Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeastyeast

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN5Q02983 NSR1YGR159C 1245 nt19.06■□□□□ 0.64
RRN5Q02983 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.86■□□□□ 0.61
RRN5Q02983 NOP1YDL014W 984 nt18.22■□□□□ 0.51
RRN5Q02983 MDJ1YFL016C 1536 nt17.24■□□□□ 0.35
RRN5Q02983 YKL036CYKL036C 393 nt16.44■□□□□ 0.22
RRN5Q02983 YJL027CYJL027C 417 nt15.93■□□□□ 0.14
RRN5Q02983 SRX1YKL086W 384 nt15.88■□□□□ 0.13
RRN5Q02983 Q0297Q0297 156 nt15.78■□□□□ 0.12
RRN5Q02983 DBP2YNL112W 1641 nt15.07■□□□□ 0
RRN5Q02983 YCR051WYCR051W 669 nt15.07■□□□□ 0
RRN5Q02983 YBR190WYBR190W 312 nt14.83□□□□□ -0.04
RRN5Q02983 SCS3YGL126W 1143 nt14.74□□□□□ -0.05
RRN5Q02983 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.55□□□□□ -0.08
RRN5Q02983 RTC3YHR087W 336 nt14.51□□□□□ -0.09
RRN5Q02983 CCC1YLR220W 969 nt14.45□□□□□ -0.1
RRN5Q02983 YOL085CYOL085C 342 nt14.23□□□□□ -0.13
RRN5Q02983 RVS167YDR388W 1449 nt14.18□□□□□ -0.14
RRN5Q02983 RPP1BYDL130W 321 nt14.17□□□□□ -0.14
RRN5Q02983 PKP1YIL042C 1185 nt14.06□□□□□ -0.16
RRN5Q02983 SCJ1YMR214W 1134 nt13.94□□□□□ -0.18
RRN5Q02983 PUT4YOR348C 1884 nt13.7□□□□□ -0.22
RRN5Q02983 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.66□□□□□ -0.22
RRN5Q02983 SSA3YBL075C 1950 nt13.64□□□□□ -0.23
RRN5Q02983 PET122YER153C 765 nt13.56□□□□□ -0.24
RRN5Q02983 SHR5YOL110W 714 nt13.56□□□□□ -0.24
RRN5Q02983 URN1YPR152C 1398 nt13.42□□□□□ -0.26
RRN5Q02983 SCR1SCR1 522 nt13.37□□□□□ -0.27
RRN5Q02983 ARE1YCR048W 1833 nt13.34□□□□□ -0.27
RRN5Q02983 DEP1YAL013W 1218 nt13.31□□□□□ -0.28
RRN5Q02983 SAH1YER043C 1350 nt13.3□□□□□ -0.28
RRN5Q02983 OPI9YLR338W 858 nt13.29□□□□□ -0.28
RRN5Q02983 POA1YBR022W 534 nt13.27□□□□□ -0.29
RRN5Q02983 YDJ1YNL064C 1230 nt13.23□□□□□ -0.29
RRN5Q02983 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.2□□□□□ -0.3
RRN5Q02983 RPN10YHR200W 807 nt13.18□□□□□ -0.3
RRN5Q02983 RRN5YLR141W 1092 nt13.15□□□□□ -0.3
RRN5Q02983 ATS1YAL020C 1002 nt13.09□□□□□ -0.31
RRN5Q02983 YNL208WYNL208W 600 nt13.07□□□□□ -0.32
RRN5Q02983 BSC6YOL137W 1494 nt13.04□□□□□ -0.32
RRN5Q02983 GAR1YHR089C 618 nt13□□□□□ -0.33
RRN5Q02983 PUN1YLR414C 792 nt12.92□□□□□ -0.34
RRN5Q02983 BUD23YCR047C 828 nt12.9□□□□□ -0.34
RRN5Q02983 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.88□□□□□ -0.35
RRN5Q02983 PTC2YER089C 1395 nt12.82□□□□□ -0.36
RRN5Q02983 RSB1YOR049C 1065 nt12.79□□□□□ -0.36
RRN5Q02983 YJR018WYJR018W 363 nt12.78□□□□□ -0.36
RRN5Q02983 NAB2YGL122C 1578 nt12.7□□□□□ -0.38
RRN5Q02983 SPT5YML010W 3192 nt12.62□□□□□ -0.39
RRN5Q02983 TIR1YER011W 765 nt12.58□□□□□ -0.4
RRN5Q02983 SSA1YAL005C 1929 nt12.47□□□□□ -0.41
RRN5Q02983 DAL1YIR027C 1383 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN5Q02983 RPP2BYDR382W 333 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN5Q02983 FPR4YLR449W 1179 nt12.46□□□□□ -0.41
RRN5Q02983 FIS1YIL065C 468 nt12.44□□□□□ -0.42
RRN5Q02983 YJR120WYJR120W 351 nt12.44□□□□□ -0.42
RRN5Q02983 SSA4YER103W 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
RRN5Q02983 INM2YDR287W 879 nt12.39□□□□□ -0.43
RRN5Q02983 PHO4YFR034C 939 nt12.33□□□□□ -0.44
RRN5Q02983 MEP2YNL142W 1500 nt12.28□□□□□ -0.44
RRN5Q02983 Q0182Q0182 405 nt12.26□□□□□ -0.45
RRN5Q02983 YPS1YLR120C 1710 nt12.21□□□□□ -0.45
RRN5Q02983 YBL100CYBL100C 315 nt12.2□□□□□ -0.46
RRN5Q02983 PST2YDR032C 597 nt12.17□□□□□ -0.46
RRN5Q02983 SRB2YHR041C 633 nt12.15□□□□□ -0.46
RRN5Q02983 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.14□□□□□ -0.47
RRN5Q02983 BDH2YAL061W 1254 nt12.11□□□□□ -0.47
RRN5Q02983 YDR095CYDR095C 411 nt12.08□□□□□ -0.48
RRN5Q02983 DCW1YKL046C 1350 nt12.06□□□□□ -0.48
RRN5Q02983 FUN26YAL022C 1554 nt12.03□□□□□ -0.48
RRN5Q02983 TRM9YML014W 840 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN5Q02983 ALF1YNL148C 765 nt11.98□□□□□ -0.49
RRN5Q02983 WWM1YFL010C 636 nt11.95□□□□□ -0.5
RRN5Q02983 YMR090WYMR090W 684 nt11.93□□□□□ -0.5
RRN5Q02983 EMI2YDR516C 1503 nt11.92□□□□□ -0.5
RRN5Q02983 BDF1YLR399C 2061 nt11.91□□□□□ -0.5
RRN5Q02983 FPS1YLL043W 2010 nt11.91□□□□□ -0.5
RRN5Q02983 LSM3YLR438C-A 270 nt11.9□□□□□ -0.5
RRN5Q02983 RPP2AYOL039W 321 nt11.87□□□□□ -0.51
RRN5Q02983 CCT6YDR188W 1641 nt11.83□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 PTP1YDL230W 1008 nt11.82□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 YDL221WYDL221W 552 nt11.8□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.8□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 YBR220CYBR220C 1683 nt11.8□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 CAC2YML102W 1407 nt11.79□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 YGR021WYGR021W 873 nt11.79□□□□□ -0.52
RRN5Q02983 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.77□□□□□ -0.53
RRN5Q02983 SHU1YHL006C 453 nt11.76□□□□□ -0.53
RRN5Q02983 TAT1YBR069C 1860 nt11.76□□□□□ -0.53
RRN5Q02983 SIS1YNL007C 1059 nt11.75□□□□□ -0.53
RRN5Q02983 SDH1YKL148C 1923 nt11.72□□□□□ -0.53
RRN5Q02983 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.71□□□□□ -0.53
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