Protein–RNA interactions for Protein: Q06412

TUS1, Rho1 guanine nucleotide exchange factor TUS1, yeastyeast

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Length 1,307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TUS1Q06412 YML009W-BYML009W-B 477 nt23.7■■□□□ 1.38
TUS1Q06412 NSR1YGR159C 1245 nt23.19■■□□□ 1.3
TUS1Q06412 NOP1YDL014W 984 nt23.04■■□□□ 1.28
TUS1Q06412 YKL036CYKL036C 393 nt21.53■■□□□ 1.04
TUS1Q06412 MDJ1YFL016C 1536 nt20.49■□□□□ 0.87
TUS1Q06412 Q0297Q0297 156 nt20.23■□□□□ 0.83
TUS1Q06412 YJL027CYJL027C 417 nt20.19■□□□□ 0.82
TUS1Q06412 SRX1YKL086W 384 nt20.13■□□□□ 0.81
TUS1Q06412 SCS3YGL126W 1143 nt19.76■□□□□ 0.75
TUS1Q06412 YCR051WYCR051W 669 nt19.22■□□□□ 0.67
TUS1Q06412 YOL085CYOL085C 342 nt18.64■□□□□ 0.57
TUS1Q06412 PKP1YIL042C 1185 nt18.44■□□□□ 0.54
TUS1Q06412 RPP1BYDL130W 321 nt18.19■□□□□ 0.5
TUS1Q06412 DBP2YNL112W 1641 nt18.16■□□□□ 0.5
TUS1Q06412 TRN1tP(UGG)A 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 SUF9tP(UGG)F 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 SUF8tP(UGG)H 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 SUF7tP(UGG)M 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 SUF11tP(UGG)O2 72 nt18.06■□□□□ 0.48
TUS1Q06412 CCC1YLR220W 969 nt18■□□□□ 0.47
TUS1Q06412 SCJ1YMR214W 1134 nt17.97■□□□□ 0.47
TUS1Q06412 ATS1YAL020C 1002 nt17.71■□□□□ 0.42
TUS1Q06412 PET122YER153C 765 nt17.41■□□□□ 0.38
TUS1Q06412 YBR190WYBR190W 312 nt17.28■□□□□ 0.36
TUS1Q06412 SCR1SCR1 522 nt17.25■□□□□ 0.35
TUS1Q06412 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TUS1Q06412 RVS167YDR388W 1449 nt17.13■□□□□ 0.33
TUS1Q06412 RTC3YHR087W 336 nt17.03■□□□□ 0.32
TUS1Q06412 RRN5YLR141W 1092 nt16.92■□□□□ 0.3
TUS1Q06412 RSB1YOR049C 1065 nt16.68■□□□□ 0.26
TUS1Q06412 SHR5YOL110W 714 nt16.59■□□□□ 0.25
TUS1Q06412 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.57■□□□□ 0.24
TUS1Q06412 YDJ1YNL064C 1230 nt16.57■□□□□ 0.24
TUS1Q06412 PST2YDR032C 597 nt16.33■□□□□ 0.2
TUS1Q06412 GAR1YHR089C 618 nt16.27■□□□□ 0.2
TUS1Q06412 DEP1YAL013W 1218 nt16.15■□□□□ 0.18
TUS1Q06412 URN1YPR152C 1398 nt16.02■□□□□ 0.15
TUS1Q06412 YKL097CYKL097C 411 nt15.91■□□□□ 0.14
TUS1Q06412 YNL208WYNL208W 600 nt15.81■□□□□ 0.12
TUS1Q06412 RPN10YHR200W 807 nt15.78■□□□□ 0.12
TUS1Q06412 TIR1YER011W 765 nt15.68■□□□□ 0.1
TUS1Q06412 SHU1YHL006C 453 nt15.67■□□□□ 0.1
TUS1Q06412 OPI9YLR338W 858 nt15.66■□□□□ 0.1
TUS1Q06412 SAH1YER043C 1350 nt15.57■□□□□ 0.08
TUS1Q06412 PUT4YOR348C 1884 nt15.51■□□□□ 0.07
TUS1Q06412 SSA1YAL005C 1929 nt15.44■□□□□ 0.06
TUS1Q06412 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt15.43■□□□□ 0.06
TUS1Q06412 ARE1YCR048W 1833 nt15.34■□□□□ 0.05
TUS1Q06412 SRB2YHR041C 633 nt15.28■□□□□ 0.04
TUS1Q06412 YJR018WYJR018W 363 nt15.27■□□□□ 0.04
TUS1Q06412 PUN1YLR414C 792 nt15.21■□□□□ 0.03
TUS1Q06412 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.19■□□□□ 0.02
TUS1Q06412 YOR139CYOR139C 393 nt15.18■□□□□ 0.02
TUS1Q06412 SSA3YBL075C 1950 nt15.14■□□□□ 0.01
TUS1Q06412 POA1YBR022W 534 nt15.13■□□□□ 0.01
TUS1Q06412 YJR120WYJR120W 351 nt15.09■□□□□ 0.01
TUS1Q06412 WWM1YFL010C 636 nt15.07■□□□□ 0
TUS1Q06412 PTC2YER089C 1395 nt15.03■□□□□ -0
TUS1Q06412 RPP2BYDR382W 333 nt15.03■□□□□ -0
TUS1Q06412 NPL3YDR432W 1245 nt15.02■□□□□ -0
TUS1Q06412 MNP1YGL068W 585 nt15.02■□□□□ -0
TUS1Q06412 YGR021WYGR021W 873 nt14.97□□□□□ -0.01
TUS1Q06412 HOM6YJR139C 1080 nt14.96□□□□□ -0.01
TUS1Q06412 BUD23YCR047C 828 nt14.91□□□□□ -0.02
TUS1Q06412 YOL037CYOL037C 354 nt14.76□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 NAB2YGL122C 1578 nt14.75□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 BDH2YAL061W 1254 nt14.75□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 RKM5YLR137W 1104 nt14.75□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.74□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 BSC6YOL137W 1494 nt14.73□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 FPR4YLR449W 1179 nt14.71□□□□□ -0.05
TUS1Q06412 INM2YDR287W 879 nt14.64□□□□□ -0.07
TUS1Q06412 DAL1YIR027C 1383 nt14.62□□□□□ -0.07
TUS1Q06412 YBL100CYBL100C 315 nt14.61□□□□□ -0.07
TUS1Q06412 FIS1YIL065C 468 nt14.6□□□□□ -0.07
TUS1Q06412 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.56□□□□□ -0.08
TUS1Q06412 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.56□□□□□ -0.08
TUS1Q06412 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.56□□□□□ -0.08
TUS1Q06412 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.56□□□□□ -0.08
TUS1Q06412 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.56□□□□□ -0.08
TUS1Q06412 LSM3YLR438C-A 270 nt14.56□□□□□ -0.08
TUS1Q06412 PHO4YFR034C 939 nt14.51□□□□□ -0.09
TUS1Q06412 TRM9YML014W 840 nt14.45□□□□□ -0.1
TUS1Q06412 FUN26YAL022C 1554 nt14.43□□□□□ -0.1
TUS1Q06412 PUS2YGL063W 1113 nt14.42□□□□□ -0.1
TUS1Q06412 YLR281CYLR281C 468 nt14.41□□□□□ -0.1
TUS1Q06412 WHI5YOR083W 888 nt14.37□□□□□ -0.11
TUS1Q06412 CCT6YDR188W 1641 nt14.25□□□□□ -0.13
TUS1Q06412 ALF1YNL148C 765 nt14.2□□□□□ -0.14
TUS1Q06412 MOT3YMR070W 1473 nt14.18□□□□□ -0.14
TUS1Q06412 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.15□□□□□ -0.14
TUS1Q06412 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.12□□□□□ -0.15
TUS1Q06412 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.12□□□□□ -0.15
TUS1Q06412 YPS1YLR120C 1710 nt14.1□□□□□ -0.15
TUS1Q06412 FMP45YDL222C 930 nt14.09□□□□□ -0.15
TUS1Q06412 DSK2YMR276W 1122 nt14.09□□□□□ -0.15
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