Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.09■□□□□ 0.81
TFB4Q12004 NSR1YGR159C 1245 nt19.86■□□□□ 0.77
TFB4Q12004 NOP1YDL014W 984 nt19.73■□□□□ 0.75
TFB4Q12004 YKL036CYKL036C 393 nt18.43■□□□□ 0.54
TFB4Q12004 Q0297Q0297 156 nt17.38■□□□□ 0.37
TFB4Q12004 SRX1YKL086W 384 nt17.25■□□□□ 0.35
TFB4Q12004 MDJ1YFL016C 1536 nt17.25■□□□□ 0.35
TFB4Q12004 YJL027CYJL027C 417 nt17.19■□□□□ 0.34
TFB4Q12004 SCS3YGL126W 1143 nt16.86■□□□□ 0.29
TFB4Q12004 YCR051WYCR051W 669 nt16.3■□□□□ 0.2
TFB4Q12004 YOL085CYOL085C 342 nt15.93■□□□□ 0.14
TFB4Q12004 PKP1YIL042C 1185 nt15.57■□□□□ 0.08
TFB4Q12004 RPP1BYDL130W 321 nt15.56■□□□□ 0.08
TFB4Q12004 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 DBP2YNL112W 1641 nt15.42■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 Q0182Q0182 405 nt15.4■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 SCJ1YMR214W 1134 nt15.4■□□□□ 0.06
TFB4Q12004 MOT3YMR070W 1473 nt15.32■□□□□ 0.04
TFB4Q12004 YGR139WYGR139W 339 nt15.26■□□□□ 0.03
TFB4Q12004 ATS1YAL020C 1002 nt15.17■□□□□ 0.02
TFB4Q12004 CCC1YLR220W 969 nt15.16■□□□□ 0.02
TFB4Q12004 SSA3YBL075C 1950 nt14.82□□□□□ -0.04
TFB4Q12004 PET122YER153C 765 nt14.78□□□□□ -0.04
TFB4Q12004 SCR1SCR1 522 nt14.75□□□□□ -0.05
TFB4Q12004 YBR190WYBR190W 312 nt14.75□□□□□ -0.05
TFB4Q12004 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.66□□□□□ -0.06
TFB4Q12004 RVS167YDR388W 1449 nt14.59□□□□□ -0.07
TFB4Q12004 NME1NME1 340 nt14.45□□□□□ -0.1
TFB4Q12004 RRN5YLR141W 1092 nt14.4□□□□□ -0.1
TFB4Q12004 RTC3YHR087W 336 nt14.34□□□□□ -0.11
TFB4Q12004 YDJ1YNL064C 1230 nt14.25□□□□□ -0.13
TFB4Q12004 SHR5YOL110W 714 nt14.16□□□□□ -0.14
TFB4Q12004 RSB1YOR049C 1065 nt14.16□□□□□ -0.14
TFB4Q12004 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.12□□□□□ -0.15
TFB4Q12004 PST2YDR032C 597 nt14.03□□□□□ -0.16
TFB4Q12004 CSM2YIL132C 642 nt13.81□□□□□ -0.2
TFB4Q12004 GAR1YHR089C 618 nt13.77□□□□□ -0.21
TFB4Q12004 YKL097CYKL097C 411 nt13.59□□□□□ -0.23
TFB4Q12004 DEP1YAL013W 1218 nt13.55□□□□□ -0.24
TFB4Q12004 URN1YPR152C 1398 nt13.55□□□□□ -0.24
TFB4Q12004 PAU21YOR394W 495 nt13.51□□□□□ -0.25
TFB4Q12004 PAU22YPL282C 495 nt13.51□□□□□ -0.25
TFB4Q12004 RPN10YHR200W 807 nt13.48□□□□□ -0.25
TFB4Q12004 YNL208WYNL208W 600 nt13.47□□□□□ -0.25
TFB4Q12004 ARO7YPR060C 771 nt13.39□□□□□ -0.27
TFB4Q12004 OPI9YLR338W 858 nt13.36□□□□□ -0.27
TFB4Q12004 SHU1YHL006C 453 nt13.35□□□□□ -0.27
TFB4Q12004 TIR1YER011W 765 nt13.34□□□□□ -0.27
TFB4Q12004 PUT4YOR348C 1884 nt13.25□□□□□ -0.29
TFB4Q12004 PAM17YKR065C 594 nt13.15□□□□□ -0.3
TFB4Q12004 SAH1YER043C 1350 nt13.13□□□□□ -0.31
TFB4Q12004 SSA1YAL005C 1929 nt13.09□□□□□ -0.31
TFB4Q12004 REG2YBR050C 1017 nt13.02□□□□□ -0.33
TFB4Q12004 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13□□□□□ -0.33
TFB4Q12004 PUN1YLR414C 792 nt12.99□□□□□ -0.33
TFB4Q12004 ARE1YCR048W 1833 nt12.98□□□□□ -0.33
TFB4Q12004 YOR139CYOR139C 393 nt12.98□□□□□ -0.33
TFB4Q12004 YJR018WYJR018W 363 nt12.97□□□□□ -0.33
TFB4Q12004 SRB2YHR041C 633 nt12.88□□□□□ -0.35
TFB4Q12004 POA1YBR022W 534 nt12.86□□□□□ -0.35
TFB4Q12004 YGR021WYGR021W 873 nt12.85□□□□□ -0.35
TFB4Q12004 NPL3YDR432W 1245 nt12.82□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 YJR120WYJR120W 351 nt12.81□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 RPP2BYDR382W 333 nt12.8□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 NVJ2YPR091C 2313 nt12.8□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 FPS1YLL043W 2010 nt12.79□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.79□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 HOM6YJR139C 1080 nt12.79□□□□□ -0.36
TFB4Q12004 WWM1YFL010C 636 nt12.76□□□□□ -0.37
TFB4Q12004 BUR6YER159C 429 nt12.73□□□□□ -0.37
TFB4Q12004 PTC2YER089C 1395 nt12.7□□□□□ -0.38
TFB4Q12004 YOL037CYOL037C 354 nt12.7□□□□□ -0.38
TFB4Q12004 MNP1YGL068W 585 nt12.68□□□□□ -0.38
TFB4Q12004 PAC11YDR488C 1602 nt12.68□□□□□ -0.38
TFB4Q12004 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.64□□□□□ -0.39
TFB4Q12004 BSC6YOL137W 1494 nt12.64□□□□□ -0.39
TFB4Q12004 BMT5YIL096C 1011 nt12.61□□□□□ -0.39
TFB4Q12004 BDH2YAL061W 1254 nt12.6□□□□□ -0.39
TFB4Q12004 Q0010Q0010 387 nt12.6□□□□□ -0.39
TFB4Q12004 RKM5YLR137W 1104 nt12.59□□□□□ -0.39
TFB4Q12004 NAB2YGL122C 1578 nt12.56□□□□□ -0.4
TFB4Q12004 YDR509WYDR509W 348 nt12.54□□□□□ -0.4
TFB4Q12004 INM2YDR287W 879 nt12.53□□□□□ -0.4
TFB4Q12004 LSM3YLR438C-A 270 nt12.52□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 BUD23YCR047C 828 nt12.51□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.48□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.48□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.48□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.48□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.48□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 ARA2YMR041C 1008 nt12.48□□□□□ -0.41
TFB4Q12004 MET8YBR213W 825 nt12.44□□□□□ -0.42
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