Protein–RNA interactions for Protein: P24784

DBP1, ATP-dependent RNA helicase DBP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DBP1P24784 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.83■■□□□ 1.25
DBP1P24784 NOP1YDL014W 984 nt22.39■■□□□ 1.17
DBP1P24784 NSR1YGR159C 1245 nt22.26■■□□□ 1.15
DBP1P24784 YKL036CYKL036C 393 nt21.17■□□□□ 0.98
DBP1P24784 YJL027CYJL027C 417 nt19.85■□□□□ 0.77
DBP1P24784 Q0297Q0297 156 nt19.8■□□□□ 0.76
DBP1P24784 SRX1YKL086W 384 nt19.59■□□□□ 0.73
DBP1P24784 SCS3YGL126W 1143 nt19.53■□□□□ 0.72
DBP1P24784 MDJ1YFL016C 1536 nt19.28■□□□□ 0.68
DBP1P24784 YCR051WYCR051W 669 nt18.63■□□□□ 0.57
DBP1P24784 YOL085CYOL085C 342 nt18.34■□□□□ 0.53
DBP1P24784 PKP1YIL042C 1185 nt18.01■□□□□ 0.47
DBP1P24784 SCJ1YMR214W 1134 nt17.94■□□□□ 0.46
DBP1P24784 RPP1BYDL130W 321 nt17.77■□□□□ 0.44
DBP1P24784 ATS1YAL020C 1002 nt17.63■□□□□ 0.41
DBP1P24784 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.41■□□□□ 0.38
DBP1P24784 DBP2YNL112W 1641 nt17.29■□□□□ 0.36
DBP1P24784 CCC1YLR220W 969 nt17.26■□□□□ 0.35
DBP1P24784 YGR139WYGR139W 339 nt17.04■□□□□ 0.32
DBP1P24784 PET122YER153C 765 nt16.92■□□□□ 0.3
DBP1P24784 SCR1SCR1 522 nt16.85■□□□□ 0.29
DBP1P24784 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.65■□□□□ 0.26
DBP1P24784 RRN5YLR141W 1092 nt16.5■□□□□ 0.23
DBP1P24784 RTC3YHR087W 336 nt16.33■□□□□ 0.2
DBP1P24784 RVS167YDR388W 1449 nt16.31■□□□□ 0.2
DBP1P24784 RSB1YOR049C 1065 nt16.29■□□□□ 0.2
DBP1P24784 YBR190WYBR190W 312 nt16.29■□□□□ 0.2
DBP1P24784 PST2YDR032C 597 nt16.25■□□□□ 0.19
DBP1P24784 MOT3YMR070W 1473 nt16.2■□□□□ 0.18
DBP1P24784 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.18■□□□□ 0.18
DBP1P24784 YDJ1YNL064C 1230 nt16.1■□□□□ 0.17
DBP1P24784 Q0182Q0182 405 nt16.09■□□□□ 0.17
DBP1P24784 SHR5YOL110W 714 nt15.89■□□□□ 0.13
DBP1P24784 YKL097CYKL097C 411 nt15.85■□□□□ 0.13
DBP1P24784 NME1NME1 340 nt15.73■□□□□ 0.11
DBP1P24784 GAR1YHR089C 618 nt15.66■□□□□ 0.1
DBP1P24784 SHU1YHL006C 453 nt15.47■□□□□ 0.07
DBP1P24784 CSM2YIL132C 642 nt15.32■□□□□ 0.04
DBP1P24784 DEP1YAL013W 1218 nt15.3■□□□□ 0.04
DBP1P24784 YOR139CYOR139C 393 nt15.15■□□□□ 0.02
DBP1P24784 URN1YPR152C 1398 nt15.14■□□□□ 0.01
DBP1P24784 PAU21YOR394W 495 nt15.13■□□□□ 0.01
DBP1P24784 PAU22YPL282C 495 nt15.13■□□□□ 0.01
DBP1P24784 TIR1YER011W 765 nt15.11■□□□□ 0.01
DBP1P24784 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.09■□□□□ 0.01
DBP1P24784 YNL208WYNL208W 600 nt15.08■□□□□ 0
DBP1P24784 VAR1Q0140 1197 nt15□□□□□ -0.01
DBP1P24784 RPN10YHR200W 807 nt15□□□□□ -0.01
DBP1P24784 ARO7YPR060C 771 nt14.95□□□□□ -0.02
DBP1P24784 NPL3YDR432W 1245 nt14.87□□□□□ -0.03
DBP1P24784 SSA1YAL005C 1929 nt14.84□□□□□ -0.03
DBP1P24784 PAM17YKR065C 594 nt14.81□□□□□ -0.04
DBP1P24784 OPI9YLR338W 858 nt14.81□□□□□ -0.04
DBP1P24784 YDR509WYDR509W 348 nt14.75□□□□□ -0.05
DBP1P24784 SRB2YHR041C 633 nt14.72□□□□□ -0.05
DBP1P24784 REG2YBR050C 1017 nt14.64□□□□□ -0.07
DBP1P24784 SAH1YER043C 1350 nt14.6□□□□□ -0.07
DBP1P24784 MNP1YGL068W 585 nt14.59□□□□□ -0.07
DBP1P24784 HOM6YJR139C 1080 nt14.59□□□□□ -0.07
DBP1P24784 YGR021WYGR021W 873 nt14.58□□□□□ -0.08
DBP1P24784 WWM1YFL010C 636 nt14.55□□□□□ -0.08
DBP1P24784 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.54□□□□□ -0.08
DBP1P24784 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.54□□□□□ -0.08
DBP1P24784 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.54□□□□□ -0.08
DBP1P24784 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.54□□□□□ -0.08
DBP1P24784 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.54□□□□□ -0.08
DBP1P24784 YOL037CYOL037C 354 nt14.52□□□□□ -0.09
DBP1P24784 YJR018WYJR018W 363 nt14.48□□□□□ -0.09
DBP1P24784 PUT4YOR348C 1884 nt14.41□□□□□ -0.1
DBP1P24784 BUR6YER159C 429 nt14.4□□□□□ -0.1
DBP1P24784 BMT5YIL096C 1011 nt14.39□□□□□ -0.11
DBP1P24784 YJR120WYJR120W 351 nt14.39□□□□□ -0.11
DBP1P24784 RKM5YLR137W 1104 nt14.37□□□□□ -0.11
DBP1P24784 PUN1YLR414C 792 nt14.37□□□□□ -0.11
DBP1P24784 ARE1YCR048W 1833 nt14.31□□□□□ -0.12
DBP1P24784 RPP2BYDR382W 333 nt14.29□□□□□ -0.12
DBP1P24784 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.28□□□□□ -0.12
DBP1P24784 Q0144Q0144 330 nt14.24□□□□□ -0.13
DBP1P24784 PUS2YGL063W 1113 nt14.22□□□□□ -0.13
DBP1P24784 Q0010Q0010 387 nt14.22□□□□□ -0.13
DBP1P24784 SSA3YBL075C 1950 nt14.21□□□□□ -0.13
DBP1P24784 YLR281CYLR281C 468 nt14.2□□□□□ -0.14
DBP1P24784 BDH2YAL061W 1254 nt14.13□□□□□ -0.15
DBP1P24784 PTC2YER089C 1395 nt14.12□□□□□ -0.15
DBP1P24784 SEM1YDR363W-A 270 nt14.12□□□□□ -0.15
DBP1P24784 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.11□□□□□ -0.15
DBP1P24784 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt14.07□□□□□ -0.16
DBP1P24784 WHI5YOR083W 888 nt14.07□□□□□ -0.16
DBP1P24784 LSM3YLR438C-A 270 nt14.04□□□□□ -0.16
DBP1P24784 POA1YBR022W 534 nt14.02□□□□□ -0.17
DBP1P24784 SRN2YLR119W 642 nt14□□□□□ -0.17
DBP1P24784 BSC6YOL137W 1494 nt13.95□□□□□ -0.18
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