Protein–RNA interactions for Protein: Q06339

TFC6, Transcription factor tau 91 kDa subunit, yeastyeast

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFC6Q06339 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.68■■□□□ 1.38
TFC6Q06339 NSR1YGR159C 1245 nt23.42■■□□□ 1.34
TFC6Q06339 NOP1YDL014W 984 nt22.96■■□□□ 1.27
TFC6Q06339 YKL036CYKL036C 393 nt21.27■■□□□ 1
TFC6Q06339 MDJ1YFL016C 1536 nt20.83■□□□□ 0.93
TFC6Q06339 Q0297Q0297 156 nt20.15■□□□□ 0.82
TFC6Q06339 SRX1YKL086W 384 nt20.09■□□□□ 0.81
TFC6Q06339 YJL027CYJL027C 417 nt19.88■□□□□ 0.77
TFC6Q06339 SCS3YGL126W 1143 nt19.43■□□□□ 0.7
TFC6Q06339 YCR051WYCR051W 669 nt19.09■□□□□ 0.65
TFC6Q06339 DBP2YNL112W 1641 nt18.45■□□□□ 0.54
TFC6Q06339 YOL085CYOL085C 342 nt18.45■□□□□ 0.54
TFC6Q06339 PKP1YIL042C 1185 nt18.21■□□□□ 0.51
TFC6Q06339 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.16■□□□□ 0.5
TFC6Q06339 RPP1BYDL130W 321 nt18.08■□□□□ 0.48
TFC6Q06339 CCC1YLR220W 969 nt18■□□□□ 0.47
TFC6Q06339 YBR190WYBR190W 312 nt17.67■□□□□ 0.42
TFC6Q06339 ATS1YAL020C 1002 nt17.37■□□□□ 0.37
TFC6Q06339 PET122YER153C 765 nt17.32■□□□□ 0.36
TFC6Q06339 RTC3YHR087W 336 nt17.32■□□□□ 0.36
TFC6Q06339 SCJ1YMR214W 1134 nt17.31■□□□□ 0.36
TFC6Q06339 RVS167YDR388W 1449 nt17.28■□□□□ 0.36
TFC6Q06339 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TFC6Q06339 SCR1SCR1 522 nt17.07■□□□□ 0.32
TFC6Q06339 RRN5YLR141W 1092 nt16.81■□□□□ 0.28
TFC6Q06339 SHR5YOL110W 714 nt16.72■□□□□ 0.27
TFC6Q06339 YDJ1YNL064C 1230 nt16.6■□□□□ 0.25
TFC6Q06339 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.48■□□□□ 0.23
TFC6Q06339 RSB1YOR049C 1065 nt16.47■□□□□ 0.23
TFC6Q06339 DEP1YAL013W 1218 nt16.29■□□□□ 0.2
TFC6Q06339 GAR1YHR089C 618 nt16.28■□□□□ 0.2
TFC6Q06339 URN1YPR152C 1398 nt16.24■□□□□ 0.19
TFC6Q06339 PST2YDR032C 597 nt16.09■□□□□ 0.17
TFC6Q06339 PUT4YOR348C 1884 nt16.05■□□□□ 0.16
TFC6Q06339 OPI9YLR338W 858 nt15.97■□□□□ 0.15
TFC6Q06339 YNL208WYNL208W 600 nt15.97■□□□□ 0.15
TFC6Q06339 RPN10YHR200W 807 nt15.94■□□□□ 0.14
TFC6Q06339 SAH1YER043C 1350 nt15.9■□□□□ 0.14
TFC6Q06339 ARE1YCR048W 1833 nt15.8■□□□□ 0.12
TFC6Q06339 TIR1YER011W 765 nt15.71■□□□□ 0.11
TFC6Q06339 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.59■□□□□ 0.09
TFC6Q06339 POA1YBR022W 534 nt15.57■□□□□ 0.08
TFC6Q06339 SSA1YAL005C 1929 nt15.54■□□□□ 0.08
TFC6Q06339 PUN1YLR414C 792 nt15.49■□□□□ 0.07
TFC6Q06339 YJR018WYJR018W 363 nt15.48■□□□□ 0.07
TFC6Q06339 YKL097CYKL097C 411 nt15.46■□□□□ 0.07
TFC6Q06339 SHU1YHL006C 453 nt15.45■□□□□ 0.06
TFC6Q06339 SRB2YHR041C 633 nt15.37■□□□□ 0.05
TFC6Q06339 PTC2YER089C 1395 nt15.34■□□□□ 0.05
TFC6Q06339 YJR120WYJR120W 351 nt15.33■□□□□ 0.04
TFC6Q06339 BUD23YCR047C 828 nt15.23■□□□□ 0.03
TFC6Q06339 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.22■□□□□ 0.03
TFC6Q06339 BSC6YOL137W 1494 nt15.21■□□□□ 0.03
TFC6Q06339 RPP2BYDR382W 333 nt15.15■□□□□ 0.02
TFC6Q06339 NAB2YGL122C 1578 nt15.08■□□□□ 0
TFC6Q06339 WWM1YFL010C 636 nt15.06■□□□□ 0
TFC6Q06339 FIS1YIL065C 468 nt14.95□□□□□ -0.02
TFC6Q06339 HOM6YJR139C 1080 nt14.92□□□□□ -0.02
TFC6Q06339 DAL1YIR027C 1383 nt14.92□□□□□ -0.02
TFC6Q06339 YGR021WYGR021W 873 nt14.91□□□□□ -0.02
TFC6Q06339 FPR4YLR449W 1179 nt14.91□□□□□ -0.02
TFC6Q06339 MNP1YGL068W 585 nt14.9□□□□□ -0.02
TFC6Q06339 YOR139CYOR139C 393 nt14.89□□□□□ -0.03
TFC6Q06339 SSA3YBL075C 1950 nt14.89□□□□□ -0.03
TFC6Q06339 INM2YDR287W 879 nt14.88□□□□□ -0.03
TFC6Q06339 BDH2YAL061W 1254 nt14.88□□□□□ -0.03
TFC6Q06339 PHO4YFR034C 939 nt14.8□□□□□ -0.04
TFC6Q06339 YBL100CYBL100C 315 nt14.8□□□□□ -0.04
TFC6Q06339 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.76□□□□□ -0.05
TFC6Q06339 RKM5YLR137W 1104 nt14.7□□□□□ -0.06
TFC6Q06339 NPL3YDR432W 1245 nt14.69□□□□□ -0.06
TFC6Q06339 LSM3YLR438C-A 270 nt14.67□□□□□ -0.06
TFC6Q06339 FUN26YAL022C 1554 nt14.63□□□□□ -0.07
TFC6Q06339 YOL037CYOL037C 354 nt14.59□□□□□ -0.07
TFC6Q06339 TRM9YML014W 840 nt14.57□□□□□ -0.08
TFC6Q06339 YPS1YLR120C 1710 nt14.48□□□□□ -0.09
TFC6Q06339 SPT5YML010W 3192 nt14.44□□□□□ -0.1
TFC6Q06339 CCT6YDR188W 1641 nt14.44□□□□□ -0.1
TFC6Q06339 YDR095CYDR095C 411 nt14.4□□□□□ -0.1
TFC6Q06339 ALF1YNL148C 765 nt14.37□□□□□ -0.11
TFC6Q06339 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.31□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 YLR281CYLR281C 468 nt14.28□□□□□ -0.12
TFC6Q06339 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.27□□□□□ -0.13
TFC6Q06339 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.27□□□□□ -0.13
TFC6Q06339 MEP2YNL142W 1500 nt14.25□□□□□ -0.13
TFC6Q06339 WHI5YOR083W 888 nt14.23□□□□□ -0.13
TFC6Q06339 SIS1YNL007C 1059 nt14.18□□□□□ -0.14
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