Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.48■■□□□ 1.03
SPE3Q12074 NOP1YDL014W 984 nt21.02■□□□□ 0.96
SPE3Q12074 NSR1YGR159C 1245 nt20.96■□□□□ 0.95
SPE3Q12074 YKL036CYKL036C 393 nt19.67■□□□□ 0.74
SPE3Q12074 MDJ1YFL016C 1536 nt18.53■□□□□ 0.56
SPE3Q12074 YJL027CYJL027C 417 nt18.47■□□□□ 0.55
SPE3Q12074 Q0297Q0297 156 nt18.4■□□□□ 0.54
SPE3Q12074 SRX1YKL086W 384 nt18.28■□□□□ 0.52
SPE3Q12074 SCS3YGL126W 1143 nt18.03■□□□□ 0.48
SPE3Q12074 YCR051WYCR051W 669 nt17.48■□□□□ 0.39
SPE3Q12074 YOL085CYOL085C 342 nt16.98■□□□□ 0.31
SPE3Q12074 PKP1YIL042C 1185 nt16.75■□□□□ 0.27
SPE3Q12074 RPP1BYDL130W 321 nt16.55■□□□□ 0.24
SPE3Q12074 SCJ1YMR214W 1134 nt16.37■□□□□ 0.21
SPE3Q12074 DBP2YNL112W 1641 nt16.33■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.31■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 CCC1YLR220W 969 nt16.28■□□□□ 0.2
SPE3Q12074 ATS1YAL020C 1002 nt16.21■□□□□ 0.19
SPE3Q12074 YBR190WYBR190W 312 nt15.87■□□□□ 0.13
SPE3Q12074 SCR1SCR1 522 nt15.8■□□□□ 0.12
SPE3Q12074 PET122YER153C 765 nt15.77■□□□□ 0.12
SPE3Q12074 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.57■□□□□ 0.08
SPE3Q12074 RVS167YDR388W 1449 nt15.55■□□□□ 0.08
SPE3Q12074 RTC3YHR087W 336 nt15.54■□□□□ 0.08
SPE3Q12074 RRN5YLR141W 1092 nt15.35■□□□□ 0.05
SPE3Q12074 RSB1YOR049C 1065 nt15.22■□□□□ 0.03
SPE3Q12074 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.04■□□□□ -0
SPE3Q12074 YDJ1YNL064C 1230 nt15.03■□□□□ -0
SPE3Q12074 SHR5YOL110W 714 nt14.99□□□□□ -0.01
SPE3Q12074 PST2YDR032C 597 nt14.91□□□□□ -0.02
SPE3Q12074 GAR1YHR089C 618 nt14.73□□□□□ -0.05
SPE3Q12074 YKL097CYKL097C 411 nt14.62□□□□□ -0.07
SPE3Q12074 SSA3YBL075C 1950 nt14.58□□□□□ -0.07
SPE3Q12074 DEP1YAL013W 1218 nt14.51□□□□□ -0.09
SPE3Q12074 URN1YPR152C 1398 nt14.48□□□□□ -0.09
SPE3Q12074 PUT4YOR348C 1884 nt14.4□□□□□ -0.1
SPE3Q12074 RPN10YHR200W 807 nt14.34□□□□□ -0.11
SPE3Q12074 OPI9YLR338W 858 nt14.29□□□□□ -0.12
SPE3Q12074 YNL208WYNL208W 600 nt14.29□□□□□ -0.12
SPE3Q12074 SHU1YHL006C 453 nt14.26□□□□□ -0.13
SPE3Q12074 SAH1YER043C 1350 nt14.19□□□□□ -0.14
SPE3Q12074 TIR1YER011W 765 nt14.18□□□□□ -0.14
SPE3Q12074 ARE1YCR048W 1833 nt14.11□□□□□ -0.15
SPE3Q12074 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.98□□□□□ -0.17
SPE3Q12074 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.97□□□□□ -0.17
SPE3Q12074 POA1YBR022W 534 nt13.96□□□□□ -0.17
SPE3Q12074 PUN1YLR414C 792 nt13.91□□□□□ -0.18
SPE3Q12074 SSA1YAL005C 1929 nt13.88□□□□□ -0.19
SPE3Q12074 YOR139CYOR139C 393 nt13.84□□□□□ -0.19
SPE3Q12074 YJR018WYJR018W 363 nt13.83□□□□□ -0.2
SPE3Q12074 NPL3YDR432W 1245 nt13.82□□□□□ -0.2
SPE3Q12074 PTC2YER089C 1395 nt13.71□□□□□ -0.21
SPE3Q12074 BSC6YOL137W 1494 nt13.67□□□□□ -0.22
SPE3Q12074 BUD23YCR047C 828 nt13.67□□□□□ -0.22
SPE3Q12074 YGR021WYGR021W 873 nt13.67□□□□□ -0.22
SPE3Q12074 RPP2BYDR382W 333 nt13.64□□□□□ -0.23
SPE3Q12074 SRB2YHR041C 633 nt13.64□□□□□ -0.23
SPE3Q12074 WWM1YFL010C 636 nt13.61□□□□□ -0.23
SPE3Q12074 MNP1YGL068W 585 nt13.6□□□□□ -0.23
SPE3Q12074 NAB2YGL122C 1578 nt13.57□□□□□ -0.24
SPE3Q12074 HOM6YJR139C 1080 nt13.56□□□□□ -0.24
SPE3Q12074 YOL037CYOL037C 354 nt13.52□□□□□ -0.25
SPE3Q12074 YJR120WYJR120W 351 nt13.5□□□□□ -0.25
SPE3Q12074 RKM5YLR137W 1104 nt13.4□□□□□ -0.26
SPE3Q12074 INM2YDR287W 879 nt13.38□□□□□ -0.27
SPE3Q12074 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.38□□□□□ -0.27
SPE3Q12074 DAL1YIR027C 1383 nt13.37□□□□□ -0.27
SPE3Q12074 FPR4YLR449W 1179 nt13.35□□□□□ -0.27
SPE3Q12074 BDH2YAL061W 1254 nt13.33□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 FIS1YIL065C 468 nt13.31□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.3□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.3□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.3□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.3□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.3□□□□□ -0.28
SPE3Q12074 PHO4YFR034C 939 nt13.23□□□□□ -0.29
SPE3Q12074 YBL100CYBL100C 315 nt13.21□□□□□ -0.29
SPE3Q12074 LSM3YLR438C-A 270 nt13.2□□□□□ -0.3
SPE3Q12074 PUS2YGL063W 1113 nt13.18□□□□□ -0.3
SPE3Q12074 YLR281CYLR281C 468 nt13.12□□□□□ -0.31
SPE3Q12074 TRM9YML014W 840 nt13.08□□□□□ -0.32
SPE3Q12074 WHI5YOR083W 888 nt13.07□□□□□ -0.32
SPE3Q12074 FUN26YAL022C 1554 nt13.04□□□□□ -0.32
SPE3Q12074 YPS1YLR120C 1710 nt12.98□□□□□ -0.33
SPE3Q12074 SPT5YML010W 3192 nt12.96□□□□□ -0.33
SPE3Q12074 MOT3YMR070W 1473 nt12.95□□□□□ -0.34
SPE3Q12074 ALF1YNL148C 765 nt12.92□□□□□ -0.34
SPE3Q12074 YDR095CYDR095C 411 nt12.9□□□□□ -0.34
SPE3Q12074 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.88□□□□□ -0.35
SPE3Q12074 CCT6YDR188W 1641 nt12.88□□□□□ -0.35
SPE3Q12074 FMP45YDL222C 930 nt12.87□□□□□ -0.35
SPE3Q12074 DSK2YMR276W 1122 nt12.86□□□□□ -0.35
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