Protein–RNA interactions for Protein: Q04228

UBX2, UBX domain-containing protein 2, yeastyeast

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Length 584 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX2Q04228 YML009W-BYML009W-B 477 nt24.81■■□□□ 1.56
UBX2Q04228 NOP1YDL014W 984 nt24.32■■□□□ 1.48
UBX2Q04228 NSR1YGR159C 1245 nt24.22■■□□□ 1.47
UBX2Q04228 YKL036CYKL036C 393 nt22.81■■□□□ 1.24
UBX2Q04228 YJL027CYJL027C 417 nt21.41■■□□□ 1.02
UBX2Q04228 Q0297Q0297 156 nt21.33■■□□□ 1.01
UBX2Q04228 SRX1YKL086W 384 nt21.18■□□□□ 0.98
UBX2Q04228 MDJ1YFL016C 1536 nt21.09■□□□□ 0.97
UBX2Q04228 SCS3YGL126W 1143 nt20.93■□□□□ 0.94
UBX2Q04228 YCR051WYCR051W 669 nt20.2■□□□□ 0.82
UBX2Q04228 YOL085CYOL085C 342 nt19.69■□□□□ 0.74
UBX2Q04228 PKP1YIL042C 1185 nt19.38■□□□□ 0.69
UBX2Q04228 RPP1BYDL130W 321 nt19.17■□□□□ 0.66
UBX2Q04228 SCJ1YMR214W 1134 nt19.1■□□□□ 0.65
UBX2Q04228 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.87■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 ATS1YAL020C 1002 nt18.84■□□□□ 0.61
UBX2Q04228 CCC1YLR220W 969 nt18.76■□□□□ 0.59
UBX2Q04228 DBP2YNL112W 1641 nt18.74■□□□□ 0.59
UBX2Q04228 SCR1SCR1 522 nt18.27■□□□□ 0.52
UBX2Q04228 PET122YER153C 765 nt18.25■□□□□ 0.51
UBX2Q04228 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt18.02■□□□□ 0.48
UBX2Q04228 RVS167YDR388W 1449 nt17.92■□□□□ 0.46
UBX2Q04228 YBR190WYBR190W 312 nt17.87■□□□□ 0.45
UBX2Q04228 RRN5YLR141W 1092 nt17.78■□□□□ 0.44
UBX2Q04228 RSB1YOR049C 1065 nt17.61■□□□□ 0.41
UBX2Q04228 RTC3YHR087W 336 nt17.59■□□□□ 0.41
UBX2Q04228 YDJ1YNL064C 1230 nt17.42■□□□□ 0.38
UBX2Q04228 YER088W-BYER088W-B 147 nt17.41■□□□□ 0.38
UBX2Q04228 PST2YDR032C 597 nt17.33■□□□□ 0.36
UBX2Q04228 SHR5YOL110W 714 nt17.32■□□□□ 0.36
UBX2Q04228 GAR1YHR089C 618 nt17.01■□□□□ 0.31
UBX2Q04228 YKL097CYKL097C 411 nt16.98■□□□□ 0.31
UBX2Q04228 DEP1YAL013W 1218 nt16.7■□□□□ 0.26
UBX2Q04228 URN1YPR152C 1398 nt16.57■□□□□ 0.24
UBX2Q04228 SHU1YHL006C 453 nt16.54■□□□□ 0.24
UBX2Q04228 RPN10YHR200W 807 nt16.51■□□□□ 0.23
UBX2Q04228 YNL208WYNL208W 600 nt16.5■□□□□ 0.23
UBX2Q04228 TIR1YER011W 765 nt16.39■□□□□ 0.21
UBX2Q04228 OPI9YLR338W 858 nt16.21■□□□□ 0.19
UBX2Q04228 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt16.17■□□□□ 0.18
UBX2Q04228 YOR139CYOR139C 393 nt16.11■□□□□ 0.17
UBX2Q04228 SSA1YAL005C 1929 nt16.05■□□□□ 0.16
UBX2Q04228 NPL3YDR432W 1245 nt16.01■□□□□ 0.15
UBX2Q04228 SSA3YBL075C 1950 nt16■□□□□ 0.15
UBX2Q04228 SAH1YER043C 1350 nt15.99■□□□□ 0.15
UBX2Q04228 YJR018WYJR018W 363 nt15.84■□□□□ 0.13
UBX2Q04228 YGR021WYGR021W 873 nt15.83■□□□□ 0.12
UBX2Q04228 PUT4YOR348C 1884 nt15.8■□□□□ 0.12
UBX2Q04228 PUN1YLR414C 792 nt15.8■□□□□ 0.12
UBX2Q04228 SRB2YHR041C 633 nt15.79■□□□□ 0.12
UBX2Q04228 MNP1YGL068W 585 nt15.74■□□□□ 0.11
UBX2Q04228 WWM1YFL010C 636 nt15.73■□□□□ 0.11
UBX2Q04228 HOM6YJR139C 1080 nt15.73■□□□□ 0.11
UBX2Q04228 RPP2BYDR382W 333 nt15.72■□□□□ 0.11
UBX2Q04228 YOL037CYOL037C 354 nt15.7■□□□□ 0.1
UBX2Q04228 ARE1YCR048W 1833 nt15.66■□□□□ 0.1
UBX2Q04228 YJR120WYJR120W 351 nt15.56■□□□□ 0.08
UBX2Q04228 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.55■□□□□ 0.08
UBX2Q04228 RKM5YLR137W 1104 nt15.52■□□□□ 0.08
UBX2Q04228 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt15.5■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 PTC2YER089C 1395 nt15.49■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt15.46■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 IMT4tM(CAU)E 72 nt15.46■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 IMT3tM(CAU)J3 72 nt15.46■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 IMT1tM(CAU)O1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 IMT2tM(CAU)P 72 nt15.46■□□□□ 0.07
UBX2Q04228 POA1YBR022W 534 nt15.42■□□□□ 0.06
UBX2Q04228 BDH2YAL061W 1254 nt15.39■□□□□ 0.05
UBX2Q04228 BUD23YCR047C 828 nt15.28■□□□□ 0.04
UBX2Q04228 PUS2YGL063W 1113 nt15.27■□□□□ 0.04
UBX2Q04228 LSM3YLR438C-A 270 nt15.27■□□□□ 0.04
UBX2Q04228 INM2YDR287W 879 nt15.23■□□□□ 0.03
UBX2Q04228 NAB2YGL122C 1578 nt15.23■□□□□ 0.03
UBX2Q04228 YLR281CYLR281C 468 nt15.22■□□□□ 0.03
UBX2Q04228 FPR4YLR449W 1179 nt15.18■□□□□ 0.02
UBX2Q04228 YBL100CYBL100C 315 nt15.16■□□□□ 0.02
UBX2Q04228 WHI5YOR083W 888 nt15.14■□□□□ 0.01
UBX2Q04228 DAL1YIR027C 1383 nt15.12■□□□□ 0.01
UBX2Q04228 MOT3YMR070W 1473 nt15.08■□□□□ 0
UBX2Q04228 TRM9YML014W 840 nt15.07■□□□□ 0
UBX2Q04228 FIS1YIL065C 468 nt15.02■□□□□ -0
UBX2Q04228 BSC6YOL137W 1494 nt15□□□□□ -0.01
UBX2Q04228 PHO4YFR034C 939 nt14.97□□□□□ -0.01
UBX2Q04228 FUN26YAL022C 1554 nt14.97□□□□□ -0.01
UBX2Q04228 FMP45YDL222C 930 nt14.91□□□□□ -0.02
UBX2Q04228 DSK2YMR276W 1122 nt14.89□□□□□ -0.03
UBX2Q04228 IMP2'YIL154C 1041 nt14.86□□□□□ -0.03
UBX2Q04228 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.83□□□□□ -0.04
UBX2Q04228 CCT6YDR188W 1641 nt14.83□□□□□ -0.04
UBX2Q04228 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.76□□□□□ -0.05
UBX2Q04228 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.76□□□□□ -0.05
UBX2Q04228 YCH1YGR203W 447 nt14.76□□□□□ -0.05
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