Protein–RNA interactions for Protein: Q12118

SGT2, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SGT2Q12118 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.08■■□□□ 1.13
SGT2Q12118 NSR1YGR159C 1245 nt21.83■■□□□ 1.09
SGT2Q12118 NOP1YDL014W 984 nt21.53■■□□□ 1.04
SGT2Q12118 YKL036CYKL036C 393 nt19.95■□□□□ 0.78
SGT2Q12118 MDJ1YFL016C 1536 nt19.25■□□□□ 0.67
SGT2Q12118 Q0297Q0297 156 nt18.83■□□□□ 0.6
SGT2Q12118 SRX1YKL086W 384 nt18.78■□□□□ 0.6
SGT2Q12118 YJL027CYJL027C 417 nt18.67■□□□□ 0.58
SGT2Q12118 SCS3YGL126W 1143 nt18.18■□□□□ 0.5
SGT2Q12118 YCR051WYCR051W 669 nt17.88■□□□□ 0.45
SGT2Q12118 YOL085CYOL085C 342 nt17.27■□□□□ 0.36
SGT2Q12118 DBP2YNL112W 1641 nt17.03■□□□□ 0.32
SGT2Q12118 PKP1YIL042C 1185 nt17.01■□□□□ 0.31
SGT2Q12118 RPP1BYDL130W 321 nt16.92■□□□□ 0.3
SGT2Q12118 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.88■□□□□ 0.29
SGT2Q12118 CCC1YLR220W 969 nt16.8■□□□□ 0.28
SGT2Q12118 YBR190WYBR190W 312 nt16.4■□□□□ 0.22
SGT2Q12118 ATS1YAL020C 1002 nt16.32■□□□□ 0.2
SGT2Q12118 SCJ1YMR214W 1134 nt16.25■□□□□ 0.19
SGT2Q12118 RVS167YDR388W 1449 nt16.14■□□□□ 0.17
SGT2Q12118 PET122YER153C 765 nt16.13■□□□□ 0.17
SGT2Q12118 RTC3YHR087W 336 nt16.1■□□□□ 0.17
SGT2Q12118 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.05■□□□□ 0.16
SGT2Q12118 SCR1SCR1 522 nt16.05■□□□□ 0.16
SGT2Q12118 RRN5YLR141W 1092 nt15.72■□□□□ 0.11
SGT2Q12118 SHR5YOL110W 714 nt15.57■□□□□ 0.08
SGT2Q12118 YDJ1YNL064C 1230 nt15.5■□□□□ 0.07
SGT2Q12118 RSB1YOR049C 1065 nt15.44■□□□□ 0.06
SGT2Q12118 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.39■□□□□ 0.05
SGT2Q12118 SSA3YBL075C 1950 nt15.34■□□□□ 0.05
SGT2Q12118 GAR1YHR089C 618 nt15.18■□□□□ 0.02
SGT2Q12118 DEP1YAL013W 1218 nt15.12■□□□□ 0.01
SGT2Q12118 PST2YDR032C 597 nt15.07■□□□□ 0
SGT2Q12118 URN1YPR152C 1398 nt15.07■□□□□ 0
SGT2Q12118 RPN10YHR200W 807 nt14.9□□□□□ -0.02
SGT2Q12118 YNL208WYNL208W 600 nt14.89□□□□□ -0.03
SGT2Q12118 OPI9YLR338W 858 nt14.81□□□□□ -0.04
SGT2Q12118 PUT4YOR348C 1884 nt14.74□□□□□ -0.05
SGT2Q12118 SAH1YER043C 1350 nt14.69□□□□□ -0.06
SGT2Q12118 TIR1YER011W 765 nt14.65□□□□□ -0.06
SGT2Q12118 YKL097CYKL097C 411 nt14.57□□□□□ -0.08
SGT2Q12118 ARE1YCR048W 1833 nt14.52□□□□□ -0.08
SGT2Q12118 SHU1YHL006C 453 nt14.43□□□□□ -0.1
SGT2Q12118 SSA1YAL005C 1929 nt14.41□□□□□ -0.1
SGT2Q12118 YJR018WYJR018W 363 nt14.4□□□□□ -0.1
SGT2Q12118 PUN1YLR414C 792 nt14.4□□□□□ -0.1
SGT2Q12118 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.36□□□□□ -0.11
SGT2Q12118 POA1YBR022W 534 nt14.36□□□□□ -0.11
SGT2Q12118 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.22□□□□□ -0.13
SGT2Q12118 PTC2YER089C 1395 nt14.21□□□□□ -0.14
SGT2Q12118 RPP2BYDR382W 333 nt14.17□□□□□ -0.14
SGT2Q12118 SRB2YHR041C 633 nt14.15□□□□□ -0.14
SGT2Q12118 BUD23YCR047C 828 nt14.1□□□□□ -0.15
SGT2Q12118 YJR120WYJR120W 351 nt14.1□□□□□ -0.15
SGT2Q12118 WWM1YFL010C 636 nt14.02□□□□□ -0.17
SGT2Q12118 NAB2YGL122C 1578 nt14□□□□□ -0.17
SGT2Q12118 BSC6YOL137W 1494 nt13.99□□□□□ -0.17
SGT2Q12118 YGR021WYGR021W 873 nt13.97□□□□□ -0.17
SGT2Q12118 YOR139CYOR139C 393 nt13.91□□□□□ -0.18
SGT2Q12118 HOM6YJR139C 1080 nt13.9□□□□□ -0.18
SGT2Q12118 INM2YDR287W 879 nt13.88□□□□□ -0.19
SGT2Q12118 FPR4YLR449W 1179 nt13.87□□□□□ -0.19
SGT2Q12118 BDH2YAL061W 1254 nt13.86□□□□□ -0.19
SGT2Q12118 MNP1YGL068W 585 nt13.85□□□□□ -0.19
SGT2Q12118 NPL3YDR432W 1245 nt13.84□□□□□ -0.19
SGT2Q12118 DAL1YIR027C 1383 nt13.83□□□□□ -0.19
SGT2Q12118 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.78□□□□□ -0.2
SGT2Q12118 YBL100CYBL100C 315 nt13.75□□□□□ -0.21
SGT2Q12118 FIS1YIL065C 468 nt13.74□□□□□ -0.21
SGT2Q12118 LSM3YLR438C-A 270 nt13.72□□□□□ -0.21
SGT2Q12118 RKM5YLR137W 1104 nt13.71□□□□□ -0.21
SGT2Q12118 PHO4YFR034C 939 nt13.68□□□□□ -0.22
SGT2Q12118 YOL037CYOL037C 354 nt13.68□□□□□ -0.22
SGT2Q12118 TRM9YML014W 840 nt13.63□□□□□ -0.23
SGT2Q12118 FUN26YAL022C 1554 nt13.58□□□□□ -0.23
SGT2Q12118 ALF1YNL148C 765 nt13.41□□□□□ -0.26
SGT2Q12118 CCT6YDR188W 1641 nt13.41□□□□□ -0.26
SGT2Q12118 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.39□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.39□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.39□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.39□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.39□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 YPS1YLR120C 1710 nt13.36□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 YLR281CYLR281C 468 nt13.36□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 SSA4YER103W 1929 nt13.36□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.34□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.34□□□□□ -0.27
SGT2Q12118 SPT5YML010W 3192 nt13.33□□□□□ -0.28
SGT2Q12118 WHI5YOR083W 888 nt13.32□□□□□ -0.28
SGT2Q12118 PUS2YGL063W 1113 nt13.31□□□□□ -0.28
SGT2Q12118 YDR095CYDR095C 411 nt13.29□□□□□ -0.28
SGT2Q12118 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.26□□□□□ -0.29
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