RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	INP52	P50942	1183 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	VTC3	Q02725	835 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	APC2	Q12440	853 aa		5.81	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	SPR3	P41901	512 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	UBX2	Q04228	584 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	NUP145	P49687	1317 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	PDR1	P12383	1068 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	FAR1	P21268	830 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	MCM2	P29469	868 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	YEL1	P34225	687 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	STS1	P38637	319 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	VPS41	P38959	992 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	IES2	P40154	320 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	AIM21	P40563	679 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	RIA1	P53893	1110 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	YDR338C	Q05497	695 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	SLX4	Q12098	748 aa		5.8	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	COQ8	P27697	501 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	YLF2	P38746	405 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	YFR006W	P43590	535 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	RSC2	Q06488	889 aa		5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	IRC20	Q06554	1556 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	ELM1	P32801	640 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	ERC1	P38767	581 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	PET100	P38958	111 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	GYP7	P48365	746 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	FAR11	P53917	953 aa		5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
EXO1	YOR033C	RTC1	Q08281	1341 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	EFM2	P38347	419 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SHC1	P39000	512 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	DMA2	P53924	522 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	WHI5	Q12416	295 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	AVO1	Q08236	1176 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YOR238W	Q08634	303 aa		5.77	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YME2	P32843	850 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	PEX5	P35056	612 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MIF2	P35201	549 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YIR042C	P40586	236 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	CEP3	P40969	608 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	STU2	P46675	888 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	DSL1	P53847	754 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	HEH2	Q03281	663 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	TFB4	Q12004	338 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	HSP42	Q12329	375 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SIN3	P22579	1536 aa		5.76	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	UBP13	P38187	747 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	ATG14	P38270	344 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	CKB1	P43639	278 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YJR008W	P47085	338 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MSH6	Q03834	1242 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	JIP5	Q06214	492 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	ARC19	P33204	171 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MIC60	P36112	540 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	RPC37	P36121	282 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SSF1	P38789	453 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MRX12	P47084	519 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YDL144C	Q07589	356 aa		5.75	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SAC3	P46674	1301 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MSH1	P25846	959 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	BUD14	P27637	709 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	TGL3	P40308	642 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	CIR2	Q08822	631 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	GAL11	P19659	1081 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MRPS28	P21771	286 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MSM1	P22438	575 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	HIR2	P32480	875 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	EDS1	P38073	919 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	RKM3	P38222	552 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	HOT1	Q03213	719 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	KRE28	Q04431	385 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	PIB1	Q06651	286 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	YPR097W	Q06839	1073 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	TLG2	Q08144	397 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	APC5	Q08683	685 aa		5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
EXO1	YOR033C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49

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