Protein–RNA interactions for Protein: Q08634

YOR238W, Uncharacterized protein YOR238W, yeastyeast

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR238WQ08634 NSR1YGR159C 1245 nt18.26■□□□□ 0.51
YOR238WQ08634 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.95■□□□□ 0.46
YOR238WQ08634 NOP1YDL014W 984 nt17.33■□□□□ 0.36
YOR238WQ08634 YGR139WYGR139W 339 nt17.31■□□□□ 0.36
YOR238WQ08634 VAR1Q0140 1197 nt16.7■□□□□ 0.26
YOR238WQ08634 MDJ1YFL016C 1536 nt16.58■□□□□ 0.24
YOR238WQ08634 MOT3YMR070W 1473 nt15.97■□□□□ 0.15
YOR238WQ08634 Q0182Q0182 405 nt15.85■□□□□ 0.13
YOR238WQ08634 YKL036CYKL036C 393 nt15.79■□□□□ 0.12
YOR238WQ08634 NME1NME1 340 nt15.7■□□□□ 0.1
YOR238WQ08634 YDR509WYDR509W 348 nt15.68■□□□□ 0.1
YOR238WQ08634 CSM2YIL132C 642 nt15.37■□□□□ 0.05
YOR238WQ08634 YJL027CYJL027C 417 nt15.33■□□□□ 0.04
YOR238WQ08634 Q0017Q0017 162 nt15.3■□□□□ 0.04
YOR238WQ08634 PAM17YKR065C 594 nt15.23■□□□□ 0.03
YOR238WQ08634 PAU21YOR394W 495 nt15.2■□□□□ 0.02
YOR238WQ08634 PAU22YPL282C 495 nt15.2■□□□□ 0.02
YOR238WQ08634 Q0142Q0142 177 nt15.18■□□□□ 0.02
YOR238WQ08634 SRX1YKL086W 384 nt15.09■□□□□ 0.01
YOR238WQ08634 Q0144Q0144 330 nt15.08■□□□□ 0
YOR238WQ08634 ARO7YPR060C 771 nt15.06■□□□□ 0
YOR238WQ08634 Q0297Q0297 156 nt14.97□□□□□ -0.01
YOR238WQ08634 BMT5YIL096C 1011 nt14.86□□□□□ -0.03
YOR238WQ08634 REG2YBR050C 1017 nt14.82□□□□□ -0.04
YOR238WQ08634 BUR6YER159C 429 nt14.8□□□□□ -0.04
YOR238WQ08634 SEM1YDR363W-A 270 nt14.78□□□□□ -0.04
YOR238WQ08634 Q0255Q0255 1419 nt14.51□□□□□ -0.09
YOR238WQ08634 AI5_BETAQ0075 1065 nt14.48□□□□□ -0.09
YOR238WQ08634 Q0010Q0010 387 nt14.46□□□□□ -0.09
YOR238WQ08634 DBP2YNL112W 1641 nt14.45□□□□□ -0.1
YOR238WQ08634 YOR169CYOR169C 465 nt14.41□□□□□ -0.1
YOR238WQ08634 SCS3YGL126W 1143 nt14.4□□□□□ -0.1
YOR238WQ08634 YGL188CYGL188C 174 nt14.38□□□□□ -0.11
YOR238WQ08634 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt14.38□□□□□ -0.11
YOR238WQ08634 YBR190WYBR190W 312 nt14.32□□□□□ -0.12
YOR238WQ08634 SRN2YLR119W 642 nt14.31□□□□□ -0.12
YOR238WQ08634 YCR051WYCR051W 669 nt14.29□□□□□ -0.12
YOR238WQ08634 AI3Q0060 1248 nt14.29□□□□□ -0.12
YOR238WQ08634 YCR099CYCR099C 468 nt14.17□□□□□ -0.14
YOR238WQ08634 ATP6Q0085 780 nt14.07□□□□□ -0.16
YOR238WQ08634 ARP10YDR106W 855 nt14.06□□□□□ -0.16
YOR238WQ08634 RTC3YHR087W 336 nt13.99□□□□□ -0.17
YOR238WQ08634 PET20YPL159C 762 nt13.95□□□□□ -0.18
YOR238WQ08634 ARA2YMR041C 1008 nt13.92□□□□□ -0.18
YOR238WQ08634 AIR1YIL079C 1083 nt13.91□□□□□ -0.18
YOR238WQ08634 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.89□□□□□ -0.19
YOR238WQ08634 CCC1YLR220W 969 nt13.76□□□□□ -0.21
YOR238WQ08634 YNR068CYNR068C 819 nt13.72□□□□□ -0.21
YOR238WQ08634 snR78snR78 87 nt13.69□□□□□ -0.22
YOR238WQ08634 YLR122CYLR122C 378 nt13.68□□□□□ -0.22
YOR238WQ08634 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt13.67□□□□□ -0.22
YOR238WQ08634 YOL085CYOL085C 342 nt13.67□□□□□ -0.22
YOR238WQ08634 KTR3YBR205W 1215 nt13.67□□□□□ -0.22
YOR238WQ08634 ABZ2YMR289W 1125 nt13.63□□□□□ -0.23
YOR238WQ08634 RVS167YDR388W 1449 nt13.62□□□□□ -0.23
YOR238WQ08634 UTP6YDR449C 1323 nt13.56□□□□□ -0.24
YOR238WQ08634 NEM1YHR004C 1341 nt13.56□□□□□ -0.24
YOR238WQ08634 SSA3YBL075C 1950 nt13.56□□□□□ -0.24
YOR238WQ08634 YPL168WYPL168W 1293 nt13.55□□□□□ -0.24
YOR238WQ08634 PHO92YDR374C 921 nt13.53□□□□□ -0.24
YOR238WQ08634 SKG1YKR100C 1068 nt13.52□□□□□ -0.25
YOR238WQ08634 RPP1BYDL130W 321 nt13.43□□□□□ -0.26
YOR238WQ08634 PKP1YIL042C 1185 nt13.4□□□□□ -0.26
YOR238WQ08634 YHL044WYHL044W 708 nt13.37□□□□□ -0.27
YOR238WQ08634 AST1YBL069W 1290 nt13.33□□□□□ -0.28
YOR238WQ08634 SCJ1YMR214W 1134 nt13.32□□□□□ -0.28
YOR238WQ08634 MET8YBR213W 825 nt13.3□□□□□ -0.28
YOR238WQ08634 TOM20YGR082W 552 nt13.29□□□□□ -0.28
YOR238WQ08634 PUT4YOR348C 1884 nt13.29□□□□□ -0.28
YOR238WQ08634 STD1YOR047C 1335 nt13.27□□□□□ -0.29
YOR238WQ08634 RPM1RPM1 483 nt13.23□□□□□ -0.29
YOR238WQ08634 URE2YNL229C 1065 nt13.23□□□□□ -0.29
YOR238WQ08634 CLB6YGR109C 1143 nt13.17□□□□□ -0.3
YOR238WQ08634 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt13.15□□□□□ -0.3
YOR238WQ08634 PEX27YOR193W 1131 nt13.14□□□□□ -0.31
YOR238WQ08634 LCP5YER127W 1074 nt13.13□□□□□ -0.31
YOR238WQ08634 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt13.11□□□□□ -0.31
YOR238WQ08634 FAR3YMR052W 615 nt13.1□□□□□ -0.31
YOR238WQ08634 YPL071CYPL071C 471 nt13.1□□□□□ -0.31
YOR238WQ08634 HMT1YBR034C 1047 nt13.09□□□□□ -0.31
YOR238WQ08634 GTT3YEL017W 1014 nt13.04□□□□□ -0.32
YOR238WQ08634 YDR008CYDR008C 351 nt13.02□□□□□ -0.33
YOR238WQ08634 URH1YDR400W 1023 nt13.02□□□□□ -0.33
YOR238WQ08634 FTR1YER145C 1215 nt13.02□□□□□ -0.33
YOR238WQ08634 SHR5YOL110W 714 nt12.99□□□□□ -0.33
YOR238WQ08634 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.98□□□□□ -0.33
YOR238WQ08634 ARE1YCR048W 1833 nt12.91□□□□□ -0.34
YOR238WQ08634 ATS1YAL020C 1002 nt12.9□□□□□ -0.34
YOR238WQ08634 PUS9YDL036C 1389 nt12.9□□□□□ -0.34
YOR238WQ08634 URN1YPR152C 1398 nt12.9□□□□□ -0.34
YOR238WQ08634 LSM12YHR121W 564 nt12.87□□□□□ -0.35
YOR238WQ08634 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms