Protein–RNA interactions for Protein: P32945

PPQ1, Serine/threonine-protein phosphatase PPQ, yeastyeast

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPQ1P32945 NSR1YGR159C 1245 nt17.31■□□□□ 0.36
PPQ1P32945 YML009W-BYML009W-B 477 nt16.8■□□□□ 0.28
PPQ1P32945 MDJ1YFL016C 1536 nt16.18■□□□□ 0.18
PPQ1P32945 NOP1YDL014W 984 nt15.96■□□□□ 0.15
PPQ1P32945 YJL027CYJL027C 417 nt14.79□□□□□ -0.04
PPQ1P32945 SSA3YBL075C 1950 nt14.31□□□□□ -0.12
PPQ1P32945 YKL036CYKL036C 393 nt14.04□□□□□ -0.16
PPQ1P32945 DBP2YNL112W 1641 nt14□□□□□ -0.17
PPQ1P32945 SRX1YKL086W 384 nt13.96□□□□□ -0.17
PPQ1P32945 YBR190WYBR190W 312 nt13.93□□□□□ -0.18
PPQ1P32945 Q0297Q0297 156 nt13.74□□□□□ -0.21
PPQ1P32945 RTC3YHR087W 336 nt13.6□□□□□ -0.23
PPQ1P32945 PUT4YOR348C 1884 nt13.28□□□□□ -0.28
PPQ1P32945 YCR051WYCR051W 669 nt13.22□□□□□ -0.29
PPQ1P32945 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.1□□□□□ -0.31
PPQ1P32945 CCC1YLR220W 969 nt12.98□□□□□ -0.33
PPQ1P32945 RVS167YDR388W 1449 nt12.91□□□□□ -0.34
PPQ1P32945 POA1YBR022W 534 nt12.81□□□□□ -0.36
PPQ1P32945 ARE1YCR048W 1833 nt12.81□□□□□ -0.36
PPQ1P32945 SCJ1YMR214W 1134 nt12.78□□□□□ -0.36
PPQ1P32945 BSC6YOL137W 1494 nt12.67□□□□□ -0.38
PPQ1P32945 SPT5YML010W 3192 nt12.67□□□□□ -0.38
PPQ1P32945 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.65□□□□□ -0.38
PPQ1P32945 SSA4YER103W 1929 nt12.6□□□□□ -0.39
PPQ1P32945 SAH1YER043C 1350 nt12.57□□□□□ -0.4
PPQ1P32945 SCS3YGL126W 1143 nt12.56□□□□□ -0.4
PPQ1P32945 URN1YPR152C 1398 nt12.46□□□□□ -0.41
PPQ1P32945 OPI9YLR338W 858 nt12.42□□□□□ -0.42
PPQ1P32945 Q0182Q0182 405 nt12.36□□□□□ -0.43
PPQ1P32945 RPP1BYDL130W 321 nt12.34□□□□□ -0.43
PPQ1P32945 SHR5YOL110W 714 nt12.3□□□□□ -0.44
PPQ1P32945 BUD23YCR047C 828 nt12.29□□□□□ -0.44
PPQ1P32945 DEP1YAL013W 1218 nt12.26□□□□□ -0.45
PPQ1P32945 YOL085CYOL085C 342 nt12.21□□□□□ -0.45
PPQ1P32945 BDF1YLR399C 2061 nt12.2□□□□□ -0.46
PPQ1P32945 SSA1YAL005C 1929 nt12.17□□□□□ -0.46
PPQ1P32945 PKP1YIL042C 1185 nt12.16□□□□□ -0.46
PPQ1P32945 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.14□□□□□ -0.47
PPQ1P32945 PTC2YER089C 1395 nt12.05□□□□□ -0.48
PPQ1P32945 RPN10YHR200W 807 nt12.04□□□□□ -0.48
PPQ1P32945 PUN1YLR414C 792 nt12.03□□□□□ -0.48
PPQ1P32945 TAT1YBR069C 1860 nt12.02□□□□□ -0.49
PPQ1P32945 NAB2YGL122C 1578 nt11.97□□□□□ -0.49
PPQ1P32945 MEP2YNL142W 1500 nt11.96□□□□□ -0.49
PPQ1P32945 YNL208WYNL208W 600 nt11.93□□□□□ -0.5
PPQ1P32945 PET122YER153C 765 nt11.92□□□□□ -0.5
PPQ1P32945 PAC11YDR488C 1602 nt11.89□□□□□ -0.51
PPQ1P32945 YJR018WYJR018W 363 nt11.82□□□□□ -0.52
PPQ1P32945 DCW1YKL046C 1350 nt11.8□□□□□ -0.52
PPQ1P32945 FIS1YIL065C 468 nt11.78□□□□□ -0.52
PPQ1P32945 FPS1YLL043W 2010 nt11.77□□□□□ -0.52
PPQ1P32945 YDJ1YNL064C 1230 nt11.72□□□□□ -0.53
PPQ1P32945 NVJ2YPR091C 2313 nt11.72□□□□□ -0.53
PPQ1P32945 DAL1YIR027C 1383 nt11.68□□□□□ -0.54
PPQ1P32945 FPR4YLR449W 1179 nt11.66□□□□□ -0.54
PPQ1P32945 YBR220CYBR220C 1683 nt11.64□□□□□ -0.55
PPQ1P32945 YPS1YLR120C 1710 nt11.63□□□□□ -0.55
PPQ1P32945 GAR1YHR089C 618 nt11.62□□□□□ -0.55
PPQ1P32945 PHO4YFR034C 939 nt11.59□□□□□ -0.55
PPQ1P32945 EMI2YDR516C 1503 nt11.59□□□□□ -0.55
PPQ1P32945 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.55□□□□□ -0.56
PPQ1P32945 YJR120WYJR120W 351 nt11.54□□□□□ -0.56
PPQ1P32945 MOT3YMR070W 1473 nt11.52□□□□□ -0.56
PPQ1P32945 SCR1SCR1 522 nt11.52□□□□□ -0.57
PPQ1P32945 YMR090WYMR090W 684 nt11.51□□□□□ -0.57
PPQ1P32945 RRN5YLR141W 1092 nt11.48□□□□□ -0.57
PPQ1P32945 INM2YDR287W 879 nt11.46□□□□□ -0.57
PPQ1P32945 YDL221WYDL221W 552 nt11.44□□□□□ -0.58
PPQ1P32945 SDH1YKL148C 1923 nt11.44□□□□□ -0.58
PPQ1P32945 YDR095CYDR095C 411 nt11.43□□□□□ -0.58
PPQ1P32945 PCH2YBR186W 1695 nt11.4□□□□□ -0.59
PPQ1P32945 GUT2YIL155C 1950 nt11.37□□□□□ -0.59
PPQ1P32945 CAC2YML102W 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
PPQ1P32945 RPP2BYDR382W 333 nt11.34□□□□□ -0.59
PPQ1P32945 PTP1YDL230W 1008 nt11.28□□□□□ -0.6
PPQ1P32945 SEC11YIR022W 504 nt11.28□□□□□ -0.6
PPQ1P32945 YBL100CYBL100C 315 nt11.27□□□□□ -0.61
PPQ1P32945 TIR1YER011W 765 nt11.26□□□□□ -0.61
PPQ1P32945 SCC4YER147C 1875 nt11.25□□□□□ -0.61
PPQ1P32945 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.25□□□□□ -0.61
PPQ1P32945 RPP2AYOL039W 321 nt11.21□□□□□ -0.61
PPQ1P32945 PIB2YGL023C 1908 nt11.19□□□□□ -0.62
PPQ1P32945 IRC15YPL017C 1500 nt11.18□□□□□ -0.62
PPQ1P32945 ATS1YAL020C 1002 nt11.13□□□□□ -0.63
PPQ1P32945 GIS3YLR094C 1509 nt11.12□□□□□ -0.63
PPQ1P32945 FUN26YAL022C 1554 nt11.11□□□□□ -0.63
PPQ1P32945 YSC84YHR016C 1407 nt11.11□□□□□ -0.63
PPQ1P32945 ALF1YNL148C 765 nt11.09□□□□□ -0.63
PPQ1P32945 RTF1YGL244W 1677 nt11.04□□□□□ -0.64
PPQ1P32945 SRB2YHR041C 633 nt11.03□□□□□ -0.64
PPQ1P32945 YHL050CYHL050C 2094 nt11.02□□□□□ -0.64
PPQ1P32945 BDH2YAL061W 1254 nt11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms