Protein–RNA interactions for Protein: Q08683

APC5, Anaphase-promoting complex subunit 5, yeastyeast

Predictions only

Length 685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APC5Q08683 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.52■■□□□ 1.04
APC5Q08683 NSR1YGR159C 1245 nt21.29■■□□□ 1
APC5Q08683 NOP1YDL014W 984 nt21.03■□□□□ 0.96
APC5Q08683 YKL036CYKL036C 393 nt19.42■□□□□ 0.7
APC5Q08683 MDJ1YFL016C 1536 nt18.74■□□□□ 0.59
APC5Q08683 Q0297Q0297 156 nt18.32■□□□□ 0.52
APC5Q08683 SRX1YKL086W 384 nt18.28■□□□□ 0.52
APC5Q08683 YJL027CYJL027C 417 nt18.17■□□□□ 0.5
APC5Q08683 SCS3YGL126W 1143 nt17.64■□□□□ 0.41
APC5Q08683 YCR051WYCR051W 669 nt17.42■□□□□ 0.38
APC5Q08683 YOL085CYOL085C 342 nt16.76■□□□□ 0.27
APC5Q08683 DBP2YNL112W 1641 nt16.53■□□□□ 0.24
APC5Q08683 PKP1YIL042C 1185 nt16.52■□□□□ 0.24
APC5Q08683 RPP1BYDL130W 321 nt16.46■□□□□ 0.23
APC5Q08683 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.42■□□□□ 0.22
APC5Q08683 CCC1YLR220W 969 nt16.36■□□□□ 0.21
APC5Q08683 YBR190WYBR190W 312 nt16.02■□□□□ 0.16
APC5Q08683 ATS1YAL020C 1002 nt15.82■□□□□ 0.12
APC5Q08683 RVS167YDR388W 1449 nt15.81■□□□□ 0.12
APC5Q08683 SCJ1YMR214W 1134 nt15.8■□□□□ 0.12
APC5Q08683 RTC3YHR087W 336 nt15.76■□□□□ 0.11
APC5Q08683 PET122YER153C 765 nt15.68■□□□□ 0.1
APC5Q08683 SCR1SCR1 522 nt15.68■□□□□ 0.1
APC5Q08683 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.61■□□□□ 0.09
APC5Q08683 RRN5YLR141W 1092 nt15.27■□□□□ 0.04
APC5Q08683 SHR5YOL110W 714 nt15.19■□□□□ 0.02
APC5Q08683 YDJ1YNL064C 1230 nt15.1■□□□□ 0.01
APC5Q08683 RSB1YOR049C 1065 nt15.04■□□□□ -0
APC5Q08683 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.95□□□□□ -0.02
APC5Q08683 GAR1YHR089C 618 nt14.78□□□□□ -0.04
APC5Q08683 DEP1YAL013W 1218 nt14.73□□□□□ -0.05
APC5Q08683 URN1YPR152C 1398 nt14.71□□□□□ -0.06
APC5Q08683 RPN10YHR200W 807 nt14.62□□□□□ -0.07
APC5Q08683 PST2YDR032C 597 nt14.6□□□□□ -0.07
APC5Q08683 YNL208WYNL208W 600 nt14.54□□□□□ -0.08
APC5Q08683 OPI9YLR338W 858 nt14.45□□□□□ -0.1
APC5Q08683 PUT4YOR348C 1884 nt14.35□□□□□ -0.11
APC5Q08683 SAH1YER043C 1350 nt14.33□□□□□ -0.12
APC5Q08683 SSA3YBL075C 1950 nt14.27□□□□□ -0.12
APC5Q08683 TIR1YER011W 765 nt14.26□□□□□ -0.13
APC5Q08683 YKL097CYKL097C 411 nt14.17□□□□□ -0.14
APC5Q08683 ARE1YCR048W 1833 nt14.12□□□□□ -0.15
APC5Q08683 PUN1YLR414C 792 nt14.09□□□□□ -0.15
APC5Q08683 YJR018WYJR018W 363 nt14.06□□□□□ -0.16
APC5Q08683 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.03□□□□□ -0.16
APC5Q08683 POA1YBR022W 534 nt14.01□□□□□ -0.17
APC5Q08683 SSA1YAL005C 1929 nt13.99□□□□□ -0.17
APC5Q08683 SHU1YHL006C 453 nt13.98□□□□□ -0.17
APC5Q08683 RPP2BYDR382W 333 nt13.89□□□□□ -0.19
APC5Q08683 PTC2YER089C 1395 nt13.86□□□□□ -0.19
APC5Q08683 BUD23YCR047C 828 nt13.79□□□□□ -0.2
APC5Q08683 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.77□□□□□ -0.21
APC5Q08683 NAB2YGL122C 1578 nt13.69□□□□□ -0.22
APC5Q08683 YJR120WYJR120W 351 nt13.67□□□□□ -0.22
APC5Q08683 SRB2YHR041C 633 nt13.66□□□□□ -0.22
APC5Q08683 YGR021WYGR021W 873 nt13.65□□□□□ -0.22
APC5Q08683 BSC6YOL137W 1494 nt13.65□□□□□ -0.22
APC5Q08683 WWM1YFL010C 636 nt13.62□□□□□ -0.23
APC5Q08683 INM2YDR287W 879 nt13.58□□□□□ -0.24
APC5Q08683 FPR4YLR449W 1179 nt13.57□□□□□ -0.24
APC5Q08683 BDH2YAL061W 1254 nt13.52□□□□□ -0.25
APC5Q08683 DAL1YIR027C 1383 nt13.52□□□□□ -0.25
APC5Q08683 HOM6YJR139C 1080 nt13.51□□□□□ -0.25
APC5Q08683 NPL3YDR432W 1245 nt13.49□□□□□ -0.25
APC5Q08683 YOR139CYOR139C 393 nt13.45□□□□□ -0.26
APC5Q08683 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.44□□□□□ -0.26
APC5Q08683 MNP1YGL068W 585 nt13.44□□□□□ -0.26
APC5Q08683 YBL100CYBL100C 315 nt13.44□□□□□ -0.26
APC5Q08683 FIS1YIL065C 468 nt13.39□□□□□ -0.27
APC5Q08683 LSM3YLR438C-A 270 nt13.39□□□□□ -0.27
APC5Q08683 PHO4YFR034C 939 nt13.36□□□□□ -0.27
APC5Q08683 YOL037CYOL037C 354 nt13.34□□□□□ -0.27
APC5Q08683 RKM5YLR137W 1104 nt13.33□□□□□ -0.28
APC5Q08683 TRM9YML014W 840 nt13.33□□□□□ -0.28
APC5Q08683 FUN26YAL022C 1554 nt13.25□□□□□ -0.29
APC5Q08683 ALF1YNL148C 765 nt13.15□□□□□ -0.3
APC5Q08683 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.08□□□□□ -0.32
APC5Q08683 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.08□□□□□ -0.32
APC5Q08683 CCT6YDR188W 1641 nt13.08□□□□□ -0.32
APC5Q08683 YPS1YLR120C 1710 nt13.02□□□□□ -0.32
APC5Q08683 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.99□□□□□ -0.33
APC5Q08683 YDR095CYDR095C 411 nt12.97□□□□□ -0.33
APC5Q08683 YLR281CYLR281C 468 nt12.97□□□□□ -0.33
APC5Q08683 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.96□□□□□ -0.33
APC5Q08683 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.96□□□□□ -0.33
APC5Q08683 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.96□□□□□ -0.33
APC5Q08683 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.96□□□□□ -0.33
APC5Q08683 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.96□□□□□ -0.33
APC5Q08683 WHI5YOR083W 888 nt12.95□□□□□ -0.34
APC5Q08683 PUS2YGL063W 1113 nt12.93□□□□□ -0.34
APC5Q08683 FPS1YLL043W 2010 nt12.87□□□□□ -0.35
APC5Q08683 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms