Protein–RNA interactions for Protein: Q12329

HSP42, Heat shock protein 42, yeastyeast

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HSP42Q12329 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.01■□□□□ 0.63
HSP42Q12329 NOP1YDL014W 984 nt18.62■□□□□ 0.57
HSP42Q12329 NSR1YGR159C 1245 nt18.52■□□□□ 0.56
HSP42Q12329 YKL036CYKL036C 393 nt17.49■□□□□ 0.39
HSP42Q12329 YJL027CYJL027C 417 nt16.44■□□□□ 0.22
HSP42Q12329 Q0297Q0297 156 nt16.34■□□□□ 0.21
HSP42Q12329 SRX1YKL086W 384 nt16.22■□□□□ 0.19
HSP42Q12329 MDJ1YFL016C 1536 nt16.19■□□□□ 0.18
HSP42Q12329 SCS3YGL126W 1143 nt16.07■□□□□ 0.16
HSP42Q12329 YCR051WYCR051W 669 nt15.51■□□□□ 0.07
HSP42Q12329 YOL085CYOL085C 342 nt15.11■□□□□ 0.01
HSP42Q12329 PKP1YIL042C 1185 nt14.9□□□□□ -0.02
HSP42Q12329 RPP1BYDL130W 321 nt14.69□□□□□ -0.06
HSP42Q12329 SCJ1YMR214W 1134 nt14.65□□□□□ -0.06
HSP42Q12329 SSA3YBL075C 1950 nt14.55□□□□□ -0.08
HSP42Q12329 ATS1YAL020C 1002 nt14.48□□□□□ -0.09
HSP42Q12329 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.43□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 CCC1YLR220W 969 nt14.41□□□□□ -0.1
HSP42Q12329 DBP2YNL112W 1641 nt14.33□□□□□ -0.11
HSP42Q12329 YBR190WYBR190W 312 nt14.04□□□□□ -0.16
HSP42Q12329 SCR1SCR1 522 nt14.02□□□□□ -0.17
HSP42Q12329 PET122YER153C 765 nt13.99□□□□□ -0.17
HSP42Q12329 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.81□□□□□ -0.2
HSP42Q12329 RVS167YDR388W 1449 nt13.69□□□□□ -0.22
HSP42Q12329 RTC3YHR087W 336 nt13.66□□□□□ -0.22
HSP42Q12329 RRN5YLR141W 1092 nt13.66□□□□□ -0.22
HSP42Q12329 RSB1YOR049C 1065 nt13.52□□□□□ -0.25
HSP42Q12329 PUT4YOR348C 1884 nt13.38□□□□□ -0.27
HSP42Q12329 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.36□□□□□ -0.27
HSP42Q12329 SSA1YAL005C 1929 nt13.34□□□□□ -0.27
HSP42Q12329 PST2YDR032C 597 nt13.32□□□□□ -0.28
HSP42Q12329 YDJ1YNL064C 1230 nt13.32□□□□□ -0.28
HSP42Q12329 SHR5YOL110W 714 nt13.23□□□□□ -0.29
HSP42Q12329 Q0182Q0182 405 nt13.08□□□□□ -0.32
HSP42Q12329 GAR1YHR089C 618 nt13.05□□□□□ -0.32
HSP42Q12329 YKL097CYKL097C 411 nt13.05□□□□□ -0.32
HSP42Q12329 FPS1YLL043W 2010 nt12.99□□□□□ -0.33
HSP42Q12329 ARE1YCR048W 1833 nt12.88□□□□□ -0.35
HSP42Q12329 POA1YBR022W 534 nt12.88□□□□□ -0.35
HSP42Q12329 SPT5YML010W 3192 nt12.81□□□□□ -0.36
HSP42Q12329 DEP1YAL013W 1218 nt12.81□□□□□ -0.36
HSP42Q12329 BSC6YOL137W 1494 nt12.78□□□□□ -0.36
HSP42Q12329 SSA4YER103W 1929 nt12.77□□□□□ -0.37
HSP42Q12329 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.72□□□□□ -0.37
HSP42Q12329 SHU1YHL006C 453 nt12.71□□□□□ -0.37
HSP42Q12329 URN1YPR152C 1398 nt12.68□□□□□ -0.38
HSP42Q12329 NVJ2YPR091C 2313 nt12.65□□□□□ -0.39
HSP42Q12329 SAH1YER043C 1350 nt12.61□□□□□ -0.39
HSP42Q12329 RPN10YHR200W 807 nt12.6□□□□□ -0.39
HSP42Q12329 YNL208WYNL208W 600 nt12.6□□□□□ -0.39
HSP42Q12329 TIR1YER011W 765 nt12.56□□□□□ -0.4
HSP42Q12329 OPI9YLR338W 858 nt12.49□□□□□ -0.41
HSP42Q12329 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.47□□□□□ -0.41
HSP42Q12329 PAC11YDR488C 1602 nt12.45□□□□□ -0.42
HSP42Q12329 YOR139CYOR139C 393 nt12.39□□□□□ -0.43
HSP42Q12329 BDF1YLR399C 2061 nt12.38□□□□□ -0.43
HSP42Q12329 BUD23YCR047C 828 nt12.34□□□□□ -0.43
HSP42Q12329 NPL3YDR432W 1245 nt12.3□□□□□ -0.44
HSP42Q12329 TAT1YBR069C 1860 nt12.2□□□□□ -0.46
HSP42Q12329 YJR018WYJR018W 363 nt12.12□□□□□ -0.47
HSP42Q12329 PUN1YLR414C 792 nt12.12□□□□□ -0.47
HSP42Q12329 PTC2YER089C 1395 nt12.11□□□□□ -0.47
HSP42Q12329 SRB2YHR041C 633 nt12.11□□□□□ -0.47
HSP42Q12329 YGR021WYGR021W 873 nt12.1□□□□□ -0.47
HSP42Q12329 MEP2YNL142W 1500 nt12.08□□□□□ -0.48
HSP42Q12329 WWM1YFL010C 636 nt12.07□□□□□ -0.48
HSP42Q12329 MNP1YGL068W 585 nt12.07□□□□□ -0.48
HSP42Q12329 NAB2YGL122C 1578 nt12.07□□□□□ -0.48
HSP42Q12329 MOT3YMR070W 1473 nt12.07□□□□□ -0.48
HSP42Q12329 HOM6YJR139C 1080 nt12.04□□□□□ -0.48
HSP42Q12329 RPP2BYDR382W 333 nt12.02□□□□□ -0.49
HSP42Q12329 YOL037CYOL037C 354 nt12□□□□□ -0.49
HSP42Q12329 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.9□□□□□ -0.5
HSP42Q12329 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.9□□□□□ -0.5
HSP42Q12329 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.9□□□□□ -0.5
HSP42Q12329 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.9□□□□□ -0.5
HSP42Q12329 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.9□□□□□ -0.5
HSP42Q12329 YJR120WYJR120W 351 nt11.88□□□□□ -0.51
HSP42Q12329 RKM5YLR137W 1104 nt11.88□□□□□ -0.51
HSP42Q12329 RPM1RPM1 483 nt11.88□□□□□ -0.51
HSP42Q12329 DCW1YKL046C 1350 nt11.85□□□□□ -0.51
HSP42Q12329 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.85□□□□□ -0.51
HSP42Q12329 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
HSP42Q12329 BDH2YAL061W 1254 nt11.77□□□□□ -0.53
HSP42Q12329 DAL1YIR027C 1383 nt11.76□□□□□ -0.53
HSP42Q12329 YBR220CYBR220C 1683 nt11.75□□□□□ -0.53
HSP42Q12329 PUS2YGL063W 1113 nt11.75□□□□□ -0.53
HSP42Q12329 YPS1YLR120C 1710 nt11.72□□□□□ -0.53
HSP42Q12329 FPR4YLR449W 1179 nt11.69□□□□□ -0.54
HSP42Q12329 EMI2YDR516C 1503 nt11.69□□□□□ -0.54
HSP42Q12329 YLR281CYLR281C 468 nt11.68□□□□□ -0.54
HSP42Q12329 LSM3YLR438C-A 270 nt11.68□□□□□ -0.54
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