Protein–RNA interactions for Protein: P53063

RAI1, Decapping nuclease RAI1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAI1P53063 NSR1YGR159C 1245 nt17.96■□□□□ 0.47
RAI1P53063 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.44■□□□□ 0.38
RAI1P53063 NOP1YDL014W 984 nt16.65■□□□□ 0.26
RAI1P53063 MDJ1YFL016C 1536 nt16.62■□□□□ 0.25
RAI1P53063 YJL027CYJL027C 417 nt15.24■□□□□ 0.03
RAI1P53063 YKL036CYKL036C 393 nt14.74□□□□□ -0.05
RAI1P53063 SRX1YKL086W 384 nt14.58□□□□□ -0.08
RAI1P53063 DBP2YNL112W 1641 nt14.48□□□□□ -0.09
RAI1P53063 SSA3YBL075C 1950 nt14.44□□□□□ -0.1
RAI1P53063 Q0297Q0297 156 nt14.4□□□□□ -0.1
RAI1P53063 YBR190WYBR190W 312 nt14.34□□□□□ -0.11
RAI1P53063 RTC3YHR087W 336 nt13.95□□□□□ -0.18
RAI1P53063 YCR051WYCR051W 669 nt13.76□□□□□ -0.21
RAI1P53063 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.62□□□□□ -0.23
RAI1P53063 PUT4YOR348C 1884 nt13.61□□□□□ -0.23
RAI1P53063 CCC1YLR220W 969 nt13.45□□□□□ -0.26
RAI1P53063 RVS167YDR388W 1449 nt13.34□□□□□ -0.27
RAI1P53063 SCJ1YMR214W 1134 nt13.22□□□□□ -0.29
RAI1P53063 ARE1YCR048W 1833 nt13.14□□□□□ -0.31
RAI1P53063 POA1YBR022W 534 nt13.1□□□□□ -0.31
RAI1P53063 SCS3YGL126W 1143 nt13.08□□□□□ -0.32
RAI1P53063 SPT5YML010W 3192 nt12.97□□□□□ -0.33
RAI1P53063 BSC6YOL137W 1494 nt12.95□□□□□ -0.34
RAI1P53063 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.94□□□□□ -0.34
RAI1P53063 RPP1BYDL130W 321 nt12.91□□□□□ -0.34
RAI1P53063 SAH1YER043C 1350 nt12.91□□□□□ -0.34
RAI1P53063 URN1YPR152C 1398 nt12.83□□□□□ -0.36
RAI1P53063 YOL085CYOL085C 342 nt12.82□□□□□ -0.36
RAI1P53063 OPI9YLR338W 858 nt12.8□□□□□ -0.36
RAI1P53063 SSA4YER103W 1929 nt12.79□□□□□ -0.36
RAI1P53063 Q0182Q0182 405 nt12.76□□□□□ -0.37
RAI1P53063 SHR5YOL110W 714 nt12.75□□□□□ -0.37
RAI1P53063 PKP1YIL042C 1185 nt12.71□□□□□ -0.37
RAI1P53063 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.65□□□□□ -0.38
RAI1P53063 DEP1YAL013W 1218 nt12.64□□□□□ -0.39
RAI1P53063 BUD23YCR047C 828 nt12.56□□□□□ -0.4
RAI1P53063 PET122YER153C 765 nt12.44□□□□□ -0.42
RAI1P53063 MOT3YMR070W 1473 nt12.44□□□□□ -0.42
RAI1P53063 RPN10YHR200W 807 nt12.42□□□□□ -0.42
RAI1P53063 BDF1YLR399C 2061 nt12.41□□□□□ -0.42
RAI1P53063 PUN1YLR414C 792 nt12.39□□□□□ -0.43
RAI1P53063 PTC2YER089C 1395 nt12.39□□□□□ -0.43
RAI1P53063 YNL208WYNL208W 600 nt12.33□□□□□ -0.44
RAI1P53063 NAB2YGL122C 1578 nt12.3□□□□□ -0.44
RAI1P53063 MEP2YNL142W 1500 nt12.23□□□□□ -0.45
RAI1P53063 YDJ1YNL064C 1230 nt12.23□□□□□ -0.45
RAI1P53063 TAT1YBR069C 1860 nt12.21□□□□□ -0.46
RAI1P53063 YJR018WYJR018W 363 nt12.19□□□□□ -0.46
RAI1P53063 FIS1YIL065C 468 nt12.1□□□□□ -0.47
RAI1P53063 GAR1YHR089C 618 nt12.07□□□□□ -0.48
RAI1P53063 SCR1SCR1 522 nt12.05□□□□□ -0.48
RAI1P53063 DCW1YKL046C 1350 nt12.05□□□□□ -0.48
RAI1P53063 RRN5YLR141W 1092 nt12.01□□□□□ -0.49
RAI1P53063 DAL1YIR027C 1383 nt12.01□□□□□ -0.49
RAI1P53063 FPR4YLR449W 1179 nt11.95□□□□□ -0.5
RAI1P53063 YPS1YLR120C 1710 nt11.94□□□□□ -0.5
RAI1P53063 PAC11YDR488C 1602 nt11.93□□□□□ -0.5
RAI1P53063 YJR120WYJR120W 351 nt11.93□□□□□ -0.5
RAI1P53063 PHO4YFR034C 939 nt11.92□□□□□ -0.5
RAI1P53063 YBR220CYBR220C 1683 nt11.89□□□□□ -0.51
RAI1P53063 EMI2YDR516C 1503 nt11.84□□□□□ -0.51
RAI1P53063 INM2YDR287W 879 nt11.83□□□□□ -0.52
RAI1P53063 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.81□□□□□ -0.52
RAI1P53063 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.77□□□□□ -0.53
RAI1P53063 YDR095CYDR095C 411 nt11.75□□□□□ -0.53
RAI1P53063 YMR090WYMR090W 684 nt11.75□□□□□ -0.53
RAI1P53063 SSA1YAL005C 1929 nt11.74□□□□□ -0.53
RAI1P53063 RPP2BYDR382W 333 nt11.71□□□□□ -0.53
RAI1P53063 TIR1YER011W 765 nt11.7□□□□□ -0.54
RAI1P53063 SDH1YKL148C 1923 nt11.69□□□□□ -0.54
RAI1P53063 YDL221WYDL221W 552 nt11.69□□□□□ -0.54
RAI1P53063 CAC2YML102W 1407 nt11.64□□□□□ -0.55
RAI1P53063 NVJ2YPR091C 2313 nt11.63□□□□□ -0.55
RAI1P53063 PTP1YDL230W 1008 nt11.61□□□□□ -0.55
RAI1P53063 YBL100CYBL100C 315 nt11.61□□□□□ -0.55
RAI1P53063 PCH2YBR186W 1695 nt11.6□□□□□ -0.55
RAI1P53063 FPS1YLL043W 2010 nt11.59□□□□□ -0.55
RAI1P53063 GUT2YIL155C 1950 nt11.58□□□□□ -0.56
RAI1P53063 RPP2AYOL039W 321 nt11.52□□□□□ -0.57
RAI1P53063 RSB1YOR049C 1065 nt11.51□□□□□ -0.57
RAI1P53063 SCC4YER147C 1875 nt11.51□□□□□ -0.57
RAI1P53063 SEC11YIR022W 504 nt11.5□□□□□ -0.57
RAI1P53063 ATS1YAL020C 1002 nt11.5□□□□□ -0.57
RAI1P53063 FUN26YAL022C 1554 nt11.47□□□□□ -0.57
RAI1P53063 IRC15YPL017C 1500 nt11.47□□□□□ -0.57
RAI1P53063 SRB2YHR041C 633 nt11.46□□□□□ -0.57
RAI1P53063 PIB2YGL023C 1908 nt11.44□□□□□ -0.58
RAI1P53063 BDH2YAL061W 1254 nt11.4□□□□□ -0.58
RAI1P53063 ALF1YNL148C 765 nt11.4□□□□□ -0.58
RAI1P53063 GIS3YLR094C 1509 nt11.4□□□□□ -0.59
RAI1P53063 YSC84YHR016C 1407 nt11.33□□□□□ -0.6
RAI1P53063 SIS1YNL007C 1059 nt11.31□□□□□ -0.6
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