Protein–RNA interactions for Protein: Q12063

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, yeastyeast

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUS1Q12063 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.34■□□□□ 0.85
NUS1Q12063 NSR1YGR159C 1245 nt20.29■□□□□ 0.84
NUS1Q12063 NOP1YDL014W 984 nt19.72■□□□□ 0.75
NUS1Q12063 MDJ1YFL016C 1536 nt18.13■□□□□ 0.49
NUS1Q12063 YKL036CYKL036C 393 nt18.12■□□□□ 0.49
NUS1Q12063 Q0297Q0297 156 nt17.25■□□□□ 0.35
NUS1Q12063 SRX1YKL086W 384 nt17.24■□□□□ 0.35
NUS1Q12063 YJL027CYJL027C 417 nt16.89■□□□□ 0.29
NUS1Q12063 SCS3YGL126W 1143 nt16.44■□□□□ 0.22
NUS1Q12063 YCR051WYCR051W 669 nt16.35■□□□□ 0.21
NUS1Q12063 DBP2YNL112W 1641 nt16.01■□□□□ 0.15
NUS1Q12063 YOL085CYOL085C 342 nt15.71■□□□□ 0.11
NUS1Q12063 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.66■□□□□ 0.1
NUS1Q12063 CCC1YLR220W 969 nt15.49■□□□□ 0.07
NUS1Q12063 RPP1BYDL130W 321 nt15.48■□□□□ 0.07
NUS1Q12063 PKP1YIL042C 1185 nt15.48■□□□□ 0.07
NUS1Q12063 YBR190WYBR190W 312 nt15.47■□□□□ 0.07
NUS1Q12063 RTC3YHR087W 336 nt15.11■□□□□ 0.01
NUS1Q12063 RVS167YDR388W 1449 nt15□□□□□ -0.01
NUS1Q12063 SCJ1YMR214W 1134 nt14.94□□□□□ -0.02
NUS1Q12063 PET122YER153C 765 nt14.81□□□□□ -0.04
NUS1Q12063 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.78□□□□□ -0.04
NUS1Q12063 ATS1YAL020C 1002 nt14.68□□□□□ -0.06
NUS1Q12063 SCR1SCR1 522 nt14.6□□□□□ -0.07
NUS1Q12063 SHR5YOL110W 714 nt14.47□□□□□ -0.09
NUS1Q12063 RRN5YLR141W 1092 nt14.36□□□□□ -0.11
NUS1Q12063 YDJ1YNL064C 1230 nt14.3□□□□□ -0.12
NUS1Q12063 PUT4YOR348C 1884 nt14.13□□□□□ -0.15
NUS1Q12063 URN1YPR152C 1398 nt14.12□□□□□ -0.15
NUS1Q12063 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.09□□□□□ -0.15
NUS1Q12063 DEP1YAL013W 1218 nt14.09□□□□□ -0.15
NUS1Q12063 RSB1YOR049C 1065 nt14.03□□□□□ -0.16
NUS1Q12063 GAR1YHR089C 618 nt13.99□□□□□ -0.17
NUS1Q12063 OPI9YLR338W 858 nt13.94□□□□□ -0.18
NUS1Q12063 SAH1YER043C 1350 nt13.88□□□□□ -0.19
NUS1Q12063 RPN10YHR200W 807 nt13.88□□□□□ -0.19
NUS1Q12063 YNL208WYNL208W 600 nt13.86□□□□□ -0.19
NUS1Q12063 ARE1YCR048W 1833 nt13.85□□□□□ -0.19
NUS1Q12063 POA1YBR022W 534 nt13.68□□□□□ -0.22
NUS1Q12063 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.67□□□□□ -0.22
NUS1Q12063 PST2YDR032C 597 nt13.61□□□□□ -0.23
NUS1Q12063 PUN1YLR414C 792 nt13.53□□□□□ -0.24
NUS1Q12063 TIR1YER011W 765 nt13.52□□□□□ -0.25
NUS1Q12063 SSA3YBL075C 1950 nt13.5□□□□□ -0.25
NUS1Q12063 YJR018WYJR018W 363 nt13.46□□□□□ -0.25
NUS1Q12063 BSC6YOL137W 1494 nt13.41□□□□□ -0.26
NUS1Q12063 SSA1YAL005C 1929 nt13.39□□□□□ -0.27
NUS1Q12063 PTC2YER089C 1395 nt13.38□□□□□ -0.27
NUS1Q12063 BUD23YCR047C 828 nt13.34□□□□□ -0.27
NUS1Q12063 YJR120WYJR120W 351 nt13.27□□□□□ -0.29
NUS1Q12063 NAB2YGL122C 1578 nt13.21□□□□□ -0.29
NUS1Q12063 SRB2YHR041C 633 nt13.17□□□□□ -0.3
NUS1Q12063 RPP2BYDR382W 333 nt13.15□□□□□ -0.3
NUS1Q12063 SHU1YHL006C 453 nt13.09□□□□□ -0.31
NUS1Q12063 FIS1YIL065C 468 nt13.05□□□□□ -0.32
NUS1Q12063 DAL1YIR027C 1383 nt13.04□□□□□ -0.32
NUS1Q12063 YKL097CYKL097C 411 nt13.01□□□□□ -0.33
NUS1Q12063 INM2YDR287W 879 nt12.99□□□□□ -0.33
NUS1Q12063 FPR4YLR449W 1179 nt12.99□□□□□ -0.33
NUS1Q12063 WWM1YFL010C 636 nt12.92□□□□□ -0.34
NUS1Q12063 PHO4YFR034C 939 nt12.92□□□□□ -0.34
NUS1Q12063 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.92□□□□□ -0.34
NUS1Q12063 BDH2YAL061W 1254 nt12.89□□□□□ -0.35
NUS1Q12063 YBL100CYBL100C 315 nt12.86□□□□□ -0.35
NUS1Q12063 SPT5YML010W 3192 nt12.84□□□□□ -0.35
NUS1Q12063 YGR021WYGR021W 873 nt12.8□□□□□ -0.36
NUS1Q12063 HOM6YJR139C 1080 nt12.77□□□□□ -0.37
NUS1Q12063 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.71□□□□□ -0.37
NUS1Q12063 FUN26YAL022C 1554 nt12.71□□□□□ -0.37
NUS1Q12063 MNP1YGL068W 585 nt12.7□□□□□ -0.38
NUS1Q12063 LSM3YLR438C-A 270 nt12.7□□□□□ -0.38
NUS1Q12063 YPS1YLR120C 1710 nt12.69□□□□□ -0.38
NUS1Q12063 TRM9YML014W 840 nt12.65□□□□□ -0.38
NUS1Q12063 YDR095CYDR095C 411 nt12.61□□□□□ -0.39
NUS1Q12063 MEP2YNL142W 1500 nt12.58□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 RKM5YLR137W 1104 nt12.58□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 Q0182Q0182 405 nt12.55□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.55□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 CCT6YDR188W 1641 nt12.54□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 ALF1YNL148C 765 nt12.53□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 YOR139CYOR139C 393 nt12.53□□□□□ -0.4
NUS1Q12063 YOL037CYOL037C 354 nt12.44□□□□□ -0.42
NUS1Q12063 NPL3YDR432W 1245 nt12.43□□□□□ -0.42
NUS1Q12063 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.43□□□□□ -0.42
NUS1Q12063 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.43□□□□□ -0.42
NUS1Q12063 DCW1YKL046C 1350 nt12.41□□□□□ -0.42
NUS1Q12063 SSA4YER103W 1929 nt12.4□□□□□ -0.42
NUS1Q12063 SIS1YNL007C 1059 nt12.36□□□□□ -0.43
NUS1Q12063 RPP2AYOL039W 321 nt12.36□□□□□ -0.43
NUS1Q12063 PTP1YDL230W 1008 nt12.34□□□□□ -0.43
NUS1Q12063 CAC2YML102W 1407 nt12.25□□□□□ -0.45
NUS1Q12063 EMI2YDR516C 1503 nt12.24□□□□□ -0.45
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