Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

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Length 1,176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.53■□□□□ 0.56
AVO1Q08236 NSR1YGR159C 1245 nt18.46■□□□□ 0.55
AVO1Q08236 NOP1YDL014W 984 nt17.97■□□□□ 0.47
AVO1Q08236 MDJ1YFL016C 1536 nt16.5■□□□□ 0.23
AVO1Q08236 YKL036CYKL036C 393 nt16.5■□□□□ 0.23
AVO1Q08236 SRX1YKL086W 384 nt15.69■□□□□ 0.1
AVO1Q08236 Q0297Q0297 156 nt15.68■□□□□ 0.1
AVO1Q08236 YJL027CYJL027C 417 nt15.4■□□□□ 0.06
AVO1Q08236 SCS3YGL126W 1143 nt14.97□□□□□ -0.01
AVO1Q08236 YCR051WYCR051W 669 nt14.9□□□□□ -0.02
AVO1Q08236 DBP2YNL112W 1641 nt14.53□□□□□ -0.08
AVO1Q08236 SSA3YBL075C 1950 nt14.36□□□□□ -0.11
AVO1Q08236 YOL085CYOL085C 342 nt14.28□□□□□ -0.12
AVO1Q08236 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.24□□□□□ -0.13
AVO1Q08236 CCC1YLR220W 969 nt14.11□□□□□ -0.15
AVO1Q08236 PKP1YIL042C 1185 nt14.09□□□□□ -0.15
AVO1Q08236 RPP1BYDL130W 321 nt14.08□□□□□ -0.16
AVO1Q08236 YBR190WYBR190W 312 nt14.07□□□□□ -0.16
AVO1Q08236 RTC3YHR087W 336 nt13.79□□□□□ -0.2
AVO1Q08236 RVS167YDR388W 1449 nt13.68□□□□□ -0.22
AVO1Q08236 SCJ1YMR214W 1134 nt13.59□□□□□ -0.23
AVO1Q08236 PET122YER153C 765 nt13.47□□□□□ -0.25
AVO1Q08236 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.44□□□□□ -0.26
AVO1Q08236 ATS1YAL020C 1002 nt13.35□□□□□ -0.27
AVO1Q08236 SCR1SCR1 522 nt13.31□□□□□ -0.28
AVO1Q08236 SHR5YOL110W 714 nt13.17□□□□□ -0.3
AVO1Q08236 Q0182Q0182 405 nt13.16□□□□□ -0.3
AVO1Q08236 RRN5YLR141W 1092 nt13.06□□□□□ -0.32
AVO1Q08236 SSA1YAL005C 1929 nt13.03□□□□□ -0.32
AVO1Q08236 YDJ1YNL064C 1230 nt13□□□□□ -0.33
AVO1Q08236 FPS1YLL043W 2010 nt12.88□□□□□ -0.35
AVO1Q08236 MOT3YMR070W 1473 nt12.88□□□□□ -0.35
AVO1Q08236 URN1YPR152C 1398 nt12.86□□□□□ -0.35
AVO1Q08236 DEP1YAL013W 1218 nt12.84□□□□□ -0.35
AVO1Q08236 PUT4YOR348C 1884 nt12.82□□□□□ -0.36
AVO1Q08236 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.8□□□□□ -0.36
AVO1Q08236 RSB1YOR049C 1065 nt12.79□□□□□ -0.36
AVO1Q08236 GAR1YHR089C 618 nt12.74□□□□□ -0.37
AVO1Q08236 NVJ2YPR091C 2313 nt12.69□□□□□ -0.38
AVO1Q08236 OPI9YLR338W 858 nt12.68□□□□□ -0.38
AVO1Q08236 RPN10YHR200W 807 nt12.67□□□□□ -0.38
AVO1Q08236 SAH1YER043C 1350 nt12.63□□□□□ -0.39
AVO1Q08236 YNL208WYNL208W 600 nt12.62□□□□□ -0.39
AVO1Q08236 ARE1YCR048W 1833 nt12.58□□□□□ -0.4
AVO1Q08236 PAC11YDR488C 1602 nt12.46□□□□□ -0.41
AVO1Q08236 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.45□□□□□ -0.42
AVO1Q08236 POA1YBR022W 534 nt12.43□□□□□ -0.42
AVO1Q08236 PST2YDR032C 597 nt12.36□□□□□ -0.43
AVO1Q08236 PUN1YLR414C 792 nt12.32□□□□□ -0.44
AVO1Q08236 TIR1YER011W 765 nt12.31□□□□□ -0.44
AVO1Q08236 YJR018WYJR018W 363 nt12.26□□□□□ -0.45
AVO1Q08236 BSC6YOL137W 1494 nt12.19□□□□□ -0.46
AVO1Q08236 PTC2YER089C 1395 nt12.18□□□□□ -0.46
AVO1Q08236 BUD23YCR047C 828 nt12.16□□□□□ -0.46
AVO1Q08236 YJR120WYJR120W 351 nt12.04□□□□□ -0.48
AVO1Q08236 NAB2YGL122C 1578 nt12.02□□□□□ -0.49
AVO1Q08236 RPP2BYDR382W 333 nt12□□□□□ -0.49
AVO1Q08236 SRB2YHR041C 633 nt11.95□□□□□ -0.5
AVO1Q08236 SHU1YHL006C 453 nt11.9□□□□□ -0.5
AVO1Q08236 FIS1YIL065C 468 nt11.87□□□□□ -0.51
AVO1Q08236 YKL097CYKL097C 411 nt11.86□□□□□ -0.51
AVO1Q08236 DAL1YIR027C 1383 nt11.86□□□□□ -0.51
AVO1Q08236 FPR4YLR449W 1179 nt11.85□□□□□ -0.51
AVO1Q08236 INM2YDR287W 879 nt11.83□□□□□ -0.52
AVO1Q08236 PHO4YFR034C 939 nt11.76□□□□□ -0.53
AVO1Q08236 WWM1YFL010C 636 nt11.75□□□□□ -0.53
AVO1Q08236 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.75□□□□□ -0.53
AVO1Q08236 BDH2YAL061W 1254 nt11.73□□□□□ -0.53
AVO1Q08236 YBL100CYBL100C 315 nt11.71□□□□□ -0.53
AVO1Q08236 YGR021WYGR021W 873 nt11.67□□□□□ -0.54
AVO1Q08236 UME6YDR207C 2511 nt11.64□□□□□ -0.55
AVO1Q08236 SSA4YER103W 1929 nt11.63□□□□□ -0.55
AVO1Q08236 HOM6YJR139C 1080 nt11.61□□□□□ -0.55
AVO1Q08236 SPT5YML010W 3192 nt11.6□□□□□ -0.55
AVO1Q08236 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.57□□□□□ -0.56
AVO1Q08236 FUN26YAL022C 1554 nt11.57□□□□□ -0.56
AVO1Q08236 MNP1YGL068W 585 nt11.56□□□□□ -0.56
AVO1Q08236 LSM3YLR438C-A 270 nt11.55□□□□□ -0.56
AVO1Q08236 YPS1YLR120C 1710 nt11.54□□□□□ -0.56
AVO1Q08236 TRM9YML014W 840 nt11.53□□□□□ -0.56
AVO1Q08236 NME1NME1 340 nt11.5□□□□□ -0.57
AVO1Q08236 BDF1YLR399C 2061 nt11.48□□□□□ -0.57
AVO1Q08236 YDR095CYDR095C 411 nt11.47□□□□□ -0.57
AVO1Q08236 RKM5YLR137W 1104 nt11.45□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 YGR139WYGR139W 339 nt11.44□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.44□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 ALF1YNL148C 765 nt11.44□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 MEP2YNL142W 1500 nt11.44□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 CCT6YDR188W 1641 nt11.41□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 RPM1RPM1 483 nt11.4□□□□□ -0.58
AVO1Q08236 YOR139CYOR139C 393 nt11.38□□□□□ -0.59
AVO1Q08236 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.34□□□□□ -0.59
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