Protein–RNA interactions for Protein: P38788

SSZ1, Ribosome-associated complex subunit SSZ1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSZ1P38788 NSR1YGR159C 1245 nt18.72■□□□□ 0.59
SSZ1P38788 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.22■□□□□ 0.51
SSZ1P38788 NOP1YDL014W 984 nt17.53■□□□□ 0.4
SSZ1P38788 MDJ1YFL016C 1536 nt17.1■□□□□ 0.33
SSZ1P38788 YJL027CYJL027C 417 nt15.76■□□□□ 0.11
SSZ1P38788 YKL036CYKL036C 393 nt15.6■□□□□ 0.09
SSZ1P38788 SRX1YKL086W 384 nt15.32■□□□□ 0.04
SSZ1P38788 Q0297Q0297 156 nt15.18■□□□□ 0.02
SSZ1P38788 SSA3YBL075C 1950 nt15.09■□□□□ 0.01
SSZ1P38788 DBP2YNL112W 1641 nt14.94□□□□□ -0.02
SSZ1P38788 YBR190WYBR190W 312 nt14.81□□□□□ -0.04
SSZ1P38788 YCR051WYCR051W 669 nt14.42□□□□□ -0.1
SSZ1P38788 RTC3YHR087W 336 nt14.37□□□□□ -0.11
SSZ1P38788 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.21□□□□□ -0.13
SSZ1P38788 CCC1YLR220W 969 nt13.97□□□□□ -0.17
SSZ1P38788 RVS167YDR388W 1449 nt13.9□□□□□ -0.18
SSZ1P38788 PUT4YOR348C 1884 nt13.9□□□□□ -0.18
SSZ1P38788 SCS3YGL126W 1143 nt13.87□□□□□ -0.19
SSZ1P38788 SCJ1YMR214W 1134 nt13.68□□□□□ -0.22
SSZ1P38788 RPP1BYDL130W 321 nt13.59□□□□□ -0.23
SSZ1P38788 YOL085CYOL085C 342 nt13.53□□□□□ -0.24
SSZ1P38788 ARE1YCR048W 1833 nt13.45□□□□□ -0.26
SSZ1P38788 POA1YBR022W 534 nt13.37□□□□□ -0.27
SSZ1P38788 PKP1YIL042C 1185 nt13.33□□□□□ -0.28
SSZ1P38788 SHR5YOL110W 714 nt13.29□□□□□ -0.28
SSZ1P38788 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.26□□□□□ -0.29
SSZ1P38788 URN1YPR152C 1398 nt13.26□□□□□ -0.29
SSZ1P38788 SAH1YER043C 1350 nt13.25□□□□□ -0.29
SSZ1P38788 OPI9YLR338W 858 nt13.23□□□□□ -0.29
SSZ1P38788 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.22□□□□□ -0.29
SSZ1P38788 BSC6YOL137W 1494 nt13.22□□□□□ -0.29
SSZ1P38788 SPT5YML010W 3192 nt13.14□□□□□ -0.31
SSZ1P38788 PET122YER153C 765 nt13.04□□□□□ -0.32
SSZ1P38788 DEP1YAL013W 1218 nt13.03□□□□□ -0.32
SSZ1P38788 SSA4YER103W 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
SSZ1P38788 Q0182Q0182 405 nt12.96□□□□□ -0.33
SSZ1P38788 RPN10YHR200W 807 nt12.96□□□□□ -0.33
SSZ1P38788 BUD23YCR047C 828 nt12.87□□□□□ -0.35
SSZ1P38788 PUN1YLR414C 792 nt12.85□□□□□ -0.35
SSZ1P38788 YDJ1YNL064C 1230 nt12.85□□□□□ -0.35
SSZ1P38788 PAC11YDR488C 1602 nt12.84□□□□□ -0.35
SSZ1P38788 YNL208WYNL208W 600 nt12.83□□□□□ -0.36
SSZ1P38788 NVJ2YPR091C 2313 nt12.8□□□□□ -0.36
SSZ1P38788 PTC2YER089C 1395 nt12.74□□□□□ -0.37
SSZ1P38788 SCR1SCR1 522 nt12.74□□□□□ -0.37
SSZ1P38788 NAB2YGL122C 1578 nt12.69□□□□□ -0.38
SSZ1P38788 YJR018WYJR018W 363 nt12.63□□□□□ -0.39
SSZ1P38788 BDF1YLR399C 2061 nt12.6□□□□□ -0.39
SSZ1P38788 FPS1YLL043W 2010 nt12.6□□□□□ -0.39
SSZ1P38788 RRN5YLR141W 1092 nt12.59□□□□□ -0.39
SSZ1P38788 MOT3YMR070W 1473 nt12.58□□□□□ -0.4
SSZ1P38788 GAR1YHR089C 618 nt12.57□□□□□ -0.4
SSZ1P38788 MEP2YNL142W 1500 nt12.5□□□□□ -0.41
SSZ1P38788 FIS1YIL065C 468 nt12.46□□□□□ -0.41
SSZ1P38788 DAL1YIR027C 1383 nt12.41□□□□□ -0.42
SSZ1P38788 TAT1YBR069C 1860 nt12.4□□□□□ -0.42
SSZ1P38788 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.35□□□□□ -0.43
SSZ1P38788 YJR120WYJR120W 351 nt12.32□□□□□ -0.44
SSZ1P38788 PHO4YFR034C 939 nt12.29□□□□□ -0.44
SSZ1P38788 FPR4YLR449W 1179 nt12.29□□□□□ -0.44
SSZ1P38788 INM2YDR287W 879 nt12.28□□□□□ -0.44
SSZ1P38788 YPS1YLR120C 1710 nt12.28□□□□□ -0.44
SSZ1P38788 DCW1YKL046C 1350 nt12.25□□□□□ -0.45
SSZ1P38788 SSA1YAL005C 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
SSZ1P38788 ATS1YAL020C 1002 nt12.24□□□□□ -0.45
SSZ1P38788 RPP2BYDR382W 333 nt12.21□□□□□ -0.45
SSZ1P38788 TIR1YER011W 765 nt12.21□□□□□ -0.45
SSZ1P38788 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.14□□□□□ -0.47
SSZ1P38788 RSB1YOR049C 1065 nt12.13□□□□□ -0.47
SSZ1P38788 YDR095CYDR095C 411 nt12.12□□□□□ -0.47
SSZ1P38788 EMI2YDR516C 1503 nt12.09□□□□□ -0.47
SSZ1P38788 YBR220CYBR220C 1683 nt12.09□□□□□ -0.47
SSZ1P38788 YMR090WYMR090W 684 nt12.07□□□□□ -0.48
SSZ1P38788 YBL100CYBL100C 315 nt12.03□□□□□ -0.48
SSZ1P38788 YDL221WYDL221W 552 nt11.96□□□□□ -0.49
SSZ1P38788 SDH1YKL148C 1923 nt11.94□□□□□ -0.5
SSZ1P38788 PTP1YDL230W 1008 nt11.9□□□□□ -0.5
SSZ1P38788 BDH2YAL061W 1254 nt11.89□□□□□ -0.51
SSZ1P38788 CAC2YML102W 1407 nt11.88□□□□□ -0.51
SSZ1P38788 RPP2AYOL039W 321 nt11.88□□□□□ -0.51
SSZ1P38788 FUN26YAL022C 1554 nt11.88□□□□□ -0.51
SSZ1P38788 SRB2YHR041C 633 nt11.84□□□□□ -0.51
SSZ1P38788 ALF1YNL148C 765 nt11.82□□□□□ -0.52
SSZ1P38788 YJL225CYJL225C 5277 nt11.81□□□□□ -0.52
SSZ1P38788 UME6YDR207C 2511 nt11.8□□□□□ -0.52
SSZ1P38788 SEC11YIR022W 504 nt11.78□□□□□ -0.52
SSZ1P38788 PCH2YBR186W 1695 nt11.78□□□□□ -0.52
SSZ1P38788 SCC4YER147C 1875 nt11.76□□□□□ -0.53
SSZ1P38788 GUT2YIL155C 1950 nt11.74□□□□□ -0.53
SSZ1P38788 TRM9YML014W 840 nt11.74□□□□□ -0.53
SSZ1P38788 IRC15YPL017C 1500 nt11.72□□□□□ -0.53
SSZ1P38788 SIS1YNL007C 1059 nt11.7□□□□□ -0.54
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