Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
EDAQ92838 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.65■■■■□ 3.3
EDAQ92838 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
EDAQ92838 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
EDAQ92838 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
EDAQ92838 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
EDAQ92838 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
EDAQ92838 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
EDAQ92838 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
EDAQ92838 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
EDAQ92838 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
EDAQ92838 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
EDAQ92838 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
EDAQ92838 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
EDAQ92838 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
EDAQ92838 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
EDAQ92838 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
EDAQ92838 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
EDAQ92838 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
EDAQ92838 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EDAQ92838 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EDAQ92838 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EDAQ92838 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EDAQ92838 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
EDAQ92838 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
EDAQ92838 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
EDAQ92838 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
EDAQ92838 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
EDAQ92838 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
EDAQ92838 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
EDAQ92838 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
EDAQ92838 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EDAQ92838 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
EDAQ92838 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EDAQ92838 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
EDAQ92838 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
EDAQ92838 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
EDAQ92838 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EDAQ92838 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EDAQ92838 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EDAQ92838 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EDAQ92838 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
EDAQ92838 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EDAQ92838 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EDAQ92838 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EDAQ92838 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
EDAQ92838 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EDAQ92838 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
EDAQ92838 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
EDAQ92838 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EDAQ92838 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EDAQ92838 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EDAQ92838 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
EDAQ92838 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
EDAQ92838 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
EDAQ92838 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EDAQ92838 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
EDAQ92838 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EDAQ92838 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EDAQ92838 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EDAQ92838 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EDAQ92838 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
EDAQ92838 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EDAQ92838 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EDAQ92838 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EDAQ92838 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EDAQ92838 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
EDAQ92838 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EDAQ92838 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
EDAQ92838 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
EDAQ92838 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
EDAQ92838 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
EDAQ92838 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
EDAQ92838 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
EDAQ92838 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
EDAQ92838 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
EDAQ92838 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDAQ92838 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDAQ92838 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EDAQ92838 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
EDAQ92838 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDAQ92838 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
EDAQ92838 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDAQ92838 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDAQ92838 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
EDAQ92838 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EDAQ92838 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDAQ92838 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDAQ92838 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDAQ92838 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDAQ92838 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDAQ92838 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDAQ92838 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDAQ92838 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDAQ92838 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EDAQ92838 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EDAQ92838 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDAQ92838 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDAQ92838 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDAQ92838 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms