Protein–RNA interactions for Protein: P38690

YHR033W, Uncharacterized protein YHR033W, yeastyeast

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR033WP38690 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.81■□□□□ 0.76
YHR033WP38690 NSR1YGR159C 1245 nt19.54■□□□□ 0.72
YHR033WP38690 NOP1YDL014W 984 nt19.35■□□□□ 0.69
YHR033WP38690 YKL036CYKL036C 393 nt17.99■□□□□ 0.47
YHR033WP38690 MDJ1YFL016C 1536 nt17.16■□□□□ 0.34
YHR033WP38690 Q0297Q0297 156 nt16.96■□□□□ 0.31
YHR033WP38690 SRX1YKL086W 384 nt16.88■□□□□ 0.29
YHR033WP38690 YJL027CYJL027C 417 nt16.83■□□□□ 0.28
YHR033WP38690 SCS3YGL126W 1143 nt16.42■□□□□ 0.22
YHR033WP38690 YCR051WYCR051W 669 nt16.04■□□□□ 0.16
YHR033WP38690 YOL085CYOL085C 342 nt15.55■□□□□ 0.08
YHR033WP38690 PKP1YIL042C 1185 nt15.3■□□□□ 0.04
YHR033WP38690 DBP2YNL112W 1641 nt15.22■□□□□ 0.03
YHR033WP38690 RPP1BYDL130W 321 nt15.22■□□□□ 0.03
YHR033WP38690 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
YHR033WP38690 CCC1YLR220W 969 nt15.02■□□□□ -0
YHR033WP38690 SCJ1YMR214W 1134 nt14.8□□□□□ -0.04
YHR033WP38690 ATS1YAL020C 1002 nt14.74□□□□□ -0.05
YHR033WP38690 YBR190WYBR190W 312 nt14.62□□□□□ -0.07
YHR033WP38690 PET122YER153C 765 nt14.51□□□□□ -0.09
YHR033WP38690 SCR1SCR1 522 nt14.46□□□□□ -0.09
YHR033WP38690 RVS167YDR388W 1449 nt14.44□□□□□ -0.1
YHR033WP38690 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.39□□□□□ -0.11
YHR033WP38690 RTC3YHR087W 336 nt14.32□□□□□ -0.12
YHR033WP38690 RRN5YLR141W 1092 nt14.12□□□□□ -0.15
YHR033WP38690 YDJ1YNL064C 1230 nt13.94□□□□□ -0.18
YHR033WP38690 SHR5YOL110W 714 nt13.94□□□□□ -0.18
YHR033WP38690 RSB1YOR049C 1065 nt13.9□□□□□ -0.18
YHR033WP38690 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.83□□□□□ -0.2
YHR033WP38690 PST2YDR032C 597 nt13.62□□□□□ -0.23
YHR033WP38690 SSA3YBL075C 1950 nt13.62□□□□□ -0.23
YHR033WP38690 PUT4YOR348C 1884 nt13.61□□□□□ -0.23
YHR033WP38690 GAR1YHR089C 618 nt13.59□□□□□ -0.23
YHR033WP38690 DEP1YAL013W 1218 nt13.47□□□□□ -0.25
YHR033WP38690 URN1YPR152C 1398 nt13.45□□□□□ -0.26
YHR033WP38690 RPN10YHR200W 807 nt13.33□□□□□ -0.28
YHR033WP38690 YNL208WYNL208W 600 nt13.31□□□□□ -0.28
YHR033WP38690 ARE1YCR048W 1833 nt13.25□□□□□ -0.29
YHR033WP38690 OPI9YLR338W 858 nt13.22□□□□□ -0.29
YHR033WP38690 YKL097CYKL097C 411 nt13.2□□□□□ -0.3
YHR033WP38690 SAH1YER043C 1350 nt13.15□□□□□ -0.3
YHR033WP38690 POA1YBR022W 534 nt13.14□□□□□ -0.31
YHR033WP38690 TIR1YER011W 765 nt13.13□□□□□ -0.31
YHR033WP38690 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.04□□□□□ -0.32
YHR033WP38690 SHU1YHL006C 453 nt13.02□□□□□ -0.33
YHR033WP38690 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
YHR033WP38690 SSA1YAL005C 1929 nt12.91□□□□□ -0.34
YHR033WP38690 PUN1YLR414C 792 nt12.86□□□□□ -0.35
YHR033WP38690 YJR018WYJR018W 363 nt12.85□□□□□ -0.35
YHR033WP38690 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.77□□□□□ -0.37
YHR033WP38690 BUD23YCR047C 828 nt12.73□□□□□ -0.37
YHR033WP38690 Q0182Q0182 405 nt12.7□□□□□ -0.38
YHR033WP38690 SPT5YML010W 3192 nt12.68□□□□□ -0.38
YHR033WP38690 RPP2BYDR382W 333 nt12.67□□□□□ -0.38
YHR033WP38690 SRB2YHR041C 633 nt12.67□□□□□ -0.38
YHR033WP38690 PTC2YER089C 1395 nt12.65□□□□□ -0.38
YHR033WP38690 YJR120WYJR120W 351 nt12.61□□□□□ -0.39
YHR033WP38690 YGR021WYGR021W 873 nt12.59□□□□□ -0.39
YHR033WP38690 YOR139CYOR139C 393 nt12.59□□□□□ -0.39
YHR033WP38690 WWM1YFL010C 636 nt12.56□□□□□ -0.4
YHR033WP38690 NPL3YDR432W 1245 nt12.52□□□□□ -0.41
YHR033WP38690 HOM6YJR139C 1080 nt12.51□□□□□ -0.41
YHR033WP38690 NAB2YGL122C 1578 nt12.51□□□□□ -0.41
YHR033WP38690 MNP1YGL068W 585 nt12.46□□□□□ -0.41
YHR033WP38690 BDH2YAL061W 1254 nt12.41□□□□□ -0.42
YHR033WP38690 INM2YDR287W 879 nt12.39□□□□□ -0.43
YHR033WP38690 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.39□□□□□ -0.43
YHR033WP38690 YOL037CYOL037C 354 nt12.36□□□□□ -0.43
YHR033WP38690 DAL1YIR027C 1383 nt12.34□□□□□ -0.43
YHR033WP38690 SSA4YER103W 1929 nt12.33□□□□□ -0.44
YHR033WP38690 RKM5YLR137W 1104 nt12.33□□□□□ -0.44
YHR033WP38690 FPR4YLR449W 1179 nt12.33□□□□□ -0.44
YHR033WP38690 FIS1YIL065C 468 nt12.32□□□□□ -0.44
YHR033WP38690 LSM3YLR438C-A 270 nt12.29□□□□□ -0.44
YHR033WP38690 YBL100CYBL100C 315 nt12.28□□□□□ -0.44
YHR033WP38690 MOT3YMR070W 1473 nt12.27□□□□□ -0.45
YHR033WP38690 PHO4YFR034C 939 nt12.2□□□□□ -0.46
YHR033WP38690 TRM9YML014W 840 nt12.17□□□□□ -0.46
YHR033WP38690 MEP2YNL142W 1500 nt12.16□□□□□ -0.46
YHR033WP38690 FUN26YAL022C 1554 nt12.13□□□□□ -0.47
YHR033WP38690 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR033WP38690 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR033WP38690 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR033WP38690 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR033WP38690 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.11□□□□□ -0.47
YHR033WP38690 YPS1YLR120C 1710 nt12.08□□□□□ -0.48
YHR033WP38690 YLR281CYLR281C 468 nt12.03□□□□□ -0.48
YHR033WP38690 CCT6YDR188W 1641 nt12□□□□□ -0.49
YHR033WP38690 DCW1YKL046C 1350 nt12□□□□□ -0.49
YHR033WP38690 PUS2YGL063W 1113 nt11.99□□□□□ -0.49
YHR033WP38690 WHI5YOR083W 888 nt11.98□□□□□ -0.49
YHR033WP38690 ALF1YNL148C 765 nt11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.6 ms