Protein–RNA interactions for Protein: Q03653

EFR3, Protein EFR3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
EFR3Q03653 NSR1YGR159C 1245 nt19.59■□□□□ 0.73
EFR3Q03653 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.49■□□□□ 0.71
EFR3Q03653 NOP1YDL014W 984 nt18.87■□□□□ 0.61
EFR3Q03653 MDJ1YFL016C 1536 nt17.61■□□□□ 0.41
EFR3Q03653 YKL036CYKL036C 393 nt17.15■□□□□ 0.34
EFR3Q03653 SRX1YKL086W 384 nt16.45■□□□□ 0.22
EFR3Q03653 Q0297Q0297 156 nt16.4■□□□□ 0.22
EFR3Q03653 YJL027CYJL027C 417 nt16.26■□□□□ 0.19
EFR3Q03653 YCR051WYCR051W 669 nt15.61■□□□□ 0.09
EFR3Q03653 DBP2YNL112W 1641 nt15.46■□□□□ 0.07
EFR3Q03653 SCS3YGL126W 1143 nt15.45■□□□□ 0.06
EFR3Q03653 YBR190WYBR190W 312 nt15.1■□□□□ 0.01
EFR3Q03653 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.01□□□□□ -0.01
EFR3Q03653 CCC1YLR220W 969 nt14.9□□□□□ -0.02
EFR3Q03653 YOL085CYOL085C 342 nt14.86□□□□□ -0.03
EFR3Q03653 RTC3YHR087W 336 nt14.78□□□□□ -0.04
EFR3Q03653 RPP1BYDL130W 321 nt14.72□□□□□ -0.05
EFR3Q03653 PKP1YIL042C 1185 nt14.66□□□□□ -0.06
EFR3Q03653 RVS167YDR388W 1449 nt14.54□□□□□ -0.08
EFR3Q03653 SCJ1YMR214W 1134 nt14.35□□□□□ -0.11
EFR3Q03653 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.14□□□□□ -0.15
EFR3Q03653 PET122YER153C 765 nt14.08□□□□□ -0.16
EFR3Q03653 SSA3YBL075C 1950 nt13.98□□□□□ -0.17
EFR3Q03653 SHR5YOL110W 714 nt13.95□□□□□ -0.18
EFR3Q03653 SCR1SCR1 522 nt13.9□□□□□ -0.18
EFR3Q03653 PUT4YOR348C 1884 nt13.89□□□□□ -0.19
EFR3Q03653 ATS1YAL020C 1002 nt13.79□□□□□ -0.2
EFR3Q03653 URN1YPR152C 1398 nt13.71□□□□□ -0.21
EFR3Q03653 YDJ1YNL064C 1230 nt13.67□□□□□ -0.22
EFR3Q03653 RRN5YLR141W 1092 nt13.66□□□□□ -0.22
EFR3Q03653 DEP1YAL013W 1218 nt13.65□□□□□ -0.22
EFR3Q03653 ARE1YCR048W 1833 nt13.56□□□□□ -0.24
EFR3Q03653 OPI9YLR338W 858 nt13.56□□□□□ -0.24
EFR3Q03653 SAH1YER043C 1350 nt13.55□□□□□ -0.24
EFR3Q03653 RPN10YHR200W 807 nt13.47□□□□□ -0.25
EFR3Q03653 POA1YBR022W 534 nt13.46□□□□□ -0.25
EFR3Q03653 GAR1YHR089C 618 nt13.42□□□□□ -0.26
EFR3Q03653 YNL208WYNL208W 600 nt13.41□□□□□ -0.26
EFR3Q03653 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.39□□□□□ -0.27
EFR3Q03653 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.39□□□□□ -0.27
EFR3Q03653 RSB1YOR049C 1065 nt13.31□□□□□ -0.28
EFR3Q03653 BSC6YOL137W 1494 nt13.19□□□□□ -0.3
EFR3Q03653 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
EFR3Q03653 BUD23YCR047C 828 nt13.09□□□□□ -0.31
EFR3Q03653 YJR018WYJR018W 363 nt13.07□□□□□ -0.32
EFR3Q03653 PTC2YER089C 1395 nt13.07□□□□□ -0.32
EFR3Q03653 TIR1YER011W 765 nt12.97□□□□□ -0.33
EFR3Q03653 NAB2YGL122C 1578 nt12.93□□□□□ -0.34
EFR3Q03653 SSA1YAL005C 1929 nt12.86□□□□□ -0.35
EFR3Q03653 PST2YDR032C 597 nt12.78□□□□□ -0.36
EFR3Q03653 RPP2BYDR382W 333 nt12.76□□□□□ -0.37
EFR3Q03653 YJR120WYJR120W 351 nt12.76□□□□□ -0.37
EFR3Q03653 SPT5YML010W 3192 nt12.73□□□□□ -0.37
EFR3Q03653 DAL1YIR027C 1383 nt12.7□□□□□ -0.38
EFR3Q03653 FPR4YLR449W 1179 nt12.69□□□□□ -0.38
EFR3Q03653 FIS1YIL065C 468 nt12.68□□□□□ -0.38
EFR3Q03653 INM2YDR287W 879 nt12.65□□□□□ -0.38
EFR3Q03653 PHO4YFR034C 939 nt12.57□□□□□ -0.4
EFR3Q03653 SRB2YHR041C 633 nt12.56□□□□□ -0.4
EFR3Q03653 YBL100CYBL100C 315 nt12.48□□□□□ -0.41
EFR3Q03653 BDH2YAL061W 1254 nt12.44□□□□□ -0.42
EFR3Q03653 SSA4YER103W 1929 nt12.44□□□□□ -0.42
EFR3Q03653 YPS1YLR120C 1710 nt12.42□□□□□ -0.42
EFR3Q03653 MEP2YNL142W 1500 nt12.41□□□□□ -0.42
EFR3Q03653 Q0182Q0182 405 nt12.4□□□□□ -0.42
EFR3Q03653 WWM1YFL010C 636 nt12.36□□□□□ -0.43
EFR3Q03653 FUN26YAL022C 1554 nt12.32□□□□□ -0.44
EFR3Q03653 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.32□□□□□ -0.44
EFR3Q03653 YKL097CYKL097C 411 nt12.32□□□□□ -0.44
EFR3Q03653 SHU1YHL006C 453 nt12.31□□□□□ -0.44
EFR3Q03653 YDR095CYDR095C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
EFR3Q03653 TRM9YML014W 840 nt12.28□□□□□ -0.44
EFR3Q03653 LSM3YLR438C-A 270 nt12.25□□□□□ -0.45
EFR3Q03653 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.23□□□□□ -0.45
EFR3Q03653 YGR021WYGR021W 873 nt12.22□□□□□ -0.45
EFR3Q03653 ALF1YNL148C 765 nt12.21□□□□□ -0.45
EFR3Q03653 DCW1YKL046C 1350 nt12.2□□□□□ -0.46
EFR3Q03653 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.16□□□□□ -0.46
EFR3Q03653 HOM6YJR139C 1080 nt12.14□□□□□ -0.47
EFR3Q03653 CCT6YDR188W 1641 nt12.14□□□□□ -0.47
EFR3Q03653 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.08□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.08□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 RPP2AYOL039W 321 nt12.08□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 EMI2YDR516C 1503 nt12.06□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 PTP1YDL230W 1008 nt12.03□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 MNP1YGL068W 585 nt12.03□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 YMR090WYMR090W 684 nt12.03□□□□□ -0.48
EFR3Q03653 SIS1YNL007C 1059 nt12.01□□□□□ -0.49
EFR3Q03653 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
EFR3Q03653 CAC2YML102W 1407 nt11.98□□□□□ -0.49
EFR3Q03653 RKM5YLR137W 1104 nt11.97□□□□□ -0.49
EFR3Q03653 YDL221WYDL221W 552 nt11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.2 ms