Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.07■■□□□ 1.12
SLX4Q12098 NSR1YGR159C 1245 nt21.94■■□□□ 1.1
SLX4Q12098 NOP1YDL014W 984 nt21.4■■□□□ 1.02
SLX4Q12098 YKL036CYKL036C 393 nt19.79■□□□□ 0.76
SLX4Q12098 MDJ1YFL016C 1536 nt19.54■□□□□ 0.72
SLX4Q12098 Q0297Q0297 156 nt18.8■□□□□ 0.6
SLX4Q12098 SRX1YKL086W 384 nt18.76■□□□□ 0.59
SLX4Q12098 YJL027CYJL027C 417 nt18.46■□□□□ 0.55
SLX4Q12098 SCS3YGL126W 1143 nt18.04■□□□□ 0.48
SLX4Q12098 YCR051WYCR051W 669 nt17.77■□□□□ 0.44
SLX4Q12098 DBP2YNL112W 1641 nt17.33■□□□□ 0.37
SLX4Q12098 YOL085CYOL085C 342 nt17.18■□□□□ 0.34
SLX4Q12098 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.99■□□□□ 0.31
SLX4Q12098 PKP1YIL042C 1185 nt16.92■□□□□ 0.3
SLX4Q12098 RPP1BYDL130W 321 nt16.86■□□□□ 0.29
SLX4Q12098 CCC1YLR220W 969 nt16.79■□□□□ 0.28
SLX4Q12098 YBR190WYBR190W 312 nt16.62■□□□□ 0.25
SLX4Q12098 RTC3YHR087W 336 nt16.22■□□□□ 0.19
SLX4Q12098 SCJ1YMR214W 1134 nt16.2■□□□□ 0.18
SLX4Q12098 RVS167YDR388W 1449 nt16.15■□□□□ 0.18
SLX4Q12098 PET122YER153C 765 nt16.14■□□□□ 0.17
SLX4Q12098 ATS1YAL020C 1002 nt16.13■□□□□ 0.17
SLX4Q12098 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.07■□□□□ 0.16
SLX4Q12098 SCR1SCR1 522 nt15.87■□□□□ 0.13
SLX4Q12098 RRN5YLR141W 1092 nt15.67■□□□□ 0.1
SLX4Q12098 SHR5YOL110W 714 nt15.64■□□□□ 0.09
SLX4Q12098 YDJ1YNL064C 1230 nt15.52■□□□□ 0.08
SLX4Q12098 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.37■□□□□ 0.05
SLX4Q12098 SSA3YBL075C 1950 nt15.36■□□□□ 0.05
SLX4Q12098 RSB1YOR049C 1065 nt15.3■□□□□ 0.04
SLX4Q12098 DEP1YAL013W 1218 nt15.23■□□□□ 0.03
SLX4Q12098 URN1YPR152C 1398 nt15.22■□□□□ 0.03
SLX4Q12098 GAR1YHR089C 618 nt15.18■□□□□ 0.02
SLX4Q12098 PUT4YOR348C 1884 nt15.16■□□□□ 0.02
SLX4Q12098 OPI9YLR338W 858 nt15□□□□□ -0.01
SLX4Q12098 PST2YDR032C 597 nt14.96□□□□□ -0.01
SLX4Q12098 YNL208WYNL208W 600 nt14.95□□□□□ -0.02
SLX4Q12098 SAH1YER043C 1350 nt14.93□□□□□ -0.02
SLX4Q12098 RPN10YHR200W 807 nt14.91□□□□□ -0.02
SLX4Q12098 ARE1YCR048W 1833 nt14.89□□□□□ -0.03
SLX4Q12098 TIR1YER011W 765 nt14.67□□□□□ -0.06
SLX4Q12098 POA1YBR022W 534 nt14.66□□□□□ -0.06
SLX4Q12098 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.65□□□□□ -0.06
SLX4Q12098 Q0182Q0182 405 nt14.57□□□□□ -0.08
SLX4Q12098 SSA1YAL005C 1929 nt14.54□□□□□ -0.08
SLX4Q12098 PUN1YLR414C 792 nt14.53□□□□□ -0.08
SLX4Q12098 YJR018WYJR018W 363 nt14.51□□□□□ -0.09
SLX4Q12098 PTC2YER089C 1395 nt14.39□□□□□ -0.11
SLX4Q12098 YJR120WYJR120W 351 nt14.39□□□□□ -0.11
SLX4Q12098 SRB2YHR041C 633 nt14.38□□□□□ -0.11
SLX4Q12098 SHU1YHL006C 453 nt14.36□□□□□ -0.11
SLX4Q12098 BSC6YOL137W 1494 nt14.34□□□□□ -0.11
SLX4Q12098 YKL097CYKL097C 411 nt14.3□□□□□ -0.12
SLX4Q12098 BUD23YCR047C 828 nt14.29□□□□□ -0.12
SLX4Q12098 NAB2YGL122C 1578 nt14.19□□□□□ -0.14
SLX4Q12098 RPP2BYDR382W 333 nt14.15□□□□□ -0.14
SLX4Q12098 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.15□□□□□ -0.14
SLX4Q12098 WWM1YFL010C 636 nt14.06□□□□□ -0.16
SLX4Q12098 FIS1YIL065C 468 nt14.04□□□□□ -0.16
SLX4Q12098 DAL1YIR027C 1383 nt14□□□□□ -0.17
SLX4Q12098 INM2YDR287W 879 nt13.97□□□□□ -0.17
SLX4Q12098 FPR4YLR449W 1179 nt13.95□□□□□ -0.18
SLX4Q12098 BDH2YAL061W 1254 nt13.93□□□□□ -0.18
SLX4Q12098 HOM6YJR139C 1080 nt13.92□□□□□ -0.18
SLX4Q12098 MOT3YMR070W 1473 nt13.92□□□□□ -0.18
SLX4Q12098 YGR021WYGR021W 873 nt13.9□□□□□ -0.18
SLX4Q12098 PHO4YFR034C 939 nt13.89□□□□□ -0.19
SLX4Q12098 MNP1YGL068W 585 nt13.86□□□□□ -0.19
SLX4Q12098 YBL100CYBL100C 315 nt13.86□□□□□ -0.19
SLX4Q12098 YOR139CYOR139C 393 nt13.82□□□□□ -0.2
SLX4Q12098 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.78□□□□□ -0.2
SLX4Q12098 SPT5YML010W 3192 nt13.77□□□□□ -0.21
SLX4Q12098 LSM3YLR438C-A 270 nt13.74□□□□□ -0.21
SLX4Q12098 FUN26YAL022C 1554 nt13.71□□□□□ -0.22
SLX4Q12098 RKM5YLR137W 1104 nt13.7□□□□□ -0.22
SLX4Q12098 TRM9YML014W 840 nt13.64□□□□□ -0.23
SLX4Q12098 YPS1YLR120C 1710 nt13.63□□□□□ -0.23
SLX4Q12098 NPL3YDR432W 1245 nt13.6□□□□□ -0.23
SLX4Q12098 YOL037CYOL037C 354 nt13.56□□□□□ -0.24
SLX4Q12098 CCT6YDR188W 1641 nt13.55□□□□□ -0.24
SLX4Q12098 YDR095CYDR095C 411 nt13.54□□□□□ -0.24
SLX4Q12098 MEP2YNL142W 1500 nt13.46□□□□□ -0.25
SLX4Q12098 ALF1YNL148C 765 nt13.45□□□□□ -0.26
SLX4Q12098 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.43□□□□□ -0.26
SLX4Q12098 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.36□□□□□ -0.27
SLX4Q12098 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.36□□□□□ -0.27
SLX4Q12098 SIS1YNL007C 1059 nt13.33□□□□□ -0.28
SLX4Q12098 YLR281CYLR281C 468 nt13.31□□□□□ -0.28
SLX4Q12098 PTP1YDL230W 1008 nt13.3□□□□□ -0.28
SLX4Q12098 DCW1YKL046C 1350 nt13.29□□□□□ -0.28
SLX4Q12098 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.27□□□□□ -0.29
SLX4Q12098 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.27□□□□□ -0.29
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