RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544718.1

ULK1-207, Transcript of unc-51 like autophagy activating kinase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ULK1, Length 1,678 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1-207ENST00000544718 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.05■■■■■ 6.88
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ULK1-207ENST00000544718 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.82■■■■■ 5.41
ULK1-207ENST00000544718 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.13■■■■■ 5.29
ULK1-207ENST00000544718 ABCC9O60706 1549 aa47.73■■■■■ 5.23
ULK1-207ENST00000544718 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.58■■■■■ 5.21
ULK1-207ENST00000544718 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.47■■■■■ 5.19
ULK1-207ENST00000544718 NACADO15069 1562 aa47.21■■■■■ 5.15
ULK1-207ENST00000544718 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.03■■■■■ 5.12
ULK1-207ENST00000544718 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.78■■■■■ 5.08
ULK1-207ENST00000544718 SCRIBQ14160 1630 aa46.52■■■■■ 5.04
ULK1-207ENST00000544718 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.02■■■■■ 4.96
ULK1-207ENST00000544718 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.44■■■■■ 4.86
ULK1-207ENST00000544718 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
ULK1-207ENST00000544718 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.03■■■■■ 4.8
ULK1-207ENST00000544718 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.96■■■■■ 4.79
ULK1-207ENST00000544718 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.86■■■■■ 4.77
ULK1-207ENST00000544718 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.85■■■■■ 4.77
ULK1-207ENST00000544718 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.82■■■■■ 4.77
ULK1-207ENST00000544718 SMARCA4P51532 1647 aa44.69■■■■■ 4.74
ULK1-207ENST00000544718 WIZO95785 1651 aa44.5■■■■■ 4.71
ULK1-207ENST00000544718 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.23■■■■■ 4.67
ULK1-207ENST00000544718 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
ULK1-207ENST00000544718 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
ULK1-207ENST00000544718 SMARCA2P51531 1590 aa43.89■■■■■ 4.62
ULK1-207ENST00000544718 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.87■■■■■ 4.61
ULK1-207ENST00000544718 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.58■■■■■ 4.57
ULK1-207ENST00000544718 HMGXB3Q12766 1538 aa43.55■■■■■ 4.56
ULK1-207ENST00000544718 NCAPD3P42695 1498 aa43.51■■■■■ 4.56
ULK1-207ENST00000544718 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.51■■■■■ 4.56
ULK1-207ENST00000544718 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.38■■■■■ 4.54
ULK1-207ENST00000544718 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.35■■■■■ 4.53
ULK1-207ENST00000544718 ABCC8Q09428 1581 aa42.59■■■■■ 4.41
ULK1-207ENST00000544718 PRDM2Q13029 1718 aa42.58■■■■■ 4.41
ULK1-207ENST00000544718 CFTRP13569 1480 aa42.54■■■■■ 4.4
ULK1-207ENST00000544718 TRIM41Q8WV44 630 aa42.53■■■■■ 4.4
ULK1-207ENST00000544718 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.31■■■■■ 4.36
ULK1-207ENST00000544718 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.29■■■■■ 4.36
ULK1-207ENST00000544718 SYNJ1O43426 1573 aa42.23■■■■■ 4.35
ULK1-207ENST00000544718 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.12■■■■■ 4.33
ULK1-207ENST00000544718 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.1■■■■■ 4.33
ULK1-207ENST00000544718 TOP2BQ02880 1626 aa42.09■■■■■ 4.33
ULK1-207ENST00000544718 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.03■■■■■ 4.32
ULK1-207ENST00000544718 NESP48681 1621 aa41.95■■■■■ 4.31
ULK1-207ENST00000544718 CUX1P39880 1505 aa41.93■■■■■ 4.3
ULK1-207ENST00000544718 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.87■■■■■ 4.29
ULK1-207ENST00000544718 EEA1Q15075 1411 aa41.74■■■■■ 4.27
ULK1-207ENST00000544718 SOGA1O94964 1423 aa41.72■■■■■ 4.27
ULK1-207ENST00000544718 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
ULK1-207ENST00000544718 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.63■■■■■ 4.25
ULK1-207ENST00000544718 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.62■■■■■ 4.25
ULK1-207ENST00000544718 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
ULK1-207ENST00000544718 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.61■■■■■ 4.25
ULK1-207ENST00000544718 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.6■■■■■ 4.25
ULK1-207ENST00000544718 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.6■■■■■ 4.25
ULK1-207ENST00000544718 TOPBP1Q92547 1522 aa41.47■■■■■ 4.23
ULK1-207ENST00000544718 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.43■■■■■ 4.22
ULK1-207ENST00000544718 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
ULK1-207ENST00000544718 CSRNP3Q8WYN3 585 aa41.33■■■■■ 4.21
ULK1-207ENST00000544718 KIF21BO75037 1637 aa41.31■■■■■ 4.2
ULK1-207ENST00000544718 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.19
ULK1-207ENST00000544718 KIF27Q86VH2 1401 aa41.21■■■■■ 4.19
ULK1-207ENST00000544718 WDR97A6NE52 1622 aa41.17■■■■■ 4.18
ULK1-207ENST00000544718 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.16■■■■■ 4.18
ULK1-207ENST00000544718 GOLGA3Q08378 1498 aa41.13■■■■■ 4.17
ULK1-207ENST00000544718 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.12■■■■■ 4.17
ULK1-207ENST00000544718 CUX2O14529 1486 aa41.1■■■■■ 4.17
ULK1-207ENST00000544718 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.04■■■■■ 4.16
ULK1-207ENST00000544718 WDR62O43379 1518 aa41.04■■■■■ 4.16
ULK1-207ENST00000544718 PRXQ9BXM0 1461 aa41.02■■■■■ 4.16
ULK1-207ENST00000544718 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.01■■■■■ 4.16
ULK1-207ENST00000544718 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.97■■■■■ 4.15
ULK1-207ENST00000544718 EHMT2Q96KQ7 1210 aa40.96■■■■■ 4.15
ULK1-207ENST00000544718 TNIKQ9UKE5 1360 aa40.96■■■■■ 4.15
ULK1-207ENST00000544718 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
ULK1-207ENST00000544718 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa40.91■■■■■ 4.14
ULK1-207ENST00000544718 ERCC6Q03468 1493 aa40.9■■■■■ 4.14
ULK1-207ENST00000544718 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.89■■■■■ 4.14
ULK1-207ENST00000544718 IGF1RP08069 1367 aa40.83■■■■■ 4.13
ULK1-207ENST00000544718 CEP162Q5TB80 1403 aa40.73■■■■■ 4.11
ULK1-207ENST00000544718 CUL7Q14999 1698 aa40.72■■■■■ 4.11
ULK1-207ENST00000544718 UBTFP17480 764 aaKnown RBP40.68■■■■■ 4.1
ULK1-207ENST00000544718 IFT140Q96RY7 1462 aa40.64■■■■■ 4.1
ULK1-207ENST00000544718 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.62■■■■■ 4.09
ULK1-207ENST00000544718 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.59■■■■■ 4.09
ULK1-207ENST00000544718 PBRM1Q86U86 1689 aa40.59■■■■■ 4.09
ULK1-207ENST00000544718 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
ULK1-207ENST00000544718 CLIP1P30622 1438 aa40.4■■■■■ 4.06
ULK1-207ENST00000544718 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.39■■■■■ 4.06
ULK1-207ENST00000544718 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.38■■■■■ 4.05
ULK1-207ENST00000544718 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.35■■■■■ 4.056e-9■■■■■ 28.1
ULK1-207ENST00000544718 GRIN2BQ13224 1484 aa40.33■■■■■ 4.05
ULK1-207ENST00000544718 ADAMTS12P58397 1594 aa40.32■■■■■ 4.05
ULK1-207ENST00000544718 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa40.32■■■■■ 4.04
ULK1-207ENST00000544718 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.2■■■■■ 4.03
ULK1-207ENST00000544718 ARAP1Q96P48 1450 aa40.12■■■■■ 4.01
ULK1-207ENST00000544718 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.11■■■■■ 4.01
ULK1-207ENST00000544718 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa40.09■■■■■ 4.01
ULK1-207ENST00000544718 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.06■■■■■ 4
ULK1-207ENST00000544718 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.04■■■■■ 4
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