Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CDC6Q99741 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CDC6Q99741 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CDC6Q99741 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CDC6Q99741 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDC6Q99741 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDC6Q99741 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDC6Q99741 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDC6Q99741 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CDC6Q99741 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
CDC6Q99741 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CDC6Q99741 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CDC6Q99741 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
CDC6Q99741 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CDC6Q99741 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CDC6Q99741 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CDC6Q99741 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CDC6Q99741 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CDC6Q99741 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CDC6Q99741 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CDC6Q99741 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC6Q99741 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
CDC6Q99741 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CDC6Q99741 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CDC6Q99741 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CDC6Q99741 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CDC6Q99741 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CDC6Q99741 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CDC6Q99741 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CDC6Q99741 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CDC6Q99741 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CDC6Q99741 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CDC6Q99741 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CDC6Q99741 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
CDC6Q99741 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CDC6Q99741 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CDC6Q99741 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CDC6Q99741 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CDC6Q99741 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CDC6Q99741 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CDC6Q99741 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDC6Q99741 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
CDC6Q99741 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CDC6Q99741 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDC6Q99741 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDC6Q99741 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDC6Q99741 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDC6Q99741 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDC6Q99741 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDC6Q99741 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDC6Q99741 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDC6Q99741 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDC6Q99741 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CDC6Q99741 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDC6Q99741 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CDC6Q99741 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CDC6Q99741 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CDC6Q99741 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CDC6Q99741 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CDC6Q99741 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CDC6Q99741 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CDC6Q99741 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CDC6Q99741 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CDC6Q99741 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CDC6Q99741 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CDC6Q99741 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CDC6Q99741 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CDC6Q99741 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CDC6Q99741 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CDC6Q99741 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CDC6Q99741 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CDC6Q99741 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC6Q99741 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CDC6Q99741 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CDC6Q99741 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CDC6Q99741 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC6Q99741 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC6Q99741 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CDC6Q99741 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CDC6Q99741 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CDC6Q99741 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CDC6Q99741 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CDC6Q99741 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CDC6Q99741 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CDC6Q99741 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CDC6Q99741 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CDC6Q99741 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CDC6Q99741 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CDC6Q99741 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CDC6Q99741 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC6Q99741 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC6Q99741 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CDC6Q99741 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CDC6Q99741 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDC6Q99741 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDC6Q99741 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CDC6Q99741 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC6Q99741 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC6Q99741 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CDC6Q99741 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms