Protein–RNA interactions for Protein: Q04049

RAD30, DNA polymerase eta, yeastyeast

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAD30Q04049 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.96■□□□□ 0.63
RAD30Q04049 NSR1YGR159C 1245 nt18.95■□□□□ 0.62
RAD30Q04049 NOP1YDL014W 984 nt18.35■□□□□ 0.53
RAD30Q04049 MDJ1YFL016C 1536 nt17.31■□□□□ 0.36
RAD30Q04049 YKL036CYKL036C 393 nt16.81■□□□□ 0.28
RAD30Q04049 SRX1YKL086W 384 nt16.04■□□□□ 0.16
RAD30Q04049 Q0297Q0297 156 nt16.01■□□□□ 0.15
RAD30Q04049 YJL027CYJL027C 417 nt15.87■□□□□ 0.13
RAD30Q04049 YCR051WYCR051W 669 nt15.22■□□□□ 0.03
RAD30Q04049 SCS3YGL126W 1143 nt15.22■□□□□ 0.03
RAD30Q04049 DBP2YNL112W 1641 nt15.02□□□□□ -0.01
RAD30Q04049 YBR190WYBR190W 312 nt14.88□□□□□ -0.03
RAD30Q04049 SSA3YBL075C 1950 nt14.79□□□□□ -0.04
RAD30Q04049 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.6□□□□□ -0.07
RAD30Q04049 RTC3YHR087W 336 nt14.56□□□□□ -0.08
RAD30Q04049 YOL085CYOL085C 342 nt14.56□□□□□ -0.08
RAD30Q04049 CCC1YLR220W 969 nt14.46□□□□□ -0.09
RAD30Q04049 PKP1YIL042C 1185 nt14.38□□□□□ -0.11
RAD30Q04049 RPP1BYDL130W 321 nt14.37□□□□□ -0.11
RAD30Q04049 PUT4YOR348C 1884 nt14.06□□□□□ -0.16
RAD30Q04049 RVS167YDR388W 1449 nt14.02□□□□□ -0.16
RAD30Q04049 SCJ1YMR214W 1134 nt13.94□□□□□ -0.18
RAD30Q04049 PET122YER153C 765 nt13.76□□□□□ -0.21
RAD30Q04049 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.76□□□□□ -0.21
RAD30Q04049 ARE1YCR048W 1833 nt13.6□□□□□ -0.23
RAD30Q04049 POA1YBR022W 534 nt13.58□□□□□ -0.24
RAD30Q04049 ATS1YAL020C 1002 nt13.57□□□□□ -0.24
RAD30Q04049 SCR1SCR1 522 nt13.56□□□□□ -0.24
RAD30Q04049 SHR5YOL110W 714 nt13.5□□□□□ -0.25
RAD30Q04049 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.44□□□□□ -0.26
RAD30Q04049 SAH1YER043C 1350 nt13.42□□□□□ -0.26
RAD30Q04049 BSC6YOL137W 1494 nt13.4□□□□□ -0.26
RAD30Q04049 URN1YPR152C 1398 nt13.37□□□□□ -0.27
RAD30Q04049 RRN5YLR141W 1092 nt13.36□□□□□ -0.27
RAD30Q04049 YDJ1YNL064C 1230 nt13.3□□□□□ -0.28
RAD30Q04049 OPI9YLR338W 858 nt13.29□□□□□ -0.28
RAD30Q04049 SPT5YML010W 3192 nt13.28□□□□□ -0.28
RAD30Q04049 DEP1YAL013W 1218 nt13.21□□□□□ -0.29
RAD30Q04049 SSA4YER103W 1929 nt13.15□□□□□ -0.3
RAD30Q04049 BUD23YCR047C 828 nt13.09□□□□□ -0.31
RAD30Q04049 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.08□□□□□ -0.32
RAD30Q04049 GAR1YHR089C 618 nt13.05□□□□□ -0.32
RAD30Q04049 RSB1YOR049C 1065 nt13.04□□□□□ -0.32
RAD30Q04049 RPN10YHR200W 807 nt12.99□□□□□ -0.33
RAD30Q04049 YNL208WYNL208W 600 nt12.95□□□□□ -0.34
RAD30Q04049 PUN1YLR414C 792 nt12.89□□□□□ -0.35
RAD30Q04049 PTC2YER089C 1395 nt12.88□□□□□ -0.35
RAD30Q04049 NAB2YGL122C 1578 nt12.79□□□□□ -0.36
RAD30Q04049 BDF1YLR399C 2061 nt12.71□□□□□ -0.38
RAD30Q04049 YJR018WYJR018W 363 nt12.7□□□□□ -0.38
RAD30Q04049 MEP2YNL142W 1500 nt12.64□□□□□ -0.39
RAD30Q04049 TIR1YER011W 765 nt12.62□□□□□ -0.39
RAD30Q04049 Q0182Q0182 405 nt12.61□□□□□ -0.39
RAD30Q04049 PST2YDR032C 597 nt12.58□□□□□ -0.4
RAD30Q04049 FIS1YIL065C 468 nt12.55□□□□□ -0.4
RAD30Q04049 TAT1YBR069C 1860 nt12.51□□□□□ -0.41
RAD30Q04049 SSA1YAL005C 1929 nt12.49□□□□□ -0.41
RAD30Q04049 DAL1YIR027C 1383 nt12.49□□□□□ -0.41
RAD30Q04049 FPR4YLR449W 1179 nt12.49□□□□□ -0.41
RAD30Q04049 DCW1YKL046C 1350 nt12.45□□□□□ -0.42
RAD30Q04049 PHO4YFR034C 939 nt12.39□□□□□ -0.43
RAD30Q04049 YJR120WYJR120W 351 nt12.39□□□□□ -0.43
RAD30Q04049 YPS1YLR120C 1710 nt12.38□□□□□ -0.43
RAD30Q04049 INM2YDR287W 879 nt12.31□□□□□ -0.44
RAD30Q04049 RPP2BYDR382W 333 nt12.31□□□□□ -0.44
RAD30Q04049 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.31□□□□□ -0.44
RAD30Q04049 SRB2YHR041C 633 nt12.27□□□□□ -0.45
RAD30Q04049 YBR220CYBR220C 1683 nt12.26□□□□□ -0.45
RAD30Q04049 EMI2YDR516C 1503 nt12.25□□□□□ -0.45
RAD30Q04049 PAC11YDR488C 1602 nt12.22□□□□□ -0.45
RAD30Q04049 YMR090WYMR090W 684 nt12.2□□□□□ -0.46
RAD30Q04049 YDR095CYDR095C 411 nt12.18□□□□□ -0.46
RAD30Q04049 SHU1YHL006C 453 nt12.12□□□□□ -0.47
RAD30Q04049 YBL100CYBL100C 315 nt12.12□□□□□ -0.47
RAD30Q04049 YDL221WYDL221W 552 nt12.1□□□□□ -0.47
RAD30Q04049 SDH1YKL148C 1923 nt12.08□□□□□ -0.48
RAD30Q04049 MOT3YMR070W 1473 nt12.06□□□□□ -0.48
RAD30Q04049 CAC2YML102W 1407 nt12.04□□□□□ -0.48
RAD30Q04049 WWM1YFL010C 636 nt12.04□□□□□ -0.48
RAD30Q04049 BDH2YAL061W 1254 nt12.04□□□□□ -0.48
RAD30Q04049 YKL097CYKL097C 411 nt12.02□□□□□ -0.49
RAD30Q04049 PTP1YDL230W 1008 nt11.99□□□□□ -0.49
RAD30Q04049 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.99□□□□□ -0.49
RAD30Q04049 RPP2AYOL039W 321 nt11.96□□□□□ -0.49
RAD30Q04049 PCH2YBR186W 1695 nt11.95□□□□□ -0.5
RAD30Q04049 FUN26YAL022C 1554 nt11.95□□□□□ -0.5
RAD30Q04049 SCC4YER147C 1875 nt11.91□□□□□ -0.5
RAD30Q04049 GUT2YIL155C 1950 nt11.91□□□□□ -0.5
RAD30Q04049 ALF1YNL148C 765 nt11.91□□□□□ -0.5
RAD30Q04049 YGR021WYGR021W 873 nt11.9□□□□□ -0.5
RAD30Q04049 SEC11YIR022W 504 nt11.87□□□□□ -0.51
RAD30Q04049 HOM6YJR139C 1080 nt11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms