Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC42.22■■■■■ 4.35
GPC2Q8N158 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC42.2■■■■■ 4.35
GPC2Q8N158 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
GPC2Q8N158 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
GPC2Q8N158 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
GPC2Q8N158 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
GPC2Q8N158 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
GPC2Q8N158 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
GPC2Q8N158 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
GPC2Q8N158 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
GPC2Q8N158 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
GPC2Q8N158 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
GPC2Q8N158 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
GPC2Q8N158 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
GPC2Q8N158 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
GPC2Q8N158 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
GPC2Q8N158 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
GPC2Q8N158 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
GPC2Q8N158 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
GPC2Q8N158 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
GPC2Q8N158 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
GPC2Q8N158 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GPC2Q8N158 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
GPC2Q8N158 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
GPC2Q8N158 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.98■■■■□ 3.83
GPC2Q8N158 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
GPC2Q8N158 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
GPC2Q8N158 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
GPC2Q8N158 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
GPC2Q8N158 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
GPC2Q8N158 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
GPC2Q8N158 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GPC2Q8N158 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GPC2Q8N158 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GPC2Q8N158 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GPC2Q8N158 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
GPC2Q8N158 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
GPC2Q8N158 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
GPC2Q8N158 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
GPC2Q8N158 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
GPC2Q8N158 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
GPC2Q8N158 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
GPC2Q8N158 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
GPC2Q8N158 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
GPC2Q8N158 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
GPC2Q8N158 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GPC2Q8N158 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GPC2Q8N158 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPC2Q8N158 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPC2Q8N158 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GPC2Q8N158 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GPC2Q8N158 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GPC2Q8N158 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
GPC2Q8N158 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
GPC2Q8N158 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPC2Q8N158 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
GPC2Q8N158 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.08■■■■□ 3.53
GPC2Q8N158 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
GPC2Q8N158 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
GPC2Q8N158 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
GPC2Q8N158 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
GPC2Q8N158 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
GPC2Q8N158 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
GPC2Q8N158 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
GPC2Q8N158 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
GPC2Q8N158 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
GPC2Q8N158 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GPC2Q8N158 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
GPC2Q8N158 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
GPC2Q8N158 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
GPC2Q8N158 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
GPC2Q8N158 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
GPC2Q8N158 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
GPC2Q8N158 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GPC2Q8N158 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
GPC2Q8N158 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GPC2Q8N158 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
GPC2Q8N158 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
GPC2Q8N158 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
GPC2Q8N158 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
GPC2Q8N158 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
GPC2Q8N158 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPC2Q8N158 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
GPC2Q8N158 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
GPC2Q8N158 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
GPC2Q8N158 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
GPC2Q8N158 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
GPC2Q8N158 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
GPC2Q8N158 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
GPC2Q8N158 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
GPC2Q8N158 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
GPC2Q8N158 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
GPC2Q8N158 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
GPC2Q8N158 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms