Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP8

PAPPA2, Pappalysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA2Q9BXP8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
PAPPA2Q9BXP8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC41.05■■■■■ 4.16
PAPPA2Q9BXP8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.09
PAPPA2Q9BXP8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PAPPA2Q9BXP8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PAPPA2Q9BXP8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
PAPPA2Q9BXP8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
PAPPA2Q9BXP8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
PAPPA2Q9BXP8 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
PAPPA2Q9BXP8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
PAPPA2Q9BXP8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
PAPPA2Q9BXP8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
PAPPA2Q9BXP8 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
PAPPA2Q9BXP8 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
PAPPA2Q9BXP8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
PAPPA2Q9BXP8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
PAPPA2Q9BXP8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
PAPPA2Q9BXP8 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PAPPA2Q9BXP8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PAPPA2Q9BXP8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
PAPPA2Q9BXP8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PAPPA2Q9BXP8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PAPPA2Q9BXP8 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PAPPA2Q9BXP8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PAPPA2Q9BXP8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PAPPA2Q9BXP8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PAPPA2Q9BXP8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PAPPA2Q9BXP8 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PAPPA2Q9BXP8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
PAPPA2Q9BXP8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PAPPA2Q9BXP8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PAPPA2Q9BXP8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PAPPA2Q9BXP8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PAPPA2Q9BXP8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PAPPA2Q9BXP8 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
PAPPA2Q9BXP8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PAPPA2Q9BXP8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PAPPA2Q9BXP8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
PAPPA2Q9BXP8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PAPPA2Q9BXP8 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
PAPPA2Q9BXP8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PAPPA2Q9BXP8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PAPPA2Q9BXP8 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PAPPA2Q9BXP8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
PAPPA2Q9BXP8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
PAPPA2Q9BXP8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
PAPPA2Q9BXP8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
PAPPA2Q9BXP8 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PAPPA2Q9BXP8 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
PAPPA2Q9BXP8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
PAPPA2Q9BXP8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
PAPPA2Q9BXP8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
PAPPA2Q9BXP8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PAPPA2Q9BXP8 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
PAPPA2Q9BXP8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
PAPPA2Q9BXP8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PAPPA2Q9BXP8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PAPPA2Q9BXP8 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PAPPA2Q9BXP8 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PAPPA2Q9BXP8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PAPPA2Q9BXP8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PAPPA2Q9BXP8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PAPPA2Q9BXP8 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PAPPA2Q9BXP8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PAPPA2Q9BXP8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PAPPA2Q9BXP8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PAPPA2Q9BXP8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PAPPA2Q9BXP8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PAPPA2Q9BXP8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
PAPPA2Q9BXP8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PAPPA2Q9BXP8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PAPPA2Q9BXP8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PAPPA2Q9BXP8 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PAPPA2Q9BXP8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PAPPA2Q9BXP8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PAPPA2Q9BXP8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PAPPA2Q9BXP8 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PAPPA2Q9BXP8 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PAPPA2Q9BXP8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PAPPA2Q9BXP8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
PAPPA2Q9BXP8 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
PAPPA2Q9BXP8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
PAPPA2Q9BXP8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PAPPA2Q9BXP8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PAPPA2Q9BXP8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PAPPA2Q9BXP8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PAPPA2Q9BXP8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
PAPPA2Q9BXP8 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms