Protein–RNA interactions for Protein: P53222

YGR035C, Uncharacterized protein YGR035C, yeastyeast

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YGR035CP53222 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.25■■□□□ 1.15
YGR035CP53222 NOP1YDL014W 984 nt21.8■■□□□ 1.08
YGR035CP53222 NSR1YGR159C 1245 nt21.64■■□□□ 1.05
YGR035CP53222 YKL036CYKL036C 393 nt20.55■□□□□ 0.88
YGR035CP53222 YJL027CYJL027C 417 nt19.3■□□□□ 0.68
YGR035CP53222 Q0297Q0297 156 nt19.19■□□□□ 0.66
YGR035CP53222 SRX1YKL086W 384 nt19.02■□□□□ 0.64
YGR035CP53222 SCS3YGL126W 1143 nt18.92■□□□□ 0.62
YGR035CP53222 MDJ1YFL016C 1536 nt18.81■□□□□ 0.6
YGR035CP53222 YCR051WYCR051W 669 nt18.16■□□□□ 0.5
YGR035CP53222 YOL085CYOL085C 342 nt17.77■□□□□ 0.44
YGR035CP53222 PKP1YIL042C 1185 nt17.5■□□□□ 0.39
YGR035CP53222 SCJ1YMR214W 1134 nt17.31■□□□□ 0.36
YGR035CP53222 RPP1BYDL130W 321 nt17.25■□□□□ 0.35
YGR035CP53222 ATS1YAL020C 1002 nt17.05■□□□□ 0.32
YGR035CP53222 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.9■□□□□ 0.3
YGR035CP53222 CCC1YLR220W 969 nt16.84■□□□□ 0.29
YGR035CP53222 DBP2YNL112W 1641 nt16.75■□□□□ 0.27
YGR035CP53222 PET122YER153C 765 nt16.42■□□□□ 0.22
YGR035CP53222 SCR1SCR1 522 nt16.41■□□□□ 0.22
YGR035CP53222 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.17■□□□□ 0.18
YGR035CP53222 RRN5YLR141W 1092 nt16.02■□□□□ 0.16
YGR035CP53222 RVS167YDR388W 1449 nt15.94■□□□□ 0.14
YGR035CP53222 YBR190WYBR190W 312 nt15.89■□□□□ 0.13
YGR035CP53222 RSB1YOR049C 1065 nt15.86■□□□□ 0.13
YGR035CP53222 RTC3YHR087W 336 nt15.83■□□□□ 0.12
YGR035CP53222 PST2YDR032C 597 nt15.69■□□□□ 0.1
YGR035CP53222 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.69■□□□□ 0.1
YGR035CP53222 YDJ1YNL064C 1230 nt15.62■□□□□ 0.09
YGR035CP53222 SHR5YOL110W 714 nt15.47■□□□□ 0.07
YGR035CP53222 YKL097CYKL097C 411 nt15.37■□□□□ 0.05
YGR035CP53222 GAR1YHR089C 618 nt15.26■□□□□ 0.03
YGR035CP53222 SHU1YHL006C 453 nt14.97□□□□□ -0.01
YGR035CP53222 DEP1YAL013W 1218 nt14.95□□□□□ -0.02
YGR035CP53222 URN1YPR152C 1398 nt14.77□□□□□ -0.04
YGR035CP53222 YNL208WYNL208W 600 nt14.71□□□□□ -0.05
YGR035CP53222 TIR1YER011W 765 nt14.7□□□□□ -0.06
YGR035CP53222 RPN10YHR200W 807 nt14.67□□□□□ -0.06
YGR035CP53222 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.66□□□□□ -0.06
YGR035CP53222 YOR139CYOR139C 393 nt14.62□□□□□ -0.07
YGR035CP53222 NPL3YDR432W 1245 nt14.46□□□□□ -0.09
YGR035CP53222 OPI9YLR338W 858 nt14.44□□□□□ -0.1
YGR035CP53222 SSA1YAL005C 1929 nt14.39□□□□□ -0.11
YGR035CP53222 SAH1YER043C 1350 nt14.24□□□□□ -0.13
YGR035CP53222 SRB2YHR041C 633 nt14.22□□□□□ -0.13
YGR035CP53222 YGR021WYGR021W 873 nt14.19□□□□□ -0.14
YGR035CP53222 MNP1YGL068W 585 nt14.17□□□□□ -0.14
YGR035CP53222 WWM1YFL010C 636 nt14.15□□□□□ -0.14
YGR035CP53222 YJR018WYJR018W 363 nt14.13□□□□□ -0.15
YGR035CP53222 HOM6YJR139C 1080 nt14.13□□□□□ -0.15
YGR035CP53222 YOL037CYOL037C 354 nt14.1□□□□□ -0.15
YGR035CP53222 PUN1YLR414C 792 nt14.04□□□□□ -0.16
YGR035CP53222 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.03□□□□□ -0.16
YGR035CP53222 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.03□□□□□ -0.16
YGR035CP53222 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.03□□□□□ -0.16
YGR035CP53222 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.03□□□□□ -0.16
YGR035CP53222 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.03□□□□□ -0.16
YGR035CP53222 PUT4YOR348C 1884 nt14□□□□□ -0.17
YGR035CP53222 RPP2BYDR382W 333 nt14□□□□□ -0.17
YGR035CP53222 YJR120WYJR120W 351 nt13.94□□□□□ -0.18
YGR035CP53222 RKM5YLR137W 1104 nt13.94□□□□□ -0.18
YGR035CP53222 ARE1YCR048W 1833 nt13.91□□□□□ -0.18
YGR035CP53222 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.88□□□□□ -0.19
YGR035CP53222 PUS2YGL063W 1113 nt13.81□□□□□ -0.2
YGR035CP53222 PTC2YER089C 1395 nt13.8□□□□□ -0.2
YGR035CP53222 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.79□□□□□ -0.2
YGR035CP53222 BDH2YAL061W 1254 nt13.74□□□□□ -0.21
YGR035CP53222 YLR281CYLR281C 468 nt13.73□□□□□ -0.21
YGR035CP53222 POA1YBR022W 534 nt13.7□□□□□ -0.22
YGR035CP53222 MOT3YMR070W 1473 nt13.67□□□□□ -0.22
YGR035CP53222 LSM3YLR438C-A 270 nt13.65□□□□□ -0.22
YGR035CP53222 WHI5YOR083W 888 nt13.65□□□□□ -0.22
YGR035CP53222 SSA3YBL075C 1950 nt13.63□□□□□ -0.23
YGR035CP53222 BUD23YCR047C 828 nt13.58□□□□□ -0.24
YGR035CP53222 INM2YDR287W 879 nt13.56□□□□□ -0.24
YGR035CP53222 BSC6YOL137W 1494 nt13.55□□□□□ -0.24
YGR035CP53222 FPR4YLR449W 1179 nt13.52□□□□□ -0.25
YGR035CP53222 NAB2YGL122C 1578 nt13.52□□□□□ -0.25
YGR035CP53222 YBL100CYBL100C 315 nt13.51□□□□□ -0.25
YGR035CP53222 FMP45YDL222C 930 nt13.47□□□□□ -0.25
YGR035CP53222 TRM9YML014W 840 nt13.46□□□□□ -0.25
YGR035CP53222 DAL1YIR027C 1383 nt13.44□□□□□ -0.26
YGR035CP53222 DSK2YMR276W 1122 nt13.4□□□□□ -0.26
YGR035CP53222 YPR011CYPR011C 981 nt13.38□□□□□ -0.27
YGR035CP53222 FUN26YAL022C 1554 nt13.36□□□□□ -0.27
YGR035CP53222 FIS1YIL065C 468 nt13.34□□□□□ -0.27
YGR035CP53222 YCH1YGR203W 447 nt13.33□□□□□ -0.28
YGR035CP53222 IMP2'YIL154C 1041 nt13.32□□□□□ -0.28
YGR035CP53222 YLR236CYLR236C 324 nt13.32□□□□□ -0.28
YGR035CP53222 PHO4YFR034C 939 nt13.31□□□□□ -0.28
YGR035CP53222 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.31□□□□□ -0.28
YGR035CP53222 MRPL8YJL063C 717 nt13.27□□□□□ -0.29
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