Protein–RNA interactions for Protein: P38202

YBL028C, UPF0642 protein YBL028C, yeastyeast

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL028CP38202 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.91■■□□□ 1.42
YBL028CP38202 NSR1YGR159C 1245 nt23.47■■□□□ 1.35
YBL028CP38202 NOP1YDL014W 984 nt23.41■■□□□ 1.34
YBL028CP38202 YKL036CYKL036C 393 nt21.97■■□□□ 1.11
YBL028CP38202 Q0297Q0297 156 nt20.65■□□□□ 0.9
YBL028CP38202 YJL027CYJL027C 417 nt20.57■□□□□ 0.88
YBL028CP38202 SRX1YKL086W 384 nt20.48■□□□□ 0.87
YBL028CP38202 MDJ1YFL016C 1536 nt20.45■□□□□ 0.86
YBL028CP38202 SCS3YGL126W 1143 nt20.18■□□□□ 0.82
YBL028CP38202 YCR051WYCR051W 669 nt19.45■□□□□ 0.7
YBL028CP38202 YOL085CYOL085C 342 nt19.04■□□□□ 0.64
YBL028CP38202 PKP1YIL042C 1185 nt18.69■□□□□ 0.58
YBL028CP38202 RPP1BYDL130W 321 nt18.52■□□□□ 0.56
YBL028CP38202 SCJ1YMR214W 1134 nt18.38■□□□□ 0.53
YBL028CP38202 DBP2YNL112W 1641 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.28■□□□□ 0.52
YBL028CP38202 ATS1YAL020C 1002 nt18.18■□□□□ 0.5
YBL028CP38202 CCC1YLR220W 969 nt18.1■□□□□ 0.49
YBL028CP38202 PET122YER153C 765 nt17.64■□□□□ 0.41
YBL028CP38202 SCR1SCR1 522 nt17.54■□□□□ 0.4
YBL028CP38202 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.43■□□□□ 0.38
YBL028CP38202 YBR190WYBR190W 312 nt17.36■□□□□ 0.37
YBL028CP38202 RVS167YDR388W 1449 nt17.22■□□□□ 0.35
YBL028CP38202 RRN5YLR141W 1092 nt17.19■□□□□ 0.34
YBL028CP38202 RTC3YHR087W 336 nt16.97■□□□□ 0.31
YBL028CP38202 RSB1YOR049C 1065 nt16.92■□□□□ 0.3
YBL028CP38202 YDJ1YNL064C 1230 nt16.87■□□□□ 0.29
YBL028CP38202 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.85■□□□□ 0.29
YBL028CP38202 PST2YDR032C 597 nt16.79■□□□□ 0.28
YBL028CP38202 SHR5YOL110W 714 nt16.74■□□□□ 0.27
YBL028CP38202 GAR1YHR089C 618 nt16.41■□□□□ 0.22
YBL028CP38202 YKL097CYKL097C 411 nt16.29■□□□□ 0.2
YBL028CP38202 DEP1YAL013W 1218 nt16.14■□□□□ 0.17
YBL028CP38202 URN1YPR152C 1398 nt16.03■□□□□ 0.16
YBL028CP38202 SHU1YHL006C 453 nt16.01■□□□□ 0.15
YBL028CP38202 YNL208WYNL208W 600 nt15.93■□□□□ 0.14
YBL028CP38202 RPN10YHR200W 807 nt15.87■□□□□ 0.13
YBL028CP38202 TIR1YER011W 765 nt15.85■□□□□ 0.13
YBL028CP38202 OPI9YLR338W 858 nt15.75■□□□□ 0.11
YBL028CP38202 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.64■□□□□ 0.09
YBL028CP38202 YOR139CYOR139C 393 nt15.6■□□□□ 0.09
YBL028CP38202 SSA1YAL005C 1929 nt15.59■□□□□ 0.09
YBL028CP38202 SAH1YER043C 1350 nt15.54■□□□□ 0.08
YBL028CP38202 PUT4YOR348C 1884 nt15.46■□□□□ 0.06
YBL028CP38202 SRB2YHR041C 633 nt15.42■□□□□ 0.06
YBL028CP38202 NPL3YDR432W 1245 nt15.34■□□□□ 0.05
YBL028CP38202 YJR018WYJR018W 363 nt15.34■□□□□ 0.05
YBL028CP38202 ARE1YCR048W 1833 nt15.29■□□□□ 0.04
YBL028CP38202 PUN1YLR414C 792 nt15.27■□□□□ 0.04
YBL028CP38202 WWM1YFL010C 636 nt15.23■□□□□ 0.03
YBL028CP38202 YGR021WYGR021W 873 nt15.23■□□□□ 0.03
YBL028CP38202 HOM6YJR139C 1080 nt15.22■□□□□ 0.03
YBL028CP38202 YJR120WYJR120W 351 nt15.2■□□□□ 0.02
YBL028CP38202 MNP1YGL068W 585 nt15.18■□□□□ 0.02
YBL028CP38202 RPP2BYDR382W 333 nt15.1■□□□□ 0.01
YBL028CP38202 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.08■□□□□ 0
YBL028CP38202 YOL037CYOL037C 354 nt15.08■□□□□ 0
YBL028CP38202 PTC2YER089C 1395 nt15.02■□□□□ -0
YBL028CP38202 POA1YBR022W 534 nt15.01□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 RKM5YLR137W 1104 nt14.99□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.98□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.96□□□□□ -0.01
YBL028CP38202 SSA3YBL075C 1950 nt14.93□□□□□ -0.02
YBL028CP38202 BDH2YAL061W 1254 nt14.89□□□□□ -0.03
YBL028CP38202 LSM3YLR438C-A 270 nt14.79□□□□□ -0.04
YBL028CP38202 BUD23YCR047C 828 nt14.77□□□□□ -0.05
YBL028CP38202 NAB2YGL122C 1578 nt14.77□□□□□ -0.05
YBL028CP38202 INM2YDR287W 879 nt14.75□□□□□ -0.05
YBL028CP38202 YLR281CYLR281C 468 nt14.73□□□□□ -0.05
YBL028CP38202 PUS2YGL063W 1113 nt14.71□□□□□ -0.05
YBL028CP38202 DAL1YIR027C 1383 nt14.65□□□□□ -0.06
YBL028CP38202 YBL100CYBL100C 315 nt14.64□□□□□ -0.07
YBL028CP38202 WHI5YOR083W 888 nt14.62□□□□□ -0.07
YBL028CP38202 FPR4YLR449W 1179 nt14.61□□□□□ -0.07
YBL028CP38202 BSC6YOL137W 1494 nt14.59□□□□□ -0.07
YBL028CP38202 FIS1YIL065C 468 nt14.59□□□□□ -0.07
YBL028CP38202 TRM9YML014W 840 nt14.55□□□□□ -0.08
YBL028CP38202 MOT3YMR070W 1473 nt14.51□□□□□ -0.09
YBL028CP38202 PHO4YFR034C 939 nt14.5□□□□□ -0.09
YBL028CP38202 FUN26YAL022C 1554 nt14.5□□□□□ -0.09
YBL028CP38202 YPR011CYPR011C 981 nt14.38□□□□□ -0.11
YBL028CP38202 CCT6YDR188W 1641 nt14.37□□□□□ -0.11
YBL028CP38202 DSK2YMR276W 1122 nt14.34□□□□□ -0.11
YBL028CP38202 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.33□□□□□ -0.12
YBL028CP38202 FMP45YDL222C 930 nt14.32□□□□□ -0.12
YBL028CP38202 IMP2'YIL154C 1041 nt14.29□□□□□ -0.12
YBL028CP38202 YLR236CYLR236C 324 nt14.28□□□□□ -0.12
YBL028CP38202 YCH1YGR203W 447 nt14.21□□□□□ -0.13
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