Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXQ1Q9C009 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
FOXQ1Q9C009 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
FOXQ1Q9C009 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
FOXQ1Q9C009 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FOXQ1Q9C009 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FOXQ1Q9C009 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FOXQ1Q9C009 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXQ1Q9C009 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXQ1Q9C009 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
FOXQ1Q9C009 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
FOXQ1Q9C009 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
FOXQ1Q9C009 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
FOXQ1Q9C009 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
FOXQ1Q9C009 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
FOXQ1Q9C009 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
FOXQ1Q9C009 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
FOXQ1Q9C009 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
FOXQ1Q9C009 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
FOXQ1Q9C009 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FOXQ1Q9C009 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
FOXQ1Q9C009 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
FOXQ1Q9C009 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FOXQ1Q9C009 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FOXQ1Q9C009 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FOXQ1Q9C009 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FOXQ1Q9C009 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FOXQ1Q9C009 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FOXQ1Q9C009 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
FOXQ1Q9C009 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
FOXQ1Q9C009 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
FOXQ1Q9C009 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FOXQ1Q9C009 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
FOXQ1Q9C009 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FOXQ1Q9C009 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
FOXQ1Q9C009 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
FOXQ1Q9C009 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
FOXQ1Q9C009 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
FOXQ1Q9C009 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FOXQ1Q9C009 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
FOXQ1Q9C009 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
FOXQ1Q9C009 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXQ1Q9C009 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXQ1Q9C009 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FOXQ1Q9C009 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXQ1Q9C009 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXQ1Q9C009 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXQ1Q9C009 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXQ1Q9C009 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXQ1Q9C009 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXQ1Q9C009 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FOXQ1Q9C009 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXQ1Q9C009 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXQ1Q9C009 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXQ1Q9C009 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXQ1Q9C009 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXQ1Q9C009 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXQ1Q9C009 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXQ1Q9C009 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FOXQ1Q9C009 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FOXQ1Q9C009 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXQ1Q9C009 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXQ1Q9C009 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXQ1Q9C009 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXQ1Q9C009 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXQ1Q9C009 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXQ1Q9C009 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXQ1Q9C009 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FOXQ1Q9C009 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FOXQ1Q9C009 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
FOXQ1Q9C009 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FOXQ1Q9C009 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FOXQ1Q9C009 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FOXQ1Q9C009 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FOXQ1Q9C009 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FOXQ1Q9C009 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FOXQ1Q9C009 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FOXQ1Q9C009 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXQ1Q9C009 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FOXQ1Q9C009 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FOXQ1Q9C009 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FOXQ1Q9C009 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXQ1Q9C009 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FOXQ1Q9C009 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXQ1Q9C009 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FOXQ1Q9C009 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
FOXQ1Q9C009 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXQ1Q9C009 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FOXQ1Q9C009 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
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