Protein–RNA interactions for Protein: Q04779

RCO1, Transcriptional regulatory protein RCO1, yeastyeast

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Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCO1Q04779 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.21■□□□□ 0.83
RCO1Q04779 NSR1YGR159C 1245 nt20.1■□□□□ 0.81
RCO1Q04779 NOP1YDL014W 984 nt19.71■□□□□ 0.75
RCO1Q04779 YKL036CYKL036C 393 nt18.26■□□□□ 0.51
RCO1Q04779 MDJ1YFL016C 1536 nt17.99■□□□□ 0.47
RCO1Q04779 Q0297Q0297 156 nt17.3■□□□□ 0.36
RCO1Q04779 SRX1YKL086W 384 nt17.23■□□□□ 0.35
RCO1Q04779 YJL027CYJL027C 417 nt17.03■□□□□ 0.32
RCO1Q04779 SCS3YGL126W 1143 nt16.64■□□□□ 0.25
RCO1Q04779 YCR051WYCR051W 669 nt16.29■□□□□ 0.2
RCO1Q04779 DBP2YNL112W 1641 nt15.86■□□□□ 0.13
RCO1Q04779 YOL085CYOL085C 342 nt15.8■□□□□ 0.12
RCO1Q04779 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.55■□□□□ 0.08
RCO1Q04779 RPP1BYDL130W 321 nt15.51■□□□□ 0.07
RCO1Q04779 PKP1YIL042C 1185 nt15.49■□□□□ 0.07
RCO1Q04779 CCC1YLR220W 969 nt15.35■□□□□ 0.05
RCO1Q04779 YBR190WYBR190W 312 nt15.35■□□□□ 0.05
RCO1Q04779 RTC3YHR087W 336 nt15.02■□□□□ -0
RCO1Q04779 ATS1YAL020C 1002 nt14.9□□□□□ -0.02
RCO1Q04779 SCJ1YMR214W 1134 nt14.9□□□□□ -0.02
RCO1Q04779 RVS167YDR388W 1449 nt14.86□□□□□ -0.03
RCO1Q04779 PET122YER153C 765 nt14.79□□□□□ -0.04
RCO1Q04779 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.71□□□□□ -0.05
RCO1Q04779 SCR1SCR1 522 nt14.66□□□□□ -0.06
RCO1Q04779 RRN5YLR141W 1092 nt14.35□□□□□ -0.11
RCO1Q04779 SHR5YOL110W 714 nt14.33□□□□□ -0.12
RCO1Q04779 YDJ1YNL064C 1230 nt14.27□□□□□ -0.13
RCO1Q04779 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.09□□□□□ -0.15
RCO1Q04779 RSB1YOR049C 1065 nt14.08□□□□□ -0.16
RCO1Q04779 PUT4YOR348C 1884 nt14.04□□□□□ -0.16
RCO1Q04779 URN1YPR152C 1398 nt14.01□□□□□ -0.17
RCO1Q04779 DEP1YAL013W 1218 nt13.99□□□□□ -0.17
RCO1Q04779 GAR1YHR089C 618 nt13.86□□□□□ -0.19
RCO1Q04779 OPI9YLR338W 858 nt13.83□□□□□ -0.2
RCO1Q04779 SSA3YBL075C 1950 nt13.82□□□□□ -0.2
RCO1Q04779 PST2YDR032C 597 nt13.79□□□□□ -0.2
RCO1Q04779 SAH1YER043C 1350 nt13.78□□□□□ -0.2
RCO1Q04779 ARE1YCR048W 1833 nt13.76□□□□□ -0.21
RCO1Q04779 RPN10YHR200W 807 nt13.75□□□□□ -0.21
RCO1Q04779 YNL208WYNL208W 600 nt13.73□□□□□ -0.21
RCO1Q04779 POA1YBR022W 534 nt13.6□□□□□ -0.23
RCO1Q04779 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.58□□□□□ -0.24
RCO1Q04779 PUN1YLR414C 792 nt13.42□□□□□ -0.26
RCO1Q04779 TIR1YER011W 765 nt13.41□□□□□ -0.26
RCO1Q04779 YJR018WYJR018W 363 nt13.36□□□□□ -0.27
RCO1Q04779 BSC6YOL137W 1494 nt13.32□□□□□ -0.28
RCO1Q04779 YKL097CYKL097C 411 nt13.29□□□□□ -0.28
RCO1Q04779 PTC2YER089C 1395 nt13.29□□□□□ -0.28
RCO1Q04779 SSA1YAL005C 1929 nt13.27□□□□□ -0.29
RCO1Q04779 BUD23YCR047C 828 nt13.26□□□□□ -0.29
RCO1Q04779 SHU1YHL006C 453 nt13.2□□□□□ -0.3
RCO1Q04779 YJR120WYJR120W 351 nt13.15□□□□□ -0.3
RCO1Q04779 NAB2YGL122C 1578 nt13.12□□□□□ -0.31
RCO1Q04779 SRB2YHR041C 633 nt13.05□□□□□ -0.32
RCO1Q04779 RPP2BYDR382W 333 nt13.03□□□□□ -0.32
RCO1Q04779 DAL1YIR027C 1383 nt12.94□□□□□ -0.34
RCO1Q04779 FIS1YIL065C 468 nt12.93□□□□□ -0.34
RCO1Q04779 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.91□□□□□ -0.34
RCO1Q04779 FPR4YLR449W 1179 nt12.91□□□□□ -0.34
RCO1Q04779 INM2YDR287W 879 nt12.88□□□□□ -0.35
RCO1Q04779 YGR021WYGR021W 873 nt12.84□□□□□ -0.35
RCO1Q04779 WWM1YFL010C 636 nt12.81□□□□□ -0.36
RCO1Q04779 PHO4YFR034C 939 nt12.81□□□□□ -0.36
RCO1Q04779 HOM6YJR139C 1080 nt12.78□□□□□ -0.36
RCO1Q04779 SPT5YML010W 3192 nt12.78□□□□□ -0.36
RCO1Q04779 BDH2YAL061W 1254 nt12.76□□□□□ -0.37
RCO1Q04779 YBL100CYBL100C 315 nt12.75□□□□□ -0.37
RCO1Q04779 YOR139CYOR139C 393 nt12.74□□□□□ -0.37
RCO1Q04779 MNP1YGL068W 585 nt12.69□□□□□ -0.38
RCO1Q04779 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.68□□□□□ -0.38
RCO1Q04779 Q0182Q0182 405 nt12.68□□□□□ -0.38
RCO1Q04779 NPL3YDR432W 1245 nt12.62□□□□□ -0.39
RCO1Q04779 LSM3YLR438C-A 270 nt12.61□□□□□ -0.39
RCO1Q04779 FUN26YAL022C 1554 nt12.6□□□□□ -0.39
RCO1Q04779 YPS1YLR120C 1710 nt12.6□□□□□ -0.39
RCO1Q04779 RKM5YLR137W 1104 nt12.59□□□□□ -0.39
RCO1Q04779 YOL037CYOL037C 354 nt12.58□□□□□ -0.4
RCO1Q04779 TRM9YML014W 840 nt12.54□□□□□ -0.4
RCO1Q04779 MEP2YNL142W 1500 nt12.52□□□□□ -0.41
RCO1Q04779 YDR095CYDR095C 411 nt12.5□□□□□ -0.41
RCO1Q04779 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.47□□□□□ -0.41
RCO1Q04779 SSA4YER103W 1929 nt12.46□□□□□ -0.42
RCO1Q04779 ALF1YNL148C 765 nt12.43□□□□□ -0.42
RCO1Q04779 CCT6YDR188W 1641 nt12.42□□□□□ -0.42
RCO1Q04779 DCW1YKL046C 1350 nt12.33□□□□□ -0.44
RCO1Q04779 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RCO1Q04779 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.32□□□□□ -0.44
RCO1Q04779 RPP2AYOL039W 321 nt12.27□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 SIS1YNL007C 1059 nt12.26□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 PTP1YDL230W 1008 nt12.25□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 YLR281CYLR281C 468 nt12.24□□□□□ -0.45
RCO1Q04779 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.22□□□□□ -0.45
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