RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W STB6P36085 766 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W DAD2P36162 133 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W YBL028CP38202 106 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W LTP1P40347 161 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W THI6P41835 540 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W ZIM17P42844 174 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W BST1P43571 1029 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W MNT2P53059 558 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W RAI1P53063 387 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W MDR1P53258 950 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W BRE5P53741 515 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W YNR071CP53757 342 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W YSA1Q01976 231 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W YKR011CQ02209 353 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W HOT1Q03213 719 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W MGR3Q04472 501 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W RCO1Q04779 684 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W THI22Q06490 572 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W YLR040CQ07988 224 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W THI21Q08975 551 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W RIM20Q12033 661 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W NUS1Q12063 375 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W GET3Q12154 354 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W MDM20Q12387 796 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa4.28□□□□□ -1.72
PIR3YKL163W HOM2P13663 365 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YCK1P23291 538 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W GRR1P24814 1151 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W RRP43P25359 394 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W POT1P27796 417 aaKnown RBP RIP-Chip data4.27□□□□□ -1.73not detected
PIR3YKL163W SWC3P31376 625 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ARP2P32381 391 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W NIP100P33420 868 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W UBP11P36026 717 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W APN2P38207 520 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W MIP6P38760 659 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W AFG3P39925 761 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W MKT1P40850 830 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W CUL3P53202 744 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ARP5P53946 755 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W HDA1P53973 706 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ERV25P54837 211 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SLU7Q02775 382 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W MDY2Q12285 212 aa4.27□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SNF3P10870 884 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W BIK1P11709 440 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PHO84P25297 587 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PAP1P29468 568 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W RPD3P32561 433 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W OAR1P35731 278 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PTK1P36002 662 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SUL1P38359 859 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YHR033WP38690 423 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W GND1P38720 489 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W OTU2P38747 307 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SMF1P38925 575 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W LYS9P38999 446 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PFK26P40433 827 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YIL161WP40449 235 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YIR042CP40586 236 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SKP2P42843 763 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W KEL2P50090 882 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W COG1P53079 417 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PEF1P53238 335 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W TOF1P53840 1238 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ALF1P53904 254 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ARP4P80428 489 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W RRN5Q02983 363 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W RAD30Q04049 632 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PPN1Q04119 674 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YLR456WQ06199 204 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SKG3Q06315 1026 aa4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W TUS1Q06412 1307 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W RPB2P08518 1224 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W CPR2P23285 205 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YCR051WP25631 222 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W MSP1P28737 362 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W MRP20P32387 263 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W GCD7P32502 381 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PPQ1P32945 549 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W REG2P38232 338 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W SIF2P38262 535 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W GDT1P38301 280 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W REV7P38927 245 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W EFR3Q03653 782 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W INM2Q05533 292 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YPR172WQ06608 200 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W ENT4Q07872 247 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W YOL073CQ08232 322 aa4.25□□□□□ -1.73
PIR3YKL163W PCL8Q08966 492 aa4.25□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 99.3 ms