Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SMG1Q96Q15 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMG1Q96Q15 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
SMG1Q96Q15 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SMG1Q96Q15 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMG1Q96Q15 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMG1Q96Q15 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SMG1Q96Q15 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMG1Q96Q15 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMG1Q96Q15 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SMG1Q96Q15 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SMG1Q96Q15 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SMG1Q96Q15 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SMG1Q96Q15 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SMG1Q96Q15 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SMG1Q96Q15 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SMG1Q96Q15 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SMG1Q96Q15 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SMG1Q96Q15 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SMG1Q96Q15 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMG1Q96Q15 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMG1Q96Q15 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SMG1Q96Q15 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMG1Q96Q15 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMG1Q96Q15 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMG1Q96Q15 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMG1Q96Q15 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMG1Q96Q15 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMG1Q96Q15 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SMG1Q96Q15 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMG1Q96Q15 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SMG1Q96Q15 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SMG1Q96Q15 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SMG1Q96Q15 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SMG1Q96Q15 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMG1Q96Q15 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SMG1Q96Q15 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG1Q96Q15 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG1Q96Q15 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG1Q96Q15 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SMG1Q96Q15 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SMG1Q96Q15 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SMG1Q96Q15 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SMG1Q96Q15 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SMG1Q96Q15 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SMG1Q96Q15 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMG1Q96Q15 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMG1Q96Q15 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMG1Q96Q15 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMG1Q96Q15 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SMG1Q96Q15 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMG1Q96Q15 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMG1Q96Q15 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMG1Q96Q15 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMG1Q96Q15 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMG1Q96Q15 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMG1Q96Q15 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMG1Q96Q15 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMG1Q96Q15 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMG1Q96Q15 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMG1Q96Q15 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMG1Q96Q15 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMG1Q96Q15 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMG1Q96Q15 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG1Q96Q15 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMG1Q96Q15 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMG1Q96Q15 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG1Q96Q15 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMG1Q96Q15 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMG1Q96Q15 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG1Q96Q15 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMG1Q96Q15 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMG1Q96Q15 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMG1Q96Q15 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMG1Q96Q15 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG1Q96Q15 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG1Q96Q15 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG1Q96Q15 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG1Q96Q15 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMG1Q96Q15 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMG1Q96Q15 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMG1Q96Q15 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMG1Q96Q15 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMG1Q96Q15 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMG1Q96Q15 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMG1Q96Q15 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMG1Q96Q15 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SMG1Q96Q15 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG1Q96Q15 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG1Q96Q15 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG1Q96Q15 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG1Q96Q15 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SMG1Q96Q15 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG1Q96Q15 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
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