Protein–RNA interactions for Protein: Q12440

APC2, Anaphase-promoting complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APC2Q12440 NSR1YGR159C 1245 nt18.59■□□□□ 0.57
APC2Q12440 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.54■□□□□ 0.56
APC2Q12440 NOP1YDL014W 984 nt18■□□□□ 0.47
APC2Q12440 MDJ1YFL016C 1536 nt16.65■□□□□ 0.26
APC2Q12440 YKL036CYKL036C 393 nt16.34■□□□□ 0.21
APC2Q12440 SRX1YKL086W 384 nt15.64■□□□□ 0.09
APC2Q12440 Q0297Q0297 156 nt15.58■□□□□ 0.08
APC2Q12440 YJL027CYJL027C 417 nt15.44■□□□□ 0.06
APC2Q12440 SSA3YBL075C 1950 nt14.95□□□□□ -0.02
APC2Q12440 YCR051WYCR051W 669 nt14.88□□□□□ -0.03
APC2Q12440 SCS3YGL126W 1143 nt14.7□□□□□ -0.06
APC2Q12440 DBP2YNL112W 1641 nt14.57□□□□□ -0.08
APC2Q12440 YBR190WYBR190W 312 nt14.29□□□□□ -0.12
APC2Q12440 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.22□□□□□ -0.13
APC2Q12440 CCC1YLR220W 969 nt14.17□□□□□ -0.14
APC2Q12440 YOL085CYOL085C 342 nt14.12□□□□□ -0.15
APC2Q12440 RTC3YHR087W 336 nt14.05□□□□□ -0.16
APC2Q12440 RPP1BYDL130W 321 nt14□□□□□ -0.17
APC2Q12440 PKP1YIL042C 1185 nt13.95□□□□□ -0.18
APC2Q12440 RVS167YDR388W 1449 nt13.86□□□□□ -0.19
APC2Q12440 SCJ1YMR214W 1134 nt13.55□□□□□ -0.24
APC2Q12440 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.42□□□□□ -0.26
APC2Q12440 PET122YER153C 765 nt13.37□□□□□ -0.27
APC2Q12440 SCR1SCR1 522 nt13.29□□□□□ -0.28
APC2Q12440 SHR5YOL110W 714 nt13.25□□□□□ -0.29
APC2Q12440 ATS1YAL020C 1002 nt13.11□□□□□ -0.31
APC2Q12440 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
APC2Q12440 URN1YPR152C 1398 nt13.01□□□□□ -0.33
APC2Q12440 RRN5YLR141W 1092 nt12.99□□□□□ -0.33
APC2Q12440 YDJ1YNL064C 1230 nt12.99□□□□□ -0.33
APC2Q12440 FPS1YLL043W 2010 nt12.95□□□□□ -0.34
APC2Q12440 DEP1YAL013W 1218 nt12.94□□□□□ -0.34
APC2Q12440 NVJ2YPR091C 2313 nt12.91□□□□□ -0.34
APC2Q12440 PAC11YDR488C 1602 nt12.88□□□□□ -0.35
APC2Q12440 SSA1YAL005C 1929 nt12.86□□□□□ -0.35
APC2Q12440 RPN10YHR200W 807 nt12.85□□□□□ -0.35
APC2Q12440 OPI9YLR338W 858 nt12.83□□□□□ -0.36
APC2Q12440 SAH1YER043C 1350 nt12.81□□□□□ -0.36
APC2Q12440 GAR1YHR089C 618 nt12.76□□□□□ -0.37
APC2Q12440 ARE1YCR048W 1833 nt12.76□□□□□ -0.37
APC2Q12440 YNL208WYNL208W 600 nt12.74□□□□□ -0.37
APC2Q12440 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.72□□□□□ -0.37
APC2Q12440 RSB1YOR049C 1065 nt12.71□□□□□ -0.37
APC2Q12440 POA1YBR022W 534 nt12.7□□□□□ -0.38
APC2Q12440 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.66□□□□□ -0.38
APC2Q12440 PUN1YLR414C 792 nt12.51□□□□□ -0.41
APC2Q12440 BSC6YOL137W 1494 nt12.44□□□□□ -0.42
APC2Q12440 BUD23YCR047C 828 nt12.41□□□□□ -0.42
APC2Q12440 YJR018WYJR018W 363 nt12.4□□□□□ -0.42
APC2Q12440 PTC2YER089C 1395 nt12.38□□□□□ -0.43
APC2Q12440 SSA4YER103W 1929 nt12.34□□□□□ -0.43
APC2Q12440 SPT5YML010W 3192 nt12.34□□□□□ -0.43
APC2Q12440 TIR1YER011W 765 nt12.32□□□□□ -0.44
APC2Q12440 NAB2YGL122C 1578 nt12.25□□□□□ -0.45
APC2Q12440 RPP2BYDR382W 333 nt12.18□□□□□ -0.46
APC2Q12440 PST2YDR032C 597 nt12.14□□□□□ -0.47
APC2Q12440 BDF1YLR399C 2061 nt12.08□□□□□ -0.48
APC2Q12440 FPR4YLR449W 1179 nt12.08□□□□□ -0.48
APC2Q12440 DAL1YIR027C 1383 nt12.05□□□□□ -0.48
APC2Q12440 INM2YDR287W 879 nt12.02□□□□□ -0.49
APC2Q12440 YJR120WYJR120W 351 nt12□□□□□ -0.49
APC2Q12440 FIS1YIL065C 468 nt11.96□□□□□ -0.49
APC2Q12440 PHO4YFR034C 939 nt11.9□□□□□ -0.5
APC2Q12440 TAT1YBR069C 1860 nt11.87□□□□□ -0.51
APC2Q12440 UME6YDR207C 2511 nt11.86□□□□□ -0.51
APC2Q12440 YBL100CYBL100C 315 nt11.85□□□□□ -0.51
APC2Q12440 SRB2YHR041C 633 nt11.81□□□□□ -0.52
APC2Q12440 BDH2YAL061W 1254 nt11.81□□□□□ -0.52
APC2Q12440 WWM1YFL010C 636 nt11.72□□□□□ -0.53
APC2Q12440 YPS1YLR120C 1710 nt11.72□□□□□ -0.53
APC2Q12440 SHU1YHL006C 453 nt11.7□□□□□ -0.54
APC2Q12440 MEP2YNL142W 1500 nt11.7□□□□□ -0.54
APC2Q12440 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.69□□□□□ -0.54
APC2Q12440 TRM9YML014W 840 nt11.69□□□□□ -0.54
APC2Q12440 FUN26YAL022C 1554 nt11.68□□□□□ -0.54
APC2Q12440 YGR021WYGR021W 873 nt11.66□□□□□ -0.54
APC2Q12440 ALF1YNL148C 765 nt11.65□□□□□ -0.54
APC2Q12440 LSM3YLR438C-A 270 nt11.64□□□□□ -0.55
APC2Q12440 YKL097CYKL097C 411 nt11.63□□□□□ -0.55
APC2Q12440 YDR095CYDR095C 411 nt11.61□□□□□ -0.55
APC2Q12440 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.6□□□□□ -0.55
APC2Q12440 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.57□□□□□ -0.56
APC2Q12440 HOM6YJR139C 1080 nt11.52□□□□□ -0.57
APC2Q12440 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.51□□□□□ -0.57
APC2Q12440 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.51□□□□□ -0.57
APC2Q12440 CCT6YDR188W 1641 nt11.5□□□□□ -0.57
APC2Q12440 DCW1YKL046C 1350 nt11.48□□□□□ -0.57
APC2Q12440 RPP2AYOL039W 321 nt11.43□□□□□ -0.58
APC2Q12440 MNP1YGL068W 585 nt11.42□□□□□ -0.58
APC2Q12440 YMR090WYMR090W 684 nt11.42□□□□□ -0.58
APC2Q12440 Q0182Q0182 405 nt11.39□□□□□ -0.59
APC2Q12440 EMI2YDR516C 1503 nt11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms