Protein–RNA interactions for Protein: Q12527

ATG11, Autophagy-related protein 11, yeastyeast

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Length 1,178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG11Q12527 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.65■■□□□ 1.22
ATG11Q12527 NOP1YDL014W 984 nt22.16■■□□□ 1.14
ATG11Q12527 NSR1YGR159C 1245 nt22.15■■□□□ 1.14
ATG11Q12527 YKL036CYKL036C 393 nt20.82■□□□□ 0.92
ATG11Q12527 Q0297Q0297 156 nt19.54■□□□□ 0.72
ATG11Q12527 YJL027CYJL027C 417 nt19.52■□□□□ 0.72
ATG11Q12527 SRX1YKL086W 384 nt19.38■□□□□ 0.69
ATG11Q12527 MDJ1YFL016C 1536 nt19.3■□□□□ 0.68
ATG11Q12527 SCS3YGL126W 1143 nt19.16■□□□□ 0.66
ATG11Q12527 YCR051WYCR051W 669 nt18.42■□□□□ 0.54
ATG11Q12527 YOL085CYOL085C 342 nt18.04■□□□□ 0.48
ATG11Q12527 PKP1YIL042C 1185 nt17.73■□□□□ 0.43
ATG11Q12527 RPP1BYDL130W 321 nt17.53■□□□□ 0.4
ATG11Q12527 SCJ1YMR214W 1134 nt17.46■□□□□ 0.39
ATG11Q12527 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.28■□□□□ 0.36
ATG11Q12527 ATS1YAL020C 1002 nt17.26■□□□□ 0.35
ATG11Q12527 DBP2YNL112W 1641 nt17.25■□□□□ 0.35
ATG11Q12527 CCC1YLR220W 969 nt17.13■□□□□ 0.33
ATG11Q12527 PET122YER153C 765 nt16.71■□□□□ 0.27
ATG11Q12527 SCR1SCR1 522 nt16.63■□□□□ 0.25
ATG11Q12527 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.49■□□□□ 0.23
ATG11Q12527 YBR190WYBR190W 312 nt16.34■□□□□ 0.21
ATG11Q12527 RVS167YDR388W 1449 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG11Q12527 RRN5YLR141W 1092 nt16.28■□□□□ 0.2
ATG11Q12527 RSB1YOR049C 1065 nt16.05■□□□□ 0.16
ATG11Q12527 RTC3YHR087W 336 nt16.01■□□□□ 0.15
ATG11Q12527 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.97■□□□□ 0.15
ATG11Q12527 YDJ1YNL064C 1230 nt15.94■□□□□ 0.14
ATG11Q12527 PST2YDR032C 597 nt15.92■□□□□ 0.14
ATG11Q12527 SHR5YOL110W 714 nt15.82■□□□□ 0.12
ATG11Q12527 GAR1YHR089C 618 nt15.54■□□□□ 0.08
ATG11Q12527 YKL097CYKL097C 411 nt15.49■□□□□ 0.07
ATG11Q12527 DEP1YAL013W 1218 nt15.26■□□□□ 0.03
ATG11Q12527 SHU1YHL006C 453 nt15.18■□□□□ 0.02
ATG11Q12527 URN1YPR152C 1398 nt15.13■□□□□ 0.01
ATG11Q12527 YNL208WYNL208W 600 nt15.04■□□□□ -0
ATG11Q12527 TIR1YER011W 765 nt14.99□□□□□ -0.01
ATG11Q12527 RPN10YHR200W 807 nt14.99□□□□□ -0.01
ATG11Q12527 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.83□□□□□ -0.04
ATG11Q12527 OPI9YLR338W 858 nt14.83□□□□□ -0.04
ATG11Q12527 YOR139CYOR139C 393 nt14.81□□□□□ -0.04
ATG11Q12527 SSA1YAL005C 1929 nt14.74□□□□□ -0.05
ATG11Q12527 SSA3YBL075C 1950 nt14.69□□□□□ -0.06
ATG11Q12527 SAH1YER043C 1350 nt14.64□□□□□ -0.07
ATG11Q12527 NPL3YDR432W 1245 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG11Q12527 SRB2YHR041C 633 nt14.58□□□□□ -0.08
ATG11Q12527 PUT4YOR348C 1884 nt14.55□□□□□ -0.08
ATG11Q12527 YJR018WYJR018W 363 nt14.46□□□□□ -0.09
ATG11Q12527 YGR021WYGR021W 873 nt14.42□□□□□ -0.1
ATG11Q12527 ARE1YCR048W 1833 nt14.41□□□□□ -0.1
ATG11Q12527 WWM1YFL010C 636 nt14.41□□□□□ -0.1
ATG11Q12527 HOM6YJR139C 1080 nt14.41□□□□□ -0.1
ATG11Q12527 MNP1YGL068W 585 nt14.4□□□□□ -0.1
ATG11Q12527 PUN1YLR414C 792 nt14.4□□□□□ -0.1
ATG11Q12527 YJR120WYJR120W 351 nt14.34□□□□□ -0.11
ATG11Q12527 YOL037CYOL037C 354 nt14.3□□□□□ -0.12
ATG11Q12527 RPP2BYDR382W 333 nt14.27□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.21□□□□□ -0.13
ATG11Q12527 RKM5YLR137W 1104 nt14.2□□□□□ -0.14
ATG11Q12527 PTC2YER089C 1395 nt14.17□□□□□ -0.14
ATG11Q12527 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.15□□□□□ -0.14
ATG11Q12527 POA1YBR022W 534 nt14.13□□□□□ -0.15
ATG11Q12527 BDH2YAL061W 1254 nt14.06□□□□□ -0.16
ATG11Q12527 PUS2YGL063W 1113 nt13.96□□□□□ -0.17
ATG11Q12527 YLR281CYLR281C 468 nt13.95□□□□□ -0.18
ATG11Q12527 LSM3YLR438C-A 270 nt13.95□□□□□ -0.18
ATG11Q12527 BUD23YCR047C 828 nt13.93□□□□□ -0.18
ATG11Q12527 NAB2YGL122C 1578 nt13.92□□□□□ -0.18
ATG11Q12527 INM2YDR287W 879 nt13.89□□□□□ -0.19
ATG11Q12527 WHI5YOR083W 888 nt13.86□□□□□ -0.19
ATG11Q12527 YBL100CYBL100C 315 nt13.83□□□□□ -0.2
ATG11Q12527 DAL1YIR027C 1383 nt13.83□□□□□ -0.2
ATG11Q12527 FPR4YLR449W 1179 nt13.8□□□□□ -0.2
ATG11Q12527 MOT3YMR070W 1473 nt13.8□□□□□ -0.2
ATG11Q12527 FIS1YIL065C 468 nt13.76□□□□□ -0.21
ATG11Q12527 TRM9YML014W 840 nt13.74□□□□□ -0.21
ATG11Q12527 BSC6YOL137W 1494 nt13.73□□□□□ -0.21
ATG11Q12527 FUN26YAL022C 1554 nt13.68□□□□□ -0.22
ATG11Q12527 PHO4YFR034C 939 nt13.68□□□□□ -0.22
ATG11Q12527 YPR011CYPR011C 981 nt13.62□□□□□ -0.23
ATG11Q12527 FMP45YDL222C 930 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG11Q12527 DSK2YMR276W 1122 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG11Q12527 CCT6YDR188W 1641 nt13.57□□□□□ -0.24
ATG11Q12527 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG11Q12527 YLR236CYLR236C 324 nt13.55□□□□□ -0.24
ATG11Q12527 IMP2'YIL154C 1041 nt13.53□□□□□ -0.24
ATG11Q12527 YCH1YGR203W 447 nt13.48□□□□□ -0.25
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