363 nt14.43□□□□□ -0.1
RTP1Q12751 WWM1YFL010C 636 nt14.41□□□□□ -0.1
RTP1Q12751 PUN1YLR414C 792 nt14.36□□□□□ -0.11
RTP1Q12751 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RTP1Q12751 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RTP1Q12751 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RTP1Q12751 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RTP1Q12751 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.33□□□□□ -0.12
RTP1Q12751 RPP2BYDR382W 333 nt14.29□□□□□ -0.12
RTP1Q12751 YJR120WYJR120W 351 nt14.25□□□□□ -0.13
RTP1Q12751 RKM5YLR137W 1104 nt14.25□□□□□ -0.13
RTP1Q12751 ARE1YCR048W 1833 nt14.25□□□□□ -0.13
RTP1Q12751 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.2□□□□□ -0.14
RTP1Q12751 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.08□□□□□ -0.16
RTP1Q12751 PTC2YER089C 1395 nt14.08□□□□□ -0.16
RTP1Q12751 Q0182Q0182 405 nt14.07□□□□□ -0.16
RTP1Q12751 PUS2YGL063W 1113 nt14.06□□□□□ -0.16
RTP1Q12751 BDH2YAL061W 1254 nt14.06□□□□□ -0.16
RTP1Q12751 YLR281CYLR281C 468 nt14.04□□□□□ -0.16
RTP1Q12751 LSM3YLR438C-A 270 nt13.99□□□□□ -0.17
RTP1Q12751 MOT3YMR070W 1473 nt13.96□□□□□ -0.17
RTP1Q12751 POA1YBR022W 534 nt13.96□□□□□ -0.17
RTP1Q12751 WHI5YOR083W 888 nt13.92□□□□□ -0.18
RTP1Q12751 INM2YDR287W 879 nt13.87□□□□□ -0.19
RTP1Q12751 NAB2YGL122C 1578 nt13.83□□□□□ -0.19
RTP1Q12751 SPT5YML010W 3192 nt13.83□□□□□ -0.19
RTP1Q12751 BSC6YOL137W 1494 nt13.8□□□□□ -0.2
RTP1Q12751 BUD23YCR047C 828 nt13.8□□□□□ -0.2
RTP1Q12751 YBL100CYBL100C 315 nt13.79□□□□□ -0.2
RTP1Q12751 DAL1YIR027C 1383 nt13.75□□□□□ -0.21
RTP1Q12751 TRM9YML014W 840 nt13.73□□□□□ -0.21
RTP1Q12751 FPR4YLR449W 1179 nt13.72□□□□□ -0.21
RTP1Q12751 FMP45YDL222C 930 nt13.7□□□□□ -0.22
RTP1Q12751 DSK2YMR276W 1122 nt13.7□□□□□ -0.22
RTP1Q12751 IMP2'YIL154C 1041 nt13.67□□□□□ -0.22
RTP1Q12751 FIS1YIL065C 468 nt13.66□□□□□ -0.22
RTP1Q12751 FUN26YAL022C 1554 nt13.64□□□□□ -0.23
RTP1Q12751 YPR011CYPR011C 981 nt13.64□□□□□ -0.23
RTP1Q12751 MRPL8YJL063C 717 nt13.63□□□□□ -0.23
RTP1Q12751 YCH1YGR203W 447 nt13.61□□□□□ -0.23
RTP1Q12751 PHO4YFR034C 939 nt13.6□□□□□ -0.23
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