Protein–RNA interactions for Protein: Q12416

WHI5, G1-specific transcriptional repressor WHI5, yeastyeast

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Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WHI5Q12416 NSR1YGR159C 1245 nt17.27■□□□□ 0.36
WHI5Q12416 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.17■□□□□ 0.34
WHI5Q12416 NOP1YDL014W 984 nt16.72■□□□□ 0.27
WHI5Q12416 Q0182Q0182 405 nt15.67■□□□□ 0.1
WHI5Q12416 MDJ1YFL016C 1536 nt15.4■□□□□ 0.06
WHI5Q12416 MOT3YMR070W 1473 nt15.39■□□□□ 0.05
WHI5Q12416 YKL036CYKL036C 393 nt15.2■□□□□ 0.02
WHI5Q12416 SSA3YBL075C 1950 nt15.07■□□□□ 0
WHI5Q12416 SRX1YKL086W 384 nt14.54□□□□□ -0.08
WHI5Q12416 Q0297Q0297 156 nt14.51□□□□□ -0.09
WHI5Q12416 YJL027CYJL027C 417 nt14.29□□□□□ -0.12
WHI5Q12416 YCR051WYCR051W 669 nt13.79□□□□□ -0.2
WHI5Q12416 SCS3YGL126W 1143 nt13.67□□□□□ -0.22
WHI5Q12416 DBP2YNL112W 1641 nt13.53□□□□□ -0.24
WHI5Q12416 YBR190WYBR190W 312 nt13.26□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.21□□□□□ -0.29
WHI5Q12416 YOL085CYOL085C 342 nt13.14□□□□□ -0.31
WHI5Q12416 CCC1YLR220W 969 nt13.12□□□□□ -0.31
WHI5Q12416 RPP1BYDL130W 321 nt13.03□□□□□ -0.32
WHI5Q12416 RTC3YHR087W 336 nt12.97□□□□□ -0.33
WHI5Q12416 PKP1YIL042C 1185 nt12.94□□□□□ -0.34
WHI5Q12416 NVJ2YPR091C 2313 nt12.89□□□□□ -0.35
WHI5Q12416 RVS167YDR388W 1449 nt12.82□□□□□ -0.36
WHI5Q12416 FPS1YLL043W 2010 nt12.81□□□□□ -0.36
WHI5Q12416 PAC11YDR488C 1602 nt12.8□□□□□ -0.36
WHI5Q12416 NME1NME1 340 nt12.7□□□□□ -0.38
WHI5Q12416 SSA4YER103W 1929 nt12.58□□□□□ -0.39
WHI5Q12416 SCJ1YMR214W 1134 nt12.56□□□□□ -0.4
WHI5Q12416 SSA1YAL005C 1929 nt12.5□□□□□ -0.41
WHI5Q12416 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.47□□□□□ -0.41
WHI5Q12416 SPT5YML010W 3192 nt12.46□□□□□ -0.41
WHI5Q12416 PET122YER153C 765 nt12.41□□□□□ -0.42
WHI5Q12416 BDF1YLR399C 2061 nt12.39□□□□□ -0.43
WHI5Q12416 SCR1SCR1 522 nt12.34□□□□□ -0.43
WHI5Q12416 SHR5YOL110W 714 nt12.29□□□□□ -0.44
WHI5Q12416 ATS1YAL020C 1002 nt12.22□□□□□ -0.45
WHI5Q12416 PUT4YOR348C 1884 nt12.15□□□□□ -0.46
WHI5Q12416 TAT1YBR069C 1860 nt12.14□□□□□ -0.47
WHI5Q12416 YDJ1YNL064C 1230 nt12.08□□□□□ -0.48
WHI5Q12416 RRN5YLR141W 1092 nt12.07□□□□□ -0.48
WHI5Q12416 URN1YPR152C 1398 nt12.04□□□□□ -0.48
WHI5Q12416 DEP1YAL013W 1218 nt11.96□□□□□ -0.49
WHI5Q12416 UME6YDR207C 2511 nt11.95□□□□□ -0.5
WHI5Q12416 OPI9YLR338W 858 nt11.9□□□□□ -0.5
WHI5Q12416 RPN10YHR200W 807 nt11.89□□□□□ -0.51
WHI5Q12416 SAH1YER043C 1350 nt11.85□□□□□ -0.51
WHI5Q12416 YGR139WYGR139W 339 nt11.83□□□□□ -0.52
WHI5Q12416 GAR1YHR089C 618 nt11.83□□□□□ -0.52
WHI5Q12416 ARE1YCR048W 1833 nt11.82□□□□□ -0.52
WHI5Q12416 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.82□□□□□ -0.52
WHI5Q12416 YNL208WYNL208W 600 nt11.81□□□□□ -0.52
WHI5Q12416 RSB1YOR049C 1065 nt11.79□□□□□ -0.52
WHI5Q12416 POA1YBR022W 534 nt11.75□□□□□ -0.53
WHI5Q12416 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt11.68□□□□□ -0.54
WHI5Q12416 BSC6YOL137W 1494 nt11.62□□□□□ -0.55
WHI5Q12416 PUN1YLR414C 792 nt11.59□□□□□ -0.55
WHI5Q12416 YJR018WYJR018W 363 nt11.49□□□□□ -0.57
WHI5Q12416 FRE6YLL051C 2139 nt11.45□□□□□ -0.58
WHI5Q12416 BUD23YCR047C 828 nt11.45□□□□□ -0.58
WHI5Q12416 PTC2YER089C 1395 nt11.44□□□□□ -0.58
WHI5Q12416 TIR1YER011W 765 nt11.44□□□□□ -0.58
WHI5Q12416 GUT2YIL155C 1950 nt11.43□□□□□ -0.58
WHI5Q12416 CLB6YGR109C 1143 nt11.37□□□□□ -0.59
WHI5Q12416 MET8YBR213W 825 nt11.36□□□□□ -0.59
WHI5Q12416 NAB2YGL122C 1578 nt11.35□□□□□ -0.59
WHI5Q12416 PST2YDR032C 597 nt11.34□□□□□ -0.59
WHI5Q12416 RPP2BYDR382W 333 nt11.27□□□□□ -0.61
WHI5Q12416 CSM2YIL132C 642 nt11.26□□□□□ -0.61
WHI5Q12416 Q0010Q0010 387 nt11.22□□□□□ -0.61
WHI5Q12416 MCH5YOR306C 1566 nt11.21□□□□□ -0.61
WHI5Q12416 INM2YDR287W 879 nt11.16□□□□□ -0.62
WHI5Q12416 YJR120WYJR120W 351 nt11.15□□□□□ -0.62
WHI5Q12416 DAL1YIR027C 1383 nt11.15□□□□□ -0.63
WHI5Q12416 FPR4YLR449W 1179 nt11.14□□□□□ -0.63
WHI5Q12416 YJR154WYJR154W 1041 nt11.09□□□□□ -0.63
WHI5Q12416 MEP2YNL142W 1500 nt11.06□□□□□ -0.64
WHI5Q12416 FIS1YIL065C 468 nt11.06□□□□□ -0.64
WHI5Q12416 YBR220CYBR220C 1683 nt11.04□□□□□ -0.64
WHI5Q12416 RPM1RPM1 483 nt11.03□□□□□ -0.64
WHI5Q12416 PCH2YBR186W 1695 nt11.02□□□□□ -0.64
WHI5Q12416 PHO4YFR034C 939 nt11.01□□□□□ -0.65
WHI5Q12416 PIB2YGL023C 1908 nt11□□□□□ -0.65
WHI5Q12416 BOR1YNL275W 1731 nt11□□□□□ -0.65
WHI5Q12416 SRB2YHR041C 633 nt10.98□□□□□ -0.65
WHI5Q12416 BDH2YAL061W 1254 nt10.96□□□□□ -0.65
WHI5Q12416 YBL100CYBL100C 315 nt10.96□□□□□ -0.65
WHI5Q12416 DCW1YKL046C 1350 nt10.92□□□□□ -0.66
WHI5Q12416 SHU1YHL006C 453 nt10.89□□□□□ -0.67
WHI5Q12416 WWM1YFL010C 636 nt10.88□□□□□ -0.67
WHI5Q12416 YPS1YLR120C 1710 nt10.86□□□□□ -0.67
WHI5Q12416 YGR021WYGR021W 873 nt10.83□□□□□ -0.68
WHI5Q12416 TRM9YML014W 840 nt10.83□□□□□ -0.68
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